Ingénieur bioinformaticien en déploiement d'applications sur des ressources haute performance et en intelligence artificielle
il y a 4 semaines
L'Institut Français de Bioinformatique (IFB) recrute un ingénieur bioinformaticien pour mettre en place des ressources bioinformatiques utiles pour appliquer le calcul à haute performance (HPC) et l'intelligence artificielle (AI) aux données de biologie.
Compétences requises- Maîtrise des formats de données en Bioinformatique
- Maîtrise des environnements Linux et des langages (shell, python, R)
- Maîtrise des outils de gestion de versions des codes source déploiement continu (git, GitLab, GitLab CI/CD)
- Connaissance des techniques de conteneurisation (apptainer/singularity, docker, podman)
- Compréhension de l'anglais oral et écrit : B1 à B2 (cadre européen commun de référence pour les langues)
- Analyser les besoins et piloter le déploiement des logiciels et pipelines bioinformatiques du projet sur les ressources de calcul HPC/AI
- Organiser et superviser l'intégration des données du projet avec un plan de gestion (PGD)
- Définir et mettre à niveau les documentations techniques et fonctionnelles
- Assurer l'assistance aux partenaires du projet
- Organiser les réunions du projet
Le projet Mutualized Digital Spaces for FAIR Life and Health Sciences (MUDIS4LS, PIA3 ESR/Equipex+) finance l'équipement de l'ensemble du réseau national de ressources computationnelles (NNCR) de l'IFB, et des développements innovants pour faciliter la gestion des données, et l'appui aux communautés des sciences du vivant (microbiologie, santé, agronomie, environnement).
L'IFB recrute un ingénieur bioinformaticien en déploiement d'applications sur des ressources haute performance et en intelligence artificielle pour mettre en place des ressources bioinformatiques utiles pour appliquer le calcul à haute performance (HPC) et l'intelligence artificielle (AI) aux données de biologie.
La plateforme de bioinformatique de l'Institut Curie est composée de 20 bioinformaticiens, biostatisticiens et ingénieurs logiciels, qui offrent une expertise multidisciplinaire et apportent un support aux plateformes biotechnologiques de CurieCoreTech, ainsi qu'aux unités de recherche et à hôpital dans leurs activités quotidiennes.
La personne recrutée sera formée à son arrivée aux outils et techniques mis en œuvre au sein d'une infrastructure de calcul scientifique.
Elle s'intégrera dans son équipe d'accueil, et participera, sur site et en télétravail, aux groupes de travail de l'IFB pertinents pour sa mission.
Le travail nécessitera des déplacements occasionnels en France et à l'étranger pour participer à des réunions, des formations ou des événements.
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