Ingénieur d’Etude en Bioinformatique
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Cette offre est ouverte aux personnes disposant d’un titre leur reconnaissant la qualité de travailleur handicapé ou travailleuse handicapée.
L'unité
Développement, Adaptation, Vieillissement
Durée du contrat
24 mois
Rémuneration
entre 2 467 € et 3786 € brut mensuel selon expérience
Les Missions
Intégrée à une équipe de recherche, la personne recrutée aura pour mission principale de déterminer les perturbations post-transcriptionnelles induites par des mutations dans l’hélicase DDX6 dans les cellules humaines. Elle analysera des jeux de données RNAseq obtenus à partir d’ARN total et polysomal pour identifier les transcrits dérégulés au niveau stabilité et/ou traduction, déterminer les caractéristiques de ces ARN, et proposer les voies de régulation perturbées.
L'Activité
- Traitement et contrôle qualité des données RNA-seq
- Analyse différentielle et fonctionnelle
- Développement et optimisation de pipelines
- Comparaison avec des jeux de données publiés
- Interprétation biologique en lien avec les biologistes de l’équipe
Compétences
- Maîtrise des outils RNAseq : alignement, quantification, analyse différentielle, visualisation
- Maîtrise des outils d’analyse des isoformes d’ARN
- Expérience en analyse de transcriptome dans des modèles mammifères
- Expérience en analyse des isoformes dans des modèles mammifères
- Rigueur, autonomie, dynamisme, esprit d’initiative.
- Rédaction de rapports clairs, présentation des résultats à des non-bioinformaticiens
Votre Environnement de Travail
La personne recrutée exercera son activité dans l'équipe « mRNP et condensats » dirigée par Dominique Weil, au Laboratoire Développement, Adaptation et Vieillissement (UMR8263, unité mixte CNRS-Inserm-Sorbonne Université) à l'Institut de Biologie Paris Seine (IBPS). Ce laboratoire est situé sur le campus Pierre et Marie Curie de Sorbonne Université.
Le poste est financé par l’ANR dans le cadre d'un projet visant à comprendre le rôle de l’hélicase DDX6 et de condensats d’ARN et protéines (P-bodies) dans le neurodéveloppement. Des mutations de cette hélicase sont responsables d’une maladie neurodéveloppementale associée à un déficit de P-bodies. L’équipe travaille sur des modèles de cellules humaines dans lesquelles les mutations des patients ont été introduites. Composée de biologistes, elle comprend quatre chercheuses et enseignants-chercheurs, une ingénieure d’étude, un post-doctorant et une doctorante. La personne recrutée travaillera en collaboration étroite avec le post-doctorant et les chercheurs associés à cet axe de recherche.
Rémunération et avantages
Rémunération
entre 2 467 € et 3786 € brut mensuel selon expérience
Congés et RTT annuels
44 jours
Pratique et Indemnisation du TT
Pratique et indemnisation du TT
Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu’à 300€
Secteur d’activité Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type Ingenieur biologiste en analyse de donnees (H/F)
Expérience souhaitée 1 à 4 années
À propos du CNRS
Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d’associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement.
IT en contrat CDD 24 mois BAC+5 PARIS 05
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Ingénieur d'études
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Ingénieur d’Etude en Bioinformatique
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Ingénieur d’Etude en Bioinformatique
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Ingénieur d'études en techniques biologiques
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H/F Ingénieur d’études biologiste
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Paris, Ile-de-France Temps pleinIntitulé du poste : Ingénieur d'études en analyse des données NGS et reséquençage h/f Référence interne 21238 ufr Médecine RÉSUMÉ DU POSTE PROFIL RECHERCHÉ Connaissances Gérer les données en provenance des plateformes de séquençage. Veiller à la qualité, la reproductibilité et la traçabilité des analyses réalisées. Assurer le...
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Ingénieur de recherche en bio informatique
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Paris, Île-de-France le cnam Télétravail Temps pleinVos missions en quelques mots Faire avancer les projets de recherche en bioinformatique du Laboratoire sous la direction du Directeur du Laboratoire, et travailler en particulier sur le projet de transcriptomique Chikgene, projet ANR, obtenu par le Laboratoire. De manière générale, ces projets portent notamment sur l’analyse de données omics de...
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Ingénieur en ingénierie logicielle
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Paris, Île-de-France Inserm Télétravail Temps pleinVos missions en quelques mots Mission principale : Dans le cadre d’un projet européen (Joint Action JARDIN), Orphanet cherche à renforcer son équipe de développeurs en recrutant un développeur (H/F) ANGULAR pour enrichir ses outils et interfaces et gérer les données de la base de connaissance.La personne recrutée aura pour mission principale...
