Ingénieur bioinformaticien en déploiement d'applications sur des ressources haute performance et en intelligence artificielle

il y a 4 semaines


Paris, Île-de-France CNRS Temps plein
Ingénieur bioinformaticien en déploiement d'applications sur des ressources haute performance et en intelligence artificielle

L'Institut Français de Bioinformatique (IFB) recrute un ingénieur bioinformaticien pour mettre en place des ressources bioinformatiques utiles pour appliquer le calcul à haute performance (HPC) et l'intelligence artificielle (AI) aux données de biologie.

Compétences requises
  • Maîtrise des formats de données en Bioinformatique
  • Maîtrise des environnements Linux et des langages (shell, python, R)
  • Maîtrise des outils de gestion de versions des codes source déploiement continu (git, GitLab, GitLab CI/CD)
  • Connaissance des techniques de conteneurisation (apptainer/singularity, docker, podman)
  • Compréhension de l'anglais oral et écrit : B1 à B2 (cadre européen commun de référence pour les langues)
Responsabilités
  • Analyser les besoins et piloter le déploiement des logiciels et pipelines bioinformatiques du projet sur les ressources de calcul HPC/AI
  • Organiser et superviser l'intégration des données du projet avec un plan de gestion (PGD)
  • Définir et mettre à niveau les documentations techniques et fonctionnelles
  • Assurer l'assistance aux partenaires du projet
  • Organiser les réunions du projet
Contexte

Le projet Mutualized Digital Spaces for FAIR Life and Health Sciences (MUDIS4LS, PIA3 ESR/Equipex+) finance l'équipement de l'ensemble du réseau national de ressources computationnelles (NNCR) de l'IFB, et des développements innovants pour faciliter la gestion des données, et l'appui aux communautés des sciences du vivant (microbiologie, santé, agronomie, environnement).

L'IFB recrute un ingénieur bioinformaticien en déploiement d'applications sur des ressources haute performance et en intelligence artificielle pour mettre en place des ressources bioinformatiques utiles pour appliquer le calcul à haute performance (HPC) et l'intelligence artificielle (AI) aux données de biologie.



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