Post-doc de Modélisation de Processus Biologiques

Il y a 3 mois


Toulouse, France CNRS Temps plein

Cette offre est disponible dans les langues suivantes:

- Français
- Anglais

Date Limite Candidature : vendredi 27 septembre 2024 23:59:00 heure de Paris

**Informations générales**:
**Intitulé de l'offre **:Post-Doc de modélisation de processus biologiques H/F**
Référence : UMR5070-BEACOU-005
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : TOULOUSE
Date de publication : vendredi 6 septembre 2024
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 4 novembre 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Entre 2990 et 4200€ bruts mensuels selon expérience
Niveau d'études souhaité : Niveau 8 - (Doctorat)
Expérience souhaitée : Indifférent
Section(s) CN : Sciences de l'information : fondements de l'informatique, calculs, algorithmes, représentations, exploitations

**Missions**:
La personne recrutée aura pour mission de développer un modèle in silico de l’inflammation et proposer des stratégies de calibration basées sur l’utilisation d'apprentissage automatique.

**Activités**:

- Activités Principales:

- Concevoir et élaborer la structure du système d'information permettant de collecter, structurer, stocker et mettre en relation les données in silico et in vivo,
- Modéliser les processus de la réponse inflammatoire, proposer et développer des stratégies de calibration du modèle en utilisant des données biologiques,
- Proposer et co-développer des protocoles expérimentaux permettant la validation du modèle,
- Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques sous forme de rapports, brevets, publications et présentations orales,
- Assurer et organiser la veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité.

Activités associées:

- Mettre en forme et synthétiser ses résultats dans le but de les diffuser (grand public, journaux scientifiques, congrès, nationaux et internationaux),
- Garantir la qualité et la pertinence des outils d’analyse et des résultats,
- Coordonner et planifier les différentes phases du projet de recherche, participer à l’encadrement de stagiaires et à l’accompagnement méthodologique des différents projets de l’équipe.

**Compétences**:

- Connaissances approfondies en programmation informatique pour l’analyse de données (python) et en apprentissage automatique
- Connaissance en modélisation (en particulier modélisation basée agents)
- Des connaissances des processus biologiques seront fortement appréciées,
- Connaissance des règles d’hygiène et de sécurité,
- Esprit d’équipe, Rigueur, Esprit d’initiative, Autonomie.

**Contexte de travail**:
Dans ce projet, nous souhaitons modéliser in sillico la réponse inflammatoire et comprendre comment cette réponse est altérée avec l’âge, notamment au travers du rôle des cellules stromales mésenchymateuses (CSM). La nature de cette réponse inflammatoire conditionne l’issue de la réparation tissulaire et l’obtention ou non de la régénération tissulaire.
Nous avons pour cela développé un premier modèle informatique basé sur des agents (macrophages dans un environnement 2D) et modélisant leurs interactions. Ce modèle devra être complété afin de prendre en compte de nouveaux types cellulaires, en particulier les CSM et leurs interactions avec les autres cellules et l’environnement. La calibration temporelle et l’analyse de sensibilité des paramètres régissant ces interactions permettront d’identifier les paramètres clés responsables de la dysfonction de la réponse inflammatoire avec l’âge. Du fait de la complexité du modèle, nous proposons de développer une stratégie de calibration et d’analyse de sensibilité originale se basant sur l’utilisation de modèles de Machine Learning et de techniques d’explicabilité de dernière génération (en particulier les valeurs de SHAP). Les hypothèses issues de ce modèle seront ensuite validées in vivo. Ce travail, visant à générer un outil prédictif de la réponse inflammatoire, ouvrira la voie à de nouvelles approches thérapeutiques pour induire la régénération des tissus chez les mammifères adultes.

**Contraintes et risques**:
Activités de recherche sur 3 sites différents (Université Toulouse Capitole, Bâtiment INCERE site Langlade et département odontologie Rangueil)


  • Post-doc (H/F)

    il y a 2 semaines


    Toulouse, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : lundi 16 décembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Post-doc (H/F) échantillonnage naturel, analyse et création d'un modèle géochimique** Référence : UMR5563-ANABOR-003 Nombre de Postes : 1 Lieu...

  • Post-doc (H/F)

    Il y a 3 mois


    Toulouse, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mercredi 9 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Post-doc (H/F) Détection d'extrêmes climatiques avec le Deep Learning** Référence : UMR5318-CHRPAG-001 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail :...


  • Toulouse, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Post-doc (H/F) échantillonnage naturel, analyse et création d'un modèle géochimique Référence : UMR5563-ANABOR-003 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : TOULOUSE Date de publication : lundi 25 novembre 2024 Type de contrat : Chercheur en contrat CDD Durée du contrat : 12 mois Date d'embauche...

  • Post-doctorant en Biologie

    il y a 1 semaine


    Toulouse, France INSA TOULOUSE Temps plein

    **À propos de nous**: L’INSA Toulouse est une grande école d’ingénieurs publique, pluridisciplinaire et internationale, reconnue pour l’excellence de sa formation et de sa recherche. Sous tutelle du ministère de l’enseignement supérieur et de la recherche, c’est un Etablissement Public à Caractère Scientifique, Culturel et Professionnel,...


  • Toulouse, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mercredi 18 décembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Post-doctorat en modélisation mathématique et optimisation multi-objectif (H/F)** Référence : UMR5070-BEACOU-014 Nombre de Postes : 1 Lieu de...


  • Toulouse, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : vendredi 25 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Post-doc H/F sur projet ANR 3D-eMAGE, étude exhaustive d’organoïdes osseux humains** Référence : UMR5070-BEACOU-006 Nombre de Postes : 1 Lieu...


  • Toulouse, France Liebherr Group Temps plein

    Description du poste : Au sein du service Expertises Transverses, vous aurez en charge de réaliser des études et des simulations numériques du soudage par procédé TIG des échangeurs de chaleur. Ce travail sera réalisé en collaboration avec le Laboratoire de Mécanique et Génie Civil de Montpellier. Vous serez rattaché à l’équipe Assemblages...


  • Toulouse, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : vendredi 20 décembre 2024 00:00:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Poste postdoctoral en biologie moléculaire et structurale de la biogenèse membranaire (H/F)** Référence : UMR5100-RAFIEV-002 Nombre de Postes :...


  • Toulouse, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Poste postdoctoral en biologie moléculaire et structurale de la biogenèse membranaire (H/F) Référence : UMR5100-RAFIEV-002 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : TOULOUSE Date de publication : vendredi 15 novembre 2024 Type de contrat : CDD Scientifique Durée du contrat : 24 mois Date d'embauche...


  • Toulouse, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Poste postdoctoral en biologie moléculaire et structurale de la biogenèse membranaire (H/F) Référence : UMR5100-RAFIEV-002 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : TOULOUSE Date de publication : vendredi 15 novembre 2024 Type de contrat : Chercheur en contrat CDD Durée du contrat : 24 mois Date...

  • Chercheur Post-doc

    il y a 1 mois


    Toulouse, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mardi 19 novembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Chercheur Post-Doc [H/F] : Conception de fonctions visuelles pour la Robotique** Référence : UPR8001-PATDAN-009 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail...


  • Toulouse, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Présentation de l'offreUn poste postdoctoral est actuellement disponible au sein du Laboratoire de Microbiologie et de Génétique Moléculaire (LMGM) à Toulouse, rattaché au Centre de Biologie Intégrative (CBI). Cette opportunité est proposée par le Dr Raffaele Ieva.SalaireLe salaire pour ce poste est compris entre 2991€ et 4166€ brut par...


  • Toulouse, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mardi 22 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:H/F :Position post doctorale : Biologie cellulaire et moléculaire du parasite Plasmodium falciparum** Référence : UMR5089-DENGOM-002 Nombre de Postes...


  • Toulouse, Occitanie, France Fédération des acteurs de la solidarité Temps plein

    L'association REGAR recherche un professionnel expérimenté pour animer son jardin biologique à Auch.Le candidat idéal possèdera une solide formation en maraîchage biologique et expérience dans l'encadrement de salariés en insertion. Il devra veiller à la bonne réalisation de l'activité maraîchage, gérer la mise en culture, la production et la...


  • Toulouse, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Présentation du posteNous recherchons un spécialiste en biologie moléculaire et cellulaire postdoctoral pour rejoindre notre équipe au sein de l'UMR5077. Le candidat idéal possèdera une expertise dans les domaines de la biologie moléculaire, de la biologie cellulaire et de la chimie.SalaireLe salaire est compris entre 2991€ et 4166€ brut mensuel...


  • Toulouse, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : lundi 30 septembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Chercheur post-doctoral en modélisation de l’interaction arc électrique/Electrodes (H/F)** Référence : UMR5213-DELDAL-017 Nombre de Postes :...

  • Post-doctorant (H/F)

    Il y a 3 mois


    Toulouse, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mercredi 9 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Post-doctorant (H/F) - IMT (Toulouse) - Modélisation et assimilation de données pour le traitement des eaux usées** Référence :...


  • Toulouse, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Post-Doctorat (H/F) en Modélisation Théorique, Algorithmique et Physique Référence : UMR5070-BEACOU-011 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : TOULOUSE Date de publication : mardi 12 novembre 2024 Type de contrat : CDD Scientifique Durée du contrat : 12 mois Date d'embauche prévue : 14 décembre...


  • Toulouse, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Post-Doctorat (H/F) en Modélisation Théorique, Algorithmique et Physique Référence : UMR5070-BEACOU-011 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : TOULOUSE Date de publication : mardi 12 novembre 2024 Type de contrat : Chercheur en contrat CDD Durée du contrat : 12 mois Date d'embauche prévue : 14...


  • Toulouse, Occitanie, France Unilabs France Temps plein

    Présentation de l'Offre Vous intÃressà s par une carrière en biologie de la reproduction ? Vous cherchez un environnement de travail dynamique et innovant ? Nous recherchons un Spécialiste en Biologie de la Reproduction pour rejoindre notre èquipe de biologistes à Unilabs France. Missions Assurer la gestion du projet de...