Ingénieur-e d’études en biochimie et microbiologie

Vous rejoindrez l’unité de Recherche INRAE BIOlogie et GEstion des champignons phytopathogènes BIOGER (site web: https://bioger.versailles-saclay.hub.inrae.fr/) , composante de l’Université Paris-Saclay, qui étudie les champignons pathogènes des plantes de grandes cultures (blé, colza) et de la vigne. Elle est localisée sur le campus AgroParisTech de Palaiseau (91) et regroupe 45 agents permanents (et une vingtaine de non-permanents) répartis dans cinq équipes de recherche, trois plateaux techniques (IMAFUN (IMAging plant-FUNgal and cytology) , Production végétale et Bio-informatique/bioanalyse) et des «Services communs» (gestion-accueil, milieux-laverie) . Vous intégrerez l'équipe GAIA (Gestion et Anticipation Intégrées de l'Adaptation des pathogènes fongiques) composée de 2 chercheurs, 3 ingénieurs, 1 technicien ainsi que plusieurs étudiants et CDD (https://bioger.versailles-saclay.hub.inrae.fr/equipes-et-plateaux/gaia-gestion-et-anticipation-integrees-de-l-adaptation-des-champignons-phytopathogenes) .

Dans le cadre du projet ANR CONIDIA (https://anr.fr/Projet-ANR-25-CE35-2024) , vous contribuerez à l’étude de nouveaux mécanismes impliqués dans la résistance des champignons phytopathogènes aux fongicides. Vos travaux porteront sur le champignon Zymoseptoria tritici et combineront des approches de biologie moléculaire, de biochimie, de génétique et d’analyse des données issues de plateformes spécialisées. Votre activité contribuera à mieux comprendre les mécanismes de résistance aux fongicides et les fonctions biologiques des protéines impliquées dans ces mécanismes. Vous travaillerez en interaction avec les différents membres du projet, sous la supervision de l’ingénieure de recherche responsable du projet ANR, ainsi qu’avec des plateformes d’analyse dans un environnement scientifique pluridisciplinaire.

Dans ce cadre, vous serez en charge les activités suivantes:

1. Biologie moléculaire et microbiologie

• concevoir des amorces et réaliser des PCR et des clonages ;
• transformer des bactéries et champignons ;
• extraire l’ADN pour envoi aux plateformes de séquençage ;
• cultiver Z. tritici et assurer leur mise en collection ;
• générer des mutants de gènes candidats et réaliser des tests de résistance aux fongicides ;
• préparer les échantillons pour les analyses ChIP-seq, RNA-seq et Co-Immunoprécipitation.

2. Analyse, suivi et valorisation des résultats

• interpréter et rendre compte des analyses réalisées sur les plateformes ;
• collecter les résultats, les mettre en forme et en rendre compte ;
• assurer la traçabilité des analyses en coordination avec les scientifiques du projet;
• participer à la rédaction et mise en forme des résultats en vu de leur publication ;
• former des membres de l’équipe (stagiaires et étudiants) aux techniques utilisées ;
• participer aux réunions d’équipe, d’unité (lorsque pertinent et/ou nécessaire) et du projet ANR.
• missions transversales (suivi des stocks de consommables) .

Profil recherché

Formation et compétences attendues:

Vous êtes titulaire d’un Master ou d’un diplôme d'ingénieur dans le domaine de la biochimie ou toute formation apportant des compétences similaires. Une expérience en microbiologie fongique et biologie moléculaire serait un plus.

Savoir-faire:

• Maitriser les principales techniques de biologie moléculaire et de biochimie, notamment ChIP-seq, Co-IP
• Préparer et conserver des échantillons biologiques
• Utiliser les outils informatiques nécessaires au traitement des données.
• Adapter les techniques d’analyse aux besoins expérimentaux.
• Appliquer les règles d'hygiène et de sécurité liées à la manipulation des produits toxiques, des produits contaminants et des OGM.
• Rendre compte des résultats et transmettre ses connaissances.

Savoir-etre:

• Rigueur, fiabilité et soin.
• Grand sens de l'organisation, capacité d'adaptation.
• Excellent sens relationnel et capacité d'interaction avec plusieurs interlocuteurs.
• Gout pour le travail en équipe et les environnements multidisciplinaires.
• Curiosité et ouverture d’esprit.

La maitrise de l’anglais au niveau B1 est attendue ; Permis B est fortement souhaité.

Présentation de Institut National de Recherche Po