Emplois actuels liés à Ingénieur de recherche en bioinformatique - Villeurbanne, Auvergne-Rhône-Alpes - P&H Hönes GmbH

  • Ingénieur de recherche en bioinformatique

    il y a 4 semaines

    Villeurbanne, Auvergne-Rhône-Alpes, France P&H Hönes GmbH Temps plein

    Mission principaleL'ingénieur de recherche en bioinformatique sera chargé de consolider le prototype de lac de données du projet Virome@tlas en collaboration étroite avec le consortium. La personne recrutée développera des chaînes de traitement bioinformatique reproductibles pour l'extraction, la transformation et le chargement des données au sein du...

  • Ingénieur de recherche en bioinformatique

    il y a 3 semaines

    Villeurbanne, Auvergne-Rhône-Alpes, France P&H Hönes GmbH Temps plein

    Mission principaleL'ingénieur de recherche en bioinformatique sera chargé de consolider le prototype de lac de données du projet Virome@tlas en collaboration étroite avec le consortium. La personne recrutée développera des chaînes de traitement bioinformatique reproductibles pour l'extraction, la transformation et le chargement des données au sein du...

  • Ingénieur de recherche en bioinformatique

    il y a 3 semaines

    Villeurbanne, Auvergne-Rhône-Alpes, France P&H Hönes GmbH Temps plein

    Mission principaleL'ingénieur de recherche en bioinformatique sera chargé de consolider le prototype de lac de données du projet Virome@tlas en collaboration étroite avec le consortium. Il développera des chaînes de traitement bioinformatique reproductibles pour l'extraction, la transformation et le chargement des données au sein du système à partir...

  • Développeur de pipelines bioinformatiques en génomique évolutive

    il y a 2 semaines

    Villeurbanne, Auvergne-Rhône-Alpes, France CNRS Temps plein

    Présentation de l'offreL'Université Claude Bernard – Lyon 1, en partenariat avec le CNRS, recherche un(e) post-doctorant(e) pour rejoindre l'équipe Génétique et Évolution des Interactions (GEI) au Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive (LBBE). Le post-doctorat est financé dans le cadre du projet ANR Longevity, qui vise à comprendre les...

  • Ingénieur Recherche

    il y a 1 mois

    Villeurbanne, Auvergne-Rhône-Alpes, France SuperGrid Institute Temps plein

    MissionSuperGrid Institute, un acteur clé de la transition énergétique en France et en Europe, recherche un Ingénieur Recherche pour rejoindre son équipe « Widespread AC/DC ».L'objectif principal de ce poste est de développer des outils de planification des réseaux électriques hybrides AC/DC, permettant des études technico-économiques statiques...

  • Ingénieur Recherche

    il y a 3 semaines

    Villeurbanne, Auvergne-Rhône-Alpes, France SuperGrid Institute Temps plein

    MissionSuperGrid Institute, un acteur clé de la transition énergétique en France et en Europe, recherche un Ingénieur Recherche pour rejoindre son équipe « Widespread AC/DC ».L'objectif principal de ce poste est de développer des outils de planification des réseaux électriques hybrides AC/DC, permettant des études technico-économiques statiques...

  • Ingénieur Recherche

    il y a 4 semaines

    Villeurbanne, Auvergne-Rhône-Alpes, France SuperGrid Institute Temps plein

    MissionSuperGrid Institute, un acteur clé de la transition énergétique en France et en Europe, recherche un Ingénieur Recherche pour rejoindre son équipe « Widespread AC/DC ».L'objectif principal de ce poste est de développer des outils de planification des réseaux électriques hybrides AC/DC, permettant des études technico-économiques statiques...

  • Ingénieur Recherche

    il y a 4 semaines

    Villeurbanne, Auvergne-Rhône-Alpes, France SuperGrid Institute Temps plein

    MissionSuperGrid Institute, un acteur clé de la transition énergétique en France et en Europe, recherche un Ingénieur Recherche pour rejoindre son équipe « Widespread AC/DC ».L'objectif principal de ce poste est de développer des outils de planification des réseaux électriques hybrides AC/DC, permettant des études technico-économiques statiques...

  • Ingénieur en Recherche et Développement

    il y a 1 semaine

    Villeurbanne, Auvergne-Rhône-Alpes, France SuperGrid Institute Temps plein

    SuperGrid Institute recherche un Ingénieur en Recherche et Développement pour rejoindre son équipe de spécialistes de la transition énergétique.Mission : Participer au développement de nouvelles technologies appliquées aux appareils haute tension en DC et AC, en collaboration avec les monteurs, les dessinateurs et les ingénieurs de...

  • Ingénieur de recherche robotique

    il y a 3 semaines

    Villeurbanne, Auvergne-Rhône-Alpes, France Groupe Cesi Temps plein

    Ingénieur de recherche robotiqueNous sommes à la recherche d'un ingénieur de recherche robotique pour rejoindre notre équipe de recherche et d'innovation.Missions :Participer aux activités de recherche et d'innovation au sein de notre laboratoire CESI LINEACT.Développer des activités de valorisation et de transfert technologique des résultats de la...

  • Ingénieur de Recherche Robotique

    il y a 3 semaines

    Villeurbanne, Auvergne-Rhône-Alpes, France Groupe Cesi Temps plein

    Ingénieur de Recherche RobotiqueCe poste est ouvert dans le cadre du développement de nos activités de recherche et d'innovation. Vous serez chargé de transférer les résultats de nos travaux de recherche dans des dispositifs pédagogiques en lien avec le Programme Grande École.MissionsDévelopper des activités de valorisation et de transfert...

  • Ingénieur Recherche

    il y a 4 semaines

    Villeurbanne, Auvergne-Rhône-Alpes, France SuperGrid Institute Temps plein

    MissionSuperGrid Institute, un acteur clé de la transition énergétique en France et en Europe, recherche un Ingénieur Recherche pour rejoindre son équipe « Widespread AC/DC ».Vous serez chargé de développer des outils de planification des réseaux électriques hybrides AC/DC, en collaboration avec des équipes internationales.ProfilNous recherchons...

  • Ingénieur de recherche en développement logiciel

    il y a 3 semaines

    Villeurbanne, Auvergne-Rhône-Alpes, France CNRS Temps plein

    Offre de poste : Ingénieur de recherche (H/F) pour la plateforme DGtalLe laboratoire LIRIS (UMR 5205 CNRS) recherche un ingénieur de recherche pour rejoindre son équipe-projet Shapes et travailler en collaboration avec les autres membres du consortium de l'ANR StableProxies.MissionsL'ingénieur de recherche sera chargé de s'intégrer au sein du...

  • Ingénieur en Recherche et Développement

    il y a 2 semaines

    Villeurbanne, Auvergne-Rhône-Alpes, France SuperGrid Institute Temps plein

    MissionDans le cadre du programme Appareillage dédié au développement de nouvelles technologies appliquées aux appareils haute tension en DC et AC, nous recrutons un Ingénieur en Recherche et Développement.Vous évoluerez au sein d'une équipe jeune et dynamique composée de monteurs, de dessinateurs et d'ingénieurs de recherche et participerez aux...

  • Ingénieur de recherche en développement logiciel

    il y a 4 semaines

    Villeurbanne, Auvergne-Rhône-Alpes, France CNRS Temps plein

    Offre de poste : Ingénieur de rechercheContexteLe laboratoire LIRIS (UMR 5205 CNRS) recherche un ingénieur de recherche pour rejoindre son équipe-projet Shapes et contribuer au développement logiciel de la plateforme DGtal dans le cadre de l'ANR StableProxies.MissionsL'ingénieur de recherche sera chargé de développer des algorithmes géométriques...

  • Ingénieur en Recherche et Développement

    il y a 1 mois

    Villeurbanne, Auvergne-Rhône-Alpes, France SuperGrid Institute Temps plein

    MissionL'Institut SuperGrid recherche un Ingénieur en Recherche et Développement pour rejoindre son équipe dynamique. Vous serez chargé de la conception et du développement de nouvelles technologies appliquées aux appareils haute tension en DC et AC.Vous travaillerez en étroite collaboration avec les ingénieurs et les monteurs pour concevoir et...

  • Ingénieur en Recherche et Développement

    il y a 3 semaines

    Villeurbanne, Auvergne-Rhône-Alpes, France SuperGrid Institute Temps plein

    MissionL'Institut SuperGrid recherche un Ingénieur en Recherche et Développement pour rejoindre son équipe dynamique. Vous serez chargé de la conception et de l'essai d'appareillage électrique innovant.Vous travaillerez en étroite collaboration avec les ingénieurs et les doctorants pour concevoir des circuits d'essais et mettre en...

  • Ingénieur de Recherche Robotique

    il y a 4 semaines

    Villeurbanne, Auvergne-Rhône-Alpes, France Groupe Cesi Temps plein

    Ingénieur de Recherche RobotiqueCe poste est ouvert dans le cadre du développement de nos activités de recherche et d'innovation.MissionsDévelopper des activités de valorisation et de transfert technologique des résultats de la recherche vers la pédagogie ou vers les acteurs de l'écosystème industriels.Concevoir et développer de nouveaux...

  • Ingénieur en informatique pour la recherche scientifique

    il y a 3 semaines

    Villeurbanne, Auvergne-Rhône-Alpes, France CNRS Temps plein

    Offre d'emploi : Ingénieur en informatique pour la recherche scientifiqueL'équipe-projet Shapes du laboratoire LIRIS (UMR 5205 CNRS) recherche un ingénieur en informatique pour participer à la recherche scientifique dans le cadre de l'ANR StableProxies.Le candidat sera intégré au sein de l'équipe-projet Shapes et travaillera en...

  • Ingénieur en Recherche et Développement

    Il y a 2 mois

    Villeurbanne, Auvergne-Rhône-Alpes, France SuperGrid Institute Temps plein

    {"h1": "Mission de Recherche et Développement au SuperGrid Institute", "p": "Nous sommes à la recherche d'un ingénieur en recherche et développement pour rejoindre notre équipe dynamique au SuperGrid Institute. Vous serez chargé de la conception et du développement d'appareillage électrique innovant pour les futurs réseaux de transport d'énergie.",...

Ingénieur de recherche en bioinformatique

Il y a 2 mois

Villeurbanne, Auvergne-Rhône-Alpes, France P&H Hönes GmbH Temps plein
Mission principale

L'ingénieur de recherche en bioinformatique sera chargé de consolider le prototype de lac de données du projet en collaboration étroite avec le consortium. Il développera des chaînes de traitement bioinformatique reproductibles pour l'extraction, la transformation et le chargement des données au sein du système à partir des métadonnées SRA du NCBI et des données d'assignation taxonomique déjà produites par l'algorithme SRA-STAT.

Activités principales
  • Participer au développement de l'infrastructure cloud du projet (openstack, docker, singularity, notebook jupyter).
  • Développer des procédures en python pour l'extraction, la transformation, le chargement des données dans l'infrastructure.
  • Développer des notebook jupyter pour faciliter l'exploration de la diversité virale à partir des données SRA et SRA-STAT.
  • Assurer la mise à jour du lac de données.
  • Gérer la formation des membres du consortium et des étudiants.
  • Participer à l'encadrement des étudiants impliqués dans le projet.
  • Gérer l'animation de Hackathon pour l'utilisation de l'infrastructure.
  • Résoudre ou faire remonter les incidents et optimiser les performances.
  • Rédiger et mettre à niveau les documentations techniques et fonctionnelles.
  • Effectuer une veille technologique.
  • Contribuer à l'assistance aux partenaires du projet.
Compétences attendues
  • Maîtrise des environnements Linux et des langages système (shell/bash).
  • Maîtrise des outils de gestion de versions des codes source (git, gitlab).
  • Maitrise des techniques Cloud et virtualisation (OpenStack, Docker, Kubernetes ou OpenShift).
  • Maitrise souhaitable des outils de gestion de pipelines en Bioinformatique (Nextflow, Snakemake).
  • Maitrise souhaitable des outils d'analyse statistiques multivariées sous R ou python.
  • Compétence (appréciable) dans l'utilisation des outils de machine learning sous R ou python.
  • Compréhension de l'anglais oral et écrit.
  • Connaissance générale des procédures de sécurité informatique.
Connaissances
  • Connaissance des méthodes bioinformatiques d'assignation taxonomique.
  • Connaissance des protocoles et des méthodes de séquençage en métagénomique.
  • Connaissance des formats de données de métagénomique.
  • Connaissances des bases de données en bioinformatique.
  • Connaissance (appréciable) en microbiologie / virologie moléculaire.
Savoir être
  • Capacité à travailler en mode projet avec une équipe pluridisciplinaire.
  • Réactivité, autonomie, initiative, rigueur.
  • Sens de l'organisation.
  • Esprit d'équipe et sens de la collaboration.
  • Capacité à travailler en réseau, avec les outils numériques modernes.