Chercheur post-doctoral dans le cadre du projet ANR IDENTHIC
il y a 3 semaines
Informations générales
Titre de l'offre : Chercheur post-doctoral dans le cadre du projet ANR IDENTHIC
Référence : UMR5149-NATCOL-020
Nombre de postes : 1
Lieu de travail : Montpellier
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 24 mois
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : A partir de 3021 euros brut par mois selon expérience professionnelle
Niveau d'études souhaité : Niveau 8 - (Doctorat)
Expérience souhaitée : Indifférent
Section(s) CN : Mathématiques et interactions des mathématiques
Missions
Le chercheur postdoctoral sera chargé de développer une approche statistique pour identifier la composition clonale de la tumeur à partir des données de séquençage ciblé. Ce projet est mené dans le cadre du projet ANR Identhic, qui vise à reconstruire l'histoire évolutive des tumeurs à partir de données de séquençage partielles. Le candidat travaillera en étroite collaboration avec les membres du projet et les étudiants en master et doctorat travaillant sur des aspects complémentaires du projet.
Activités
Familiarisation avec les données, mise en forme des données, création d'une annotation des échantillons obtenus sur les patients.
- Développement de méthode de déconvolution permettant l'inférence de la composition clonale de l'échantillon à partir de données de séquençage en observation totale.
- Benchmarking de la méthode
- Extension au cas du séquençage en observation partielle à l'aide de priors bio-informés, développement de méthodes d'imputation pour les données manquantes dans ce contexte
- Implémentation des méthodes au travers d'algorithmes efficaces
- Présentation et discussion des résultats avec les membres du consortium.
- Rédaction d'articles scientifiques pour la diffusion des résultats à la communauté scientifique
- Participation à des workshops et conférences internationales
Compétences
Doctorat en biostatistiques ou bioinformatique
Goût pour la programmation, en particulier maîtrise de R ou python
Manipulation antérieure d'au moins un type de données de séquençage
Contexte de travail
Le chercheur postdoctoral travaillera à l'IMAG, au sein de l'équipe EPS sous la supervision d'Alice Cleynen et Sophie Lèbre. Le projet est mené dans le cadre du projet ANR Identhic, qui vise à reconstruire l'histoire évolutive des tumeurs à partir de données de séquençage partielles. Le candidat travaillera en étroite collaboration avec les membres du projet et les étudiants en master et doctorat travaillant sur des aspects complémentaires du projet.
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Chercheur post-doctoral dans le cadre du projet ANR IDENTHIC
il y a 4 semaines
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Chercheur post-doctoral dans le cadre du projet ANR IDENTHIC
il y a 3 semaines
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Chercheur postdoctoral dans le cadre du projet ANR IDENTHIC
il y a 4 semaines
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Chercheur post-doctoral dans le cadre du projet ANR IDENTHIC
il y a 4 semaines
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Chercheur post-doctoral dans le cadre du projet ANR Deep Pep
il y a 4 semaines
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Chercheur post-doctoral dans le cadre du projet ANR Deep Pep
il y a 4 semaines
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Chercheur postdoctoral en biostatistiques
il y a 1 semaine
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Chercheur post-doctoral dans le cadre du projet ANR Deep Pep
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Chercheur post-doctoral en écologie spatiale des oiseaux marins
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Chercheur en palynologie H/F
il y a 1 mois
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Chercheur post-doctoral en écologie spatiale des oiseaux marins
il y a 4 semaines
Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps pleinInformations généralesTitre de l'offre : Chercheur post-doctoral en écologie spatiale des oiseaux marins (H/F) Référence : UMR5175-DAVGRE-007 Nombre de postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Type de contrat : CDD Scientifique Durée du contrat : 22 mois Date d'embauche prévue : 1 janvier 2025 Quotité de travail : Temps complet Rémunération : A...
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Doctorat en humanités environnementales
il y a 3 semaines
Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps pleinOffre de doctorat en humanités environnementalesLe CNRS recherche un(e) doctorant(e) pour rejoindre son équipe de recherche dans le cadre du projet CityFish. Ce projet vise à explorer l'aquaculture en milieu urbain, en se concentrant sur le cas de l'aquaculture périurbaine à Hanoï, au Viêt Nam.Contexte du projetLa production aquacole est un secteur en...
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Chercheur(e) H/F en Recherche Virologique et Microscopie
il y a 9 heures
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Chercheur en biologie moléculaire
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Chercheur post-doctoral en écologie spatiale des oiseaux marins
il y a 3 semaines
Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps pleinInformations généralesLe Centre d'Écologie Fonctionnelle & Évolutive (CEFE) recherche un chercheur postdoctoral pour rejoindre son équipe de recherche en écologie spatiale des oiseaux marins. Ce poste est lié au programme MIGRATLANE, qui vise à collecter des données et caractériser les flux migratoires, les comportements et altitudes en vol des...
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Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps pleinOffre de rechercheNous recherchons un chercheur post-doctorant pour rejoindre notre équipe de recherche en biologie cellulaire des virus. Le candidat idéal possèdera une expertise en virologie et biologie cellulaire, ainsi que des compétences en culture de cellules souches, microscopie et neurobiologie.MissionsLe chercheur post-doctorant sera chargé de...