Ingénieur bioinformaticien en déploiement d'applications haute performance

il y a 3 semaines


Paris, Île-de-France CNRS Temps plein
Développez vos compétences en bioinformatique

Nous recherchons un ingénieur bioinformaticien pour rejoindre notre équipe de développement d'applications haute performance et d'intelligence artificielle. Vous serez chargé de mettre en place des ressources bioinformatiques utiles pour appliquer le calcul à haute performance et l'intelligence artificielle aux données de biologie.

Responsabilités
  • Analyser les besoins et piloter le déploiement des logiciels et pipelines bioinformatiques du projet sur les ressources de calcul HPC/AI.
  • Organiser et superviser l'intégration des données du projet avec un plan de gestion (PGD).
  • Définir et mettre à niveau les documentations techniques et fonctionnelles.
  • Assurer l'assistance aux partenaires du projet.
  • Organiser les réunions du projet.
Compétences requises
  • Maîtrise générale des outils logiciels standards en Bioinformatique.
  • Maîtrise des formats de données en Bioinformatique.
  • Maîtrise des environnements Linux et des langages (shell, python, R).
  • Maîtrise des outils de gestion de versions des codes source déploiement continu (git, GitLab, GitLab CI/CD).
  • Connaissance des techniques de conteneurisation (apptainer/singularity, docker, podman).
  • Compréhension de l'anglais oral et écrit : B1 à B2 (cadre européen commun de référence pour les langues).
  • Capacité à travailler en mode projet et en équipe.
  • Capacité à travailler en réseau, avec les outils numériques modernes (messagerie instantanée, visioconférence).
À propos de l'IFB

L'Institut Français de Bioinformatique (IFB) est une infrastructure nationale qui regroupe 35 plateformes et équipes de recherche en bioinformatique, et une unité coordinatrice, IFB-Core (UAR 3601). L'IFB déploie sur l'ensemble du territoire national des services en bioinformatique: infrastructure de calcul, logiciels et bases de données, analyse des données biologiques, gestion des données, formations.



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