Stage M2 Approche Multi-bioessais Pour Le

Introduction du stage à pourvoir et de sa position dans l'organigramme

Au sein du Département Océanographie et Dynamique des Ecosystèmes et de l'Unité COAST, le stage se déroulera à l’Ifremer Port-en-Bessin-Huppain sous la responsabilité hiérarchique du Responsable du Laboratoire Environnement et Ressources de Normandie (LER/N). L’Unité COAST apporte son expertise aux services de l’Etat dans le cadre du GEODE (Groupe d’Etude et d’Observation sur le Dragage et l’Environnement), afin de mettre en œuvre une gestion optimisée des accès maritimes intégrant les enjeux environnementaux, techniques et économiques.

Missions principales

Les sédiments sont une composante importante de la biodiversité des écosystèmes aquatiques, jouant un rôle essentiel dans les réseaux trophiques. Cette matrice est aussi considérée comme un réservoir de la contamination chimique, qu’elle soit historique ou émergente, qui peut être remobilisée au cours du temps par des phénomènes naturels (_e.g._ crue, érosion) ou anthropiques (_e.g._ dragages, travaux en mer ou sur la zone littorale). Dans les estuaires comme dans les zones portuaires, les sédiments sont imprégnés à divers degrés d’un mélange de polluants provenant du ou des bassins versants en amont, et/ou liés aux activités anthropiques locales. Ces remobilisations sédimentaires peuvent entraîner une dégradation de la qualité des milieux aquatiques, impacter les communautés biologiques et compromettre les services écosystémiques fournis par ces milieux récepteurs.

Ce stage s’inscrit dans le cadre du projet ECONOR (Diagnostic de l’écotoxicité de sédiments littoraux de Normandie). Ce dernier vise à tester l’efficacité d’une approche écotoxique (bioessais _in vivo_ normés ISO) complémentaire aux analyses chimiques réalisées. Le diagnostic sera effectué sur des sédiments issus de différentes zones d’études des eaux littorales normandes et de sédiments portuaires, intégrant les campagnes de surveillance de l’estuaire de la Seine (AESN), de la Manche orientale _via_ le réseau d’observation des contaminations chimiques du littoral (campagne ROCCHSED 2025), du réseau national de surveillance de la qualité des eaux et des sédiments des ports maritimes (REPOM) ou encore de diagnostics de pré-dragages portuaires.

S’appuyant sur les travaux du groupe d’étude et d’observation sur le dragage et l’environnement (GEODE) et du projet d’amélioration de la méthodologie de diagnostic du risque chimique et écotoxique des sédiments portuaires dragués (ECOSED 2022-2024), un protocole gradué d’évaluation de l’écotoxicité de sédiments portuaires a été établi. Comme recommandé, la batterie de bioessais proposée permet d’évaluer la qualité des sédiments à travers différentes matrices, sur des espèces marines de différents niveaux trophiques et ciblant plusieurs paramètres biologiques (essai d’inhibition de la bioluminescence de bactéries marines, essai d'inhibition de la croissance des algues marines et test de toxicité létale aiguë pour les copépodes) 1,2. Ce protocole étant encore cours de validation, les résultats du projet ECONOR permettront d’évaluer sa faisabilité, de l’éprouver, de définir la sensibilité des différents bioessais selon les sites étudiés et seront confrontés aux valeurs seuils existantes dans la littérature pour le diagnostic de l’écotoxicité des sédiments de dragage portuaire.

Activités principales

Le/la stagiaire réalisera des bioessais sur la phase solide (bactéries uniquement) et liquide (élutriat) du sédiment. Cela implique sa participation aux échantillonnages (littoral, estran), à la préparation des élutriats et au maintien de l’élevage.

Un point particulier sera donné à évaluer la pertinence de l’intégration de l’essai sur copépodes et ce spécifiquement sur l’espèce _Tisbe battagliai_ (espère benthique encore peu proposée), vis-à-vis des autres bioessais testés (bactéries et microalgues).

Le/la stagiaire devra également mettre en regard et interpréter les données issues du/des bioessais (analyses statistiques et modélisation) vis-à-vis des analyses chimiques et de la littérature.

Méthodologie:

- Synthèse de la littérature axée sur l’essai sur les copépodes (cycle de vie et bioessais)
- Maintien de l’élevage de _Tisbe battagliai_, optimisation et validation du bioessai
- Echantillonnage et réalisation des bioessais
- Analyses statistiques et modélisation dose-réponse (EC 50)
- Interprétation des résultats, évaluation de la pertinence de ce bioessais et rédaction du rapport

Champ relationnel
- En interne : laboratoire de l’Unité Contamination Chimique des Ecosystèmes Marins (CCEM), cellule d’Analyse du Risque Chimique (ARC).
- En externe : Université de CAEN (AlgoBank, UMR MERSEA, CREC), INERIS (Institut national de l’environnement industriel et d