Stage Master 2

La Manche est un secteur à forte influence halieutique, principalement pour les pays riverains, mais également plus largement pour les pays de l'Europe du Nord. L'impact écologique et économique de l'exploitation des ressources halieutiques doit être évalué afin que la pêche reste une activité durable, dans un contexte caractérisé par des urgences liées au climat et la biodiversité. Pour répondre à ce besoin, les États membres de l'Union Européenne effectuent des campagnes scientifiques en mer pour évaluer l'abondance et la distribution des stocks, indépendamment des données issues des pêches commerciales. Dans ce contexte, la campagne CGFS (Channel Ground Fish Survey) s'intègre dans le programme européen de suivi des ressources halieutiques, permettant d'obtenir un ensemble de données relatives aux stocks exploités (maturité, structure en taille/âge, indices d'abondance).

Les séries temporelles sont utilisées chaque année par les groupes européens d'évaluation des stocks afin de fournir des avis de gestion pour les stocks partagés et d'évaluer l'état de l'écosystème. Initialement établie en Manche Est, la CGFS vise désormais à couvrir toute la Manche pour fournir des données indépendantes des pêcheries dans la zone Ouest également. En Manche Est (zone 7d), les données issues de ces campagnes sont utilisées chaque année par les groupes de travail internationaux du CIEM, notamment le WGNSSK (Working Group on the Assessment of Demersal Stocks in the North Sea and Skagerrak) et le WGCEPH (Working Group on Cephalopod Fisheries and Life History). En Manche Ouest (zone 7e), la CGFS collecte des données depuis 2018 afin de fournir, pour 2023, les informations nécessaires pour l'évaluation des céphalopodes, poissons (bar, églefin, morue, merlan) et élasmobranches par les groupes de travail CIEM (WGCEPH, Working Group on Cephalopod Fisheries and Life History ; WGCSE, Working Group for the Celtic Seas Ecoregion ; WGEF, Working Group on Elasmobranch Fishes).

**Travail attendu**

L’objectif du stage est de décrire la structure des communautés de Manche Ouest à travers une analyse spatio-temporelle des données de la campagne CGFS. Cette étude se basera sur des méthodes géostatistiques qui prennent en compte l’auto-corrélation spatiale, l’inclusion des co-variables ainsi que l’estimation des champs spatiaux latents en utilisant des outils comme R-INLA ou SDMTmb. L’intérêt de ces approches de modélisation est de proposer des indices plus robustes à la variabilité de l’effort et/ou du plan d’échantillonnage.

Cette travail permettra de:

- Explorer la nouvelle base de données CGFS Manche Ouest.
- Améliorer la compréhension de la dynamique spatiale et temporelle des poissons de la Manche Ouest
- Faire une première évaluation de la stratégie d’échantillonnage
- Proposer un indice d’abondance (model-based index) des espèces exploitées.

Les données collectées permettront également le calcul d'indicateurs pour les descripteurs de biodiversité, contribuant ainsi à une meilleure compréhension des dynamiques des espèces exploitées et à l'optimisation des pratiques de gestion des ressources halieutiques.

**Profil et compétences recherchés**:
Ce stage demande un réel intérêt aux approches numériques en particulier pour la modélisation et les statistiques. Une très bonne maîtrise de R est indispensable pour le traitement et l’analyse des sorties du modèle. De solides connaissances en halieutique et en écologie marine sont requises pour la compréhension du sujet, la littérature associée, ainsi que de l’exploitation des résultats des simulations. Enfin, une bonne compréhension de l’anglais et une capacité à la synthèse bibliographique et à la rédaction scientifique sont aussi requises. Les résultats du stage donneront lieu à la rédaction d’une publication où l’étudiant sera co-auteur.

Qui sommes nous ?

**L’Ifremer**

Reconnu dans le monde entier comme l’un des tout premiers instituts en sciences et technologies marines, l’Ifremer s’inscrit dans une double perspective de développement durable et de science ouverte. Il mène des recherches, innove, produit des expertises pour protéger et restaurer l’océan, exploiter ses ressources de manière responsable, et partager les connaissances et les données marines afin de créer de nouvelles opportunités pour une croissance économique respectueuse du milieu marin.

Présents sur toutes les façades maritimes de l’hexagone et des outremers, ses laboratoires sont implantés sur une vingtaine de sites dans les trois grands océans : l’océan Indien, l’Atlantique et le Pacifique. Pour le compte de l’Etat, il opère la Flotte océanographique française au bénéfice de la communauté scientifique nationale. Il conçoit ses propres engins et équipements de pointe pour explorer et observer l’océan, du littoral au grand large et de