Stage de Laboratoire

il y a 1 semaine


Quimper, France ADRIA Temps plein

**Optimisation d’une méthode de qPCR pour la détection de gènes de toxicité au sein du groupe **_**Bacillus cereus**_

**L’ADRIA**

L’ADRIA (Association pour le Développement et la Recherche des Industries Agro-alimentaires) est un institut technique agro-alimentaire de premier plan en matière de sécurité et de qualité des aliments. Elle coordonne des programmes de recherche et développement en étroite collaboration avec les partenaires industriels de l'alimentation, basés sur le savoir-faire de spécialistes en formulation, nutrition, microbiologie des procédés et des aliments.

**Contexte du stage**

Ce stage s’inscrit dans la continuité du projet Patho-d’tect.

Pour garantir la sécurité microbiologique des aliments, une recherche permanente de nouvelles technologies est nécessaire. L’objectif de ce projet est de finaliser le développement d’une nouvelle méthodologie utilisant la PCR quantitative (qPCR) pour détecter simultanément deux gènes d’intérêts associés à des espèces du groupe _Bacillus cereus_ potentiellement toxinogènes. Cette méthode développée devra être suffisamment sensible et spécifique pour permettre la détection simultanée des gènes d’intérêts tout intégrant un contrôle interne d’amplification (qPCR multiplexe). Par ailleurs, la méthode développée pour ce projet pourra par la suite être adaptées à d’autres cibles d’intérêts au sein du groupe _Bacillus cereus_ voire à d’autres microorganismes pour répondre aux différentes attentes des industriels.

**Objectifs du stage**

Les deux objectifs principaux de ce stage sont de:

- Finaliser le développement de la méthode qPCR pour les microorganismes cibles précités (espèces du groupe _Bacillus cereus_) en s’appuyant sur les éléments présents dans la norme ISO 7932 ainsi que les travaux déjà réalisés en qPCR lors du projet Patho-d’tect
- Valider les résultats obtenus sur un panel de souches élargi

Un important travail d’optimisation et de validation des conditions d’amplification sera à réaliser.

De plus, la diversité des cibles renforcera sans aucun doute ce besoin d’optimisation. Ce travail sera dans un premier temps réalisé sur extraits d’ADN obtenus en culture pure.

**Perspectives du stage**

En fonction de l’avancée du stage, la validation de la méthodologie qPCR sur des échantillons artificiellement et naturellement contaminés pourra être envisagée.

**Lieu de stage** : ADRIA Développement, ZA Créac’h Gwen, 29000 Quimper

**Durée du stage** : 12 semaines (adaptable en fonction des durées imposées par les écoles et universités)

Type d'emploi : Stage
Durée du contrat : 12 semaines

Avantages:

- Titre-restaurant

Programmation:

- Du Lundi au Vendredi
- Travail en journée

Lieu du poste : Un seul lieu de travail



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