Chercheur post-doctoral dans le cadre du projet ANR IDENTHIC

il y a 3 semaines


Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

Informations générales

Titre de l'offre : Chercheur post-doctoral dans le cadre du projet ANR IDENTHIC
Référence : UMR5149-NATCOL-020
Nombre de postes : 1
Lieu de travail : Montpellier
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 24 mois
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : A partir de 3021 euros brut par mois selon expérience professionnelle
Niveau d'études souhaité : Niveau 8 - (Doctorat)
Expérience souhaitée : Indifférent
Section(s) CN : Mathématiques et interactions des mathématiques

Missions

Le chercheur postdoctoral sera chargé de développer une approche statistique pour identifier la composition clonale de la tumeur à partir des données de séquençage ciblé. Ce projet est mené dans le cadre du projet ANR Identhic, qui vise à reconstruire l'histoire évolutive des tumeurs à partir de données de séquençage partielles. Le candidat travaillera en étroite collaboration avec les membres du projet et les étudiants en master et doctorat travaillant sur des aspects complémentaires du projet.

Activités

Familiarisation avec les données, mise en forme des données, création d'une annotation des échantillons obtenus sur les patients.
- Développement de méthode de déconvolution permettant l'inférence de la composition clonale de l'échantillon à partir de données de séquençage en observation totale.
- Benchmarking de la méthode
- Extension au cas du séquençage en observation partielle à l'aide de priors bio-informés, développement de méthodes d'imputation pour les données manquantes dans ce contexte
- Implémentation des méthodes au travers d'algorithmes efficaces
- Présentation et discussion des résultats avec les membres du consortium.
- Rédaction d'articles scientifiques pour la diffusion des résultats à la communauté scientifique
- Participation à des workshops et conférences internationales

Compétences

Doctorat en biostatistiques ou bioinformatique
Goût pour la programmation, en particulier maîtrise de R ou python
Manipulation antérieure d'au moins un type de données de séquençage

Contexte de travail

Le chercheur postdoctoral travaillera à l'IMAG, au sein de l'équipe EPS sous la supervision d'Alice Cleynen et Sophie Lèbre. Le projet est mené dans le cadre du projet ANR Identhic, qui vise à reconstruire l'histoire évolutive des tumeurs à partir de données de séquençage partielles. Le candidat travaillera en étroite collaboration avec les membres du projet et les étudiants en master et doctorat travaillant sur des aspects complémentaires du projet.



  • Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Informations généralesTitre de l'offre : Chercheur post-doctoral dans le cadre du projet ANR IDENTHICRéférence : UMR5149-NATCOL-020Nombre de postes : 1Lieu de travail : MontpellierDate de publication : Non spécifiéType de contrat : CDD ScientifiqueDurée du contrat : 24 moisDate d'embauche prévue : Non spécifiéQuotité de travail : Temps...


  • Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Offre de posteTitre de l'offre : Chercheur post-doctoral dans le cadre du projet ANR IDENTHICRéférence : UMR5149-NATCOL-020Nombre de postes : 1Lieu de travail : MONTPELLIERDate de publication : vendredi 4 octobre 2024Type de contrat : CDD ScientifiqueDurée du contrat : 24 moisDate d'embauche prévue : 2 décembre 2024Quotité de travail : Temps...


  • Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Informations généralesIntitulé de l'offre : Chercheur post-doctoral dans le cadre du projet ANR IDENTHICRéférence : UMR5149-NATCOL-020Nombre de Postes : 1Lieu de travail : MontpellierType de contrat : CDD ScientifiqueDurée du contrat : 24 moisQuotité de travail : Temps completRémunération : A partir de 3021 euros brut par mois selon expérience...


  • Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Informations généralesTitre de l'offre : Chercheur postdoctoral dans le cadre du projet ANR IDENTHICRéférence : UMR5149-NATCOL-020Nombre de postes : 1Lieu de travail : MontpellierType de contrat : CDD scientifiqueDurée du contrat : 24 moisQuotité de travail : Temps completRémunération : A partir de 3021 euros brut par mois selon expérience...


  • Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Informations généralesIntitulé de l'offre : Chercheur post-doctoral dans le cadre du projet ANR IDENTHICRéférence : UMR5149-NATCOL-020Nombre de Postes : 1Lieu de travail : MONTPELLIERType de contrat : CDD ScientifiqueDurée du contrat : 24 moisQuotité de travail : Temps completRémunération : A partir de 3021 euros brut par mois selon expérience...


  • Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Offre de posteL'Institut national de recherche en informatique et en automatique (INRIA) recherche un chercheur post-doctoral pour rejoindre l'équipe du projet ANR Deep Pep. Le candidat sélectionné travaillera en étroite collaboration avec l'équipe EPS de l'IMAG et les partenaires du projet ANR Deep Pep.MissionsLe chercheur post-doctoral...


  • Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Informations généralesTitre de l'offre : Chercheur post-doctoral dans le cadre du projet ANR Deep PepRéférence : UMR5149-NATCOL-019Nombre de postes : 1Lieu de travail : MONTPELLIERDate de publication : Type de contrat : CDD ScientifiqueDurée du contrat : 24 moisDate d'embauche prévue : Quotité de travail : Temps completRémunération : A partir de...


  • Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Offre de poste : Chercheur postdoctoralL'IMAG, au sein de l'équipe EPS, est membre du CNRS. Nous recherchons un chercheur postdoctoral pour participer au projet ANR IDENTHIC.MissionsIdentifier la composition clonale d'une tumeur à partir de données de séquençage ciblé.Contribuer au développement d'approches statistiques pour l'analyse de données de...


  • Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    MissionL'objectif principal de ce poste est de développer un modèle d'apprentissage profond capable de prédire des peptides synthétiques capables d'interagir avec une protéine cible donnée. Ces peptides naturels et synthétiques seront ensuite appliqués aux plantes afin d'enregistrer leurs effets sur les réponses développementales et...


  • Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Description du posteLe/la candidat(e) recherché(e) pour ce poste de chercheur post-doctoral est chargé(e) de participer à l'équipe de recherche de l'Institut de Génétique Humaine à Montpellier, France. Le/la candidat(e) sera en charge de concevoir, de réaliser et d'analyser des expériences pour comprendre le rôle de la boucle...


  • Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Offre de recherche scientifiqueL'Institut national de recherche en informatique et en automatique (CNRS) recherche un chercheur post-doctoral pour rejoindre l'équipe de recherche sur l'identification de tumeurs.MissionsLe chercheur post-doctoral sera chargé de développer et d'implémenter des méthodes statistiques pour identifier les...


  • Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Offre de poste Nous recherchons un chercheur post-doctoral pour rejoindre notre équipe au Centre d'Écologie Fonctionnelle & Évolutive (CEFE) et travailler sur le projet MIGRATLANE. Missions Le chercheur post-doctoral travaillera en étroite collaboration avec des partenaires scientifiques pour étudier les migrations en mer et les fonctionnalités des...

  • Chercheur en palynologie H/F

    il y a 4 semaines


    Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Présentation du poste Nous recherchons un chercheur en palynologie pour rejoindre notre équipe à l'Institut de Sciences de l'Evolution à Montpellier. Le candidat idéal aura une expertise en palynologie des environnements méditerranéens et une bonne connaissance des microfossiles non-polliniques (MNP) et des reconstructions de feux. Missions Le...


  • Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Offre de posteTitre de l'offre : Chercheur en palynologie H/FRéférence : UMR5554-JERROS-002Nombre de postes : 1Lieu de travail : MontpellierType de contrat : CDD ScientifiqueDurée du contrat : 12 moisDate d'embauche prévue : 11 décembre 2024Quotité de travail : Temps completRémunération : à partir de 3021.50€ brut mensuel ajustable selon...


  • Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Informations généralesTitre de l'offre : Chercheur post-doctoral en écologie spatiale des oiseaux marins (H/F) Référence : UMR5175-DAVGRE-007 Nombre de postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Type de contrat : CDD Scientifique Durée du contrat : 22 mois Date d'embauche prévue : 1 janvier 2025 Quotité de travail : Temps complet Rémunération : A...


  • Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Offre de doctorat en humanités environnementalesLe CNRS recherche un(e) doctorant(e) pour rejoindre son équipe de recherche dans le cadre du projet CityFish. Ce projet vise à explorer l'aquaculture en milieu urbain, en se concentrant sur le cas de l'aquaculture périurbaine à Hanoï, au Viêt Nam.Contexte du projetLa production aquacole est un secteur en...


  • Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Présentation de l'offreL'Institut national de la recherche scientifique (CNRS) recrute un chercheur postdoctoral pour rejoindre son équipe à Montpellier.Le poste se situe dans le domaine de la recherche virologique et microscopie, avec une focus sur l'assemblage du virus SARS-CoV-2.Compétences requisesBiologie moléculaireCulture...


  • Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Informations généralesTitre de l'offre : Chercheur en biologie moléculaireRéférence : UMR5535-SARADE-064Nombre de postes : 1Lieu de travail : MontpellierDate de publication : 18 octobre 2024Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoralDurée du contrat : 36 moisDate de début de la thèse : 1 janvier 2025Quotité de travail : Temps...


  • Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Informations généralesLe Centre d'Écologie Fonctionnelle & Évolutive (CEFE) recherche un chercheur postdoctoral pour rejoindre son équipe de recherche en écologie spatiale des oiseaux marins. Ce poste est lié au programme MIGRATLANE, qui vise à collecter des données et caractériser les flux migratoires, les comportements et altitudes en vol des...


  • Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Offre de rechercheNous recherchons un chercheur post-doctorant pour rejoindre notre équipe de recherche en biologie cellulaire des virus. Le candidat idéal possèdera une expertise en virologie et biologie cellulaire, ainsi que des compétences en culture de cellules souches, microscopie et neurobiologie.MissionsLe chercheur post-doctorant sera chargé de...