Ingénieur de Recherche Bio-Informatique Virologie H/F

il y a 1 jour

Paris, France Institut Pasteur Temps plein

L'Institut Pasteur conduit des recherches biomédicales de pointe et avant-gardistes depuis plus de 130 ans. Sur notre campus de 5 hectares en plein Paris (15è arrondissement), dans un environnement multiculturel et stimulant, 3000 personnes collaborent pour répondre aux ambitions de l'Institut Pasteur. Le laboratoire de découverte de pathogènes a pour objectif principal de découvrir, caractériser et tester le rôle d' agents infectieux nouveaux ou inattendus dans des syndromes cliniques d'étiologie inconnue ou mal caractérisée, y compris de nouveaux agents zoonotiques. Nous recrutons pour cette équipe un(e) Ingénieur(e) de recherche Bioinformatique. CDD de 18 mois. Salaire entre 40 et 45 000€ bruts annuels avec une première expérience confirmée ; adaptation si besoin. MISSIONS Vous interviendrez dans des projets de séquençage du virome ayant pour objectifs de caractériser de nouveaux pathogènes humains, ou de nouveaux virus à potentiel zoonotique, et à identifier les facteurs qui contribuent à augmenter le risque de saut d'espèce. Vous travaillerez en relations avec le personnel « wetlab » bien que vos activités se focaliseront principalement sur l'analyse de données avec l'emploi de pipelines existants, et le développement de nouvelles méthodes informatiques et statistiques adaptées au haut-débit. Les attentes seront adaptées au profil de la personne recrutée, avec évolution des activités associée à la montée en compétence. A terme la personne recrutée aura pour objectifs à : -Optimisation, mise au point, et veille bibliographique sur les méthodes de séquencage pour améliorer la détection de pathogènes. -Veille bibliographique des outils informatiques d'analyse et évaluation de nouveaux outils et méthodes quand nécessaire -Optimisation de pipelines de traitement de larges jeux de données de séquençage de virome qui seront régulièrement utilisés par le laboratoire. Cela comprend des données de métagenomique clinique (humain) et de métatranscriptomique d'espèces réservoirs ou vecteurs (chauves souris, tiques, moustiques, parasites) - Participer à la mise au point et validation de nouveaux pipelines pour automatiser l'assemblage et l'annotation de génomes de virus nouvellement découverts. -Réaliser ou participer à l'exploitation des données en appliquant les méthodes statistiques les plus appropriées. -Supervision ou assistance des étudiants et post-doctorants en termes de séquençage et d'analyse de données de séquençage. -Diffusion des bonnes pratiques en bioinformatique au sein du laboratoire -Soutien à la collecte, la gestion et l'organisation des données au sein du laboratoire. -Participer à la conception de projets

  • Ingénieur de recherche Bio-informatique

    il y a 2 jours

    Paris, Île-de-France Institut Pasteur Temps plein

    Référence Date de début de diffusion /01/2026 Date de parution /01/2026 MétierAutres domaines Ingénierie de la recherche - Ingénieur de recherche Intitulé du posteIngénieur de recherche Bio-informatique (Virologie) H/F/X Missions/ActivitésL'Institut Pasteur conduit des recherches biomédicales de pointe et avant-gardistes depuis plus de 130...

  • Ingénieur Bio-Informatique H/F

    il y a 3 semaines

    Paris, France MICHAEL PAGE Temps plein

    Notre client est une société est un prestataire de services spécialisés dans le contrôle qualité de produits pharmaceutiques biologiques, issue d'un institut de recherche de renommée internationale. Elle propose aux entreprises biotechnologiques un service complet allant de la réception des échantillons jusqu'à la délivrance des certificats...

  • Ingénieur Bio-Informatique H/F

    il y a 3 semaines

    Paris, France MICHAEL PAGE Temps plein

    Notre client est une société est un prestataire de services spécialisés dans le contrôle qualité de produits pharmaceutiques biologiques, issue d'un institut de recherche de renommée internationale. Elle propose aux entreprises biotechnologiques un service complet allant de la réception des échantillons jusqu'à la délivrance des certificats...

  • Ingénieur Développement Logiciel Bio-informatique h/f

    il y a 7 jours

    Paris, Île-de-France PathoQuest Temps plein

    PathoQuest est une société spécialisée de prestation de service (CRO), spin-out de l'Institut Pasteur, qui propose des solutions innovantes pour le Contrôle Qualité des produits pharmaceutiques d'origine biologique. PathoQuest propose aux Biotech innovantes du monde entier un service expert complet de la réception des échantillons à la production...

  • Stagiaire - Département Bio-informatique (H/F)

    il y a 3 jours

    Paris 13e, France PathoQuest SAS Temps plein

    Stagiaire - Département Bio-informatique H/F PathoQuest est une société spécialisée de prestation de service (CRO), spin off de l’Institut Pasteur, qui propose des solutions innovantes pour le Contrôle Qualité des produits pharmaceutiques d’origine biologique. PathoQuest propose aux Biotech innovantes du monde entier un service expert complet de...

  • Technicien de Laboratoire dans le Département des Agents Infectieux Unité de Virologie H/F

    il y a 6 jours

    Paris, France AP-HP Temps plein

    MétierTechnicien de laboratoireType de contratTitulaire ou CDDService d'affectationLaboratoire de VirologiePrésentation du service PRESENTATION DU DEPARTEMENT DES AGENTS INFECTIEUX Le Département des Agents Infectieux est composé de 4 UF: - 4 sur le site de Saint-Louis: 1 Virologie - 1 Bactériologie et 1 Parasitologie/Mycologie. - 1 sur le site de...

  • Technicien de laboratoire dans le département des agents infectieux, unité de Virologie F/H

    il y a 1 semaine

    Paris 10 Entrepôt, Île-de-France Ap-Hp Temps plein

    Informations générales Entité de rattachement du publieur Situé à Paris (10è arrondissement), l'hôpital Saint-Louis est reconnu au plan national et international en hématologie, dermatologie, cancérologie, infectiologie ainsi que dans le domaine des greffes d'organe et de moelle osseuse. Il possède également une expertise de haut niveau en...

  • Responsable magasin circuit court bio

    il y a 2 semaines

    Paris, Île-de-France Magasin Bio Temps plein

    CONCEPT : MAGASIN BIO, FRUITS ET LÉGUMES ET DIRECT PRODUCTEURS à ParisÀ propos de l'entreprise :Réseau indépendant et engagé de magasins bio, ancrés dans une démarche zéro déchet et en lien direct avec les producteurs français. Notre enseigne s'installe désormais dans le 13ème et le 5ème arrondissement de paris, pour proposer une nouvelle...

  • Responsable du pôle de bio-informatique F/H

    il y a 5 jours

    Paris, Île-de-France Sorbonne Université Temps plein

    Informations générales Organisme de rattachement Choisir Sorbonne Université, c'est rejoindre une université engagée sur les enjeux de développement durable, de diversité, d'égalité, d'innovation, de diffusion des savoirs, d'ouverture sur le monde et de qualité de vie au travail de ses personnels.Université pluridisciplinaire de recherche...

  • Technicien de Laboratoire Médical Virologie H/F

    il y a 2 semaines

    Paris, France AP-HP Temps plein

    COMPOSITION DE L'EQUIPE L'équipe médicaleest composée de: 1 Chef de Département, 1 Chef de service, 3 PH, 4 MCU-PH, 4 Praticiens Attachés, 1 AHU, 3 internes en biologie. L'équipe paramédicale est composée de: 1 cadre 27 techniciens de laboratoire 1 secrétaire L'unité L'unité de virologie est organisée en 3 secteurs : 1 secteur préanalytique...