Ingénieur d’Etude en Bioinformatique
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Vos missions en quelques mots
Missions :
Intégrée à une équipe de recherche, la personne recrutée aura pour mission principale de déterminer les perturbations post-transcriptionnelles induites par des mutations dans l’hélicase DDX6 dans les cellules humaines. Elle analysera des jeux de données RNAseq obtenus à partir d’ARN total et polysomal pour identifier les transcrits dérégulés au niveau stabilité et/ou traduction, déterminer les caractéristiques de ces ARN, et proposer les voies de régulation perturbées.
Activités :
- Traitement et contrôle qualité des données RNA-seq
- Analyse différentielle et fonctionnelle
- Développement et optimisation de pipelines
- Comparaison avec des jeux de données publiés
- Interprétation biologique en lien avec les biologistes de l’équipe
Contexte de travail :
La personne recrutée exercera son activité dans l'équipe « mRNP et condensats » dirigée par Dominique Weil, au Laboratoire Développement, Adaptation et Vieillissement (UMR8263, unité mixte CNRS-Inserm-Sorbonne Université) à l'Institut de Biologie Paris Seine (IBPS). Ce laboratoire est situé sur le campus Pierre et Marie Curie de Sorbonne Université.
Le poste est financé par l’ANR dans le cadre d'un projet visant à comprendre le rôle de l’hélicase DDX6 et de condensats d’ARN et protéines (P-bodies) dans le neurodéveloppement. Des mutations de cette hélicase sont responsables d’une maladie neurodéveloppementale associée à un déficit de P-bodies. L’équipe travaille sur des modèles de cellules humaines dans lesquelles les mutations des patients ont été introduites. Composée de biologistes, elle comprend quatre chercheuses et enseignants-chercheurs, une ingénieure d’étude, un post-doctorant et une doctorante. La personne recrutée travaillera en collaboration étroite avec le post-doctorant et les chercheurs associés à cet axe de recherche.
Profil recherché
Competences :
- Maîtrise des outils RNAseq : alignement, quantification, analyse différentielle, visualisation
- Maîtrise des outils d’analyse des isoformes d’ARN
- Expérience en analyse de transcriptome dans des modèles mammifères
- Expérience en analyse des isoformes dans des modèles mammifères
- Rigueur, autonomie, dynamisme, esprit d’initiative.
- Rédaction de rapports clairs, présentation des résultats à des non-bioinformaticiens
Contraintes et risques :
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
- Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)
Langues
- Français Seuil
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Ingénieur d’Etude en Bioinformatique
Il y a 20 heures
Paris, Île-de-France Choisir le Service Public Temps plein 2 467 € CDDInformations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UMR8263-DOMWEI-003 Date de début de diffusion ...
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Ingénieur d’Etude en Bioinformatique
Il y a 5 jours
Paris, Ile-de-France Temps pleinDescription du Poste Les Missions Intégrée à une équipe de recherche, la personne recrutée aura pour mission principale de déterminer les perturbations post-transcriptionnelles induites par des mutations dans l’hélicase DDX6 dans les cellules humaines. Elle analysera des jeux de données RNAseq obtenus à partir d’ARN total et polysomal pour...
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H/F Ingénieur d’études biologiste
Il y a 20 heures
Paris, Île-de-France CNRS Temps pleinVos missions en quelques mots Missions :L’ingénieur, en collaboration avec les chercheurs, développera et conduira de nouvelles approches de biologie cellulaire et moléculaire afin d'étudier la biologie des cellules souches du cerveau des mammifères. Nous étudierons les mécanismes impliqués dans le choix de développement des cellules souches...
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Ingénieur d'études en techniques biologiques
Il y a 20 heures
Paris, Île-de-France Inserm Temps pleinVos missions en quelques mots Les thématiques de recherche de notre groupe au sein de l’équipe GenoVASC (unité INSERM U1127, Paris Brain Institute) sont centrées sur l’exploration des mécanismes de plusieurs maladies génétiques humaines conduisant à la survenue d’accidents cérébraux chez l’enfant et chez l’adulte. Après...
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H/F Ingénieur d’études biologiste
Il y a 20 heures
Paris, Île-de-France Choisir le Service Public Temps plein 2 571 € CDDInformations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UMR8197-VALHER-254 Date de début de diffusion ...
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Ingénieur de recherche en bio informatique
Il y a 20 heures
Paris, Île-de-France le cnam Télétravail Temps pleinVos missions en quelques mots Faire avancer les projets de recherche en bioinformatique du Laboratoire sous la direction du Directeur du Laboratoire, et travailler en particulier sur le projet de transcriptomique Chikgene, projet ANR, obtenu par le Laboratoire. De manière générale, ces projets portent notamment sur l’analyse de données omics de...
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Ingénieur en ingénierie logicielle
Il y a 20 heures
Paris, Île-de-France Inserm Télétravail Temps pleinVos missions en quelques mots Mission principale : Dans le cadre d’un projet européen (Joint Action JARDIN), Orphanet cherche à renforcer son équipe de développeurs en recrutant un développeur (H/F) ANGULAR pour enrichir ses outils et interfaces et gérer les données de la base de connaissance.La personne recrutée aura pour mission principale...
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Paris, Île-de-France Fonction publique Territoriale Temps pleinVos missions en quelques mots Présentation du projet :Le projet ERXCUE, financé par l’ANR, vise à étudier comment les cellules s’adaptent – ouéchouent à s’adapter – au stress du réticulum endoplasmique (ER), en se concentrant sur leremaniement du métabolisme thiol-redox. L'objectif est d'identifier les processus redox quiinfluencent...
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Bioinformaticien(ne)
Il y a 20 heures
Paris, Ile de France Inovarion Temps pleinInovarion est un centre de Recherche et d'Innovation créé en 2013. À l'interface entre recherche fondamentale et développement industriel, Inovarion apporte son savoir-faire et son expertise aux grands acteurs publics et privés de la recherche biomédicale. Devenu en 13 ans un acteur central de la Recherche et du Développement en France, Inovarion a...
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Ingénieur.e de recherche en Neurodéveloppement, organoïdes
Il y a 20 heures
Paris, Île-de-France CNRS Temps pleinVos missions en quelques mots Missions :Le projet vise à étudier la progression des lignages et les mécanismes guidant la diversification neuronale au cours du développement du système nerveux humain.Le projet s’appuiera sur des modèles d’organoïdes développés par notre laboratoire ainsi que sur des tissus embryonnaires, associés à des...
