Postdoctorat en multi-omique comparative des kératines de plumes

Il y a 3 jours

TOURS France, Centre - Val de Loire CNRS Temps plein

Vos missions en quelques mots

Missions :
L.e.a candidat.e retenu étudiera les kératines des plumes d'oiseaux responsables de la coloration structurelle non iridescente, en utilisant des jeux de données -omiques et tomographiques (existants ainsi que de novo) afin de cartographier les relations structure-fonction.
Activités :
L’activités comprennent l'analyse d'ensembles de données -omiques comparatives issues de plumes divers (tant celles déjà publiées que celles générées de novo).

Plus précisément, l.e.a candidat.e sera chargé :

• de mener des analyses génomiques comparatives afin d'identifier les motifs clés liés à des transitions nanostructurales dans les plumes

• de réaliser des études -omiques spatiales de divers tissus de plumes à travers les espèces des oiseaux

• d'aider à la réalisation d'une tomographie de haute résolution des plumes pendant leur développement.

Elle/il participera aussi aux activités de dissémination et de vulgarisation des résultats. Des séjours de courte durée chez des collaborateurs de l'Université de Californie du Sud (génétique du développement) et de l'Université de Tokyo/RIKEN (biophysique) sont prévus, ainsi que de nombreuses occasions de travailler en étroite collaboration avec des doctorants et d'encadrer des stagiaires en master.
Contexte de travail :
La personne exercera son activité au CNRS, à L’Institut de Recherche sur la Biologie de l’Insecte (IRBI) au sein de l’équipe INOV : INteractions Organismes-enVironnement, dans le cadre du projet PHASESEP financé par une subvention de recherche du Human Frontiers Science Program (HFSP). Elle/il travaillera également avec les participants et partenaires du groupe de Saranathan qui étudie l'auto-assemblage intracellulaire de nanostructures photoniques, principalement chez les insectes et les oiseaux. Ce groupe combine diverses approches expérimentales et numériques, allant de l'évolution et du développement à la physique de la matière molle, afin de mieux comprendre la biogenèse des architectures tégumentaires hiérarchiques, notamment les cristaux photoniques, dans le but de les synthétiser in vitro pour des applications biomimétiques. Le contrat est initialement conclu pour une durée d'un an et prolongeable jusqu'à trois ans.

L’IRBI se consacre à l’analyse des interactions entre les insectes et leur environnement biotique et abiotique. L’IRBI est doté d’une force vive et dynamique de chercheurs/enseignants-chercheurs permanents. L'institut s'appuie également sur les compétences de nombreux post doctorants et chercheurs contractuels ainsi que doctorants pour un effectif global de environ 100 personnes. L’IRBI organise de façon régulière des séminaires scientifiques sur des thèmes variés liés aux insectes. Pour plus d'informations, veuillez consulter le site du labo : https://irbi.univ-tours.fr/

Profil recherché

Competences :
La personne recrutée devra être spécialiste des études comparatives en -omique. Une connaissance préalable des oiseaux ou de l'évolution de la kératine des plumes n’est pas un prérequis nécessaire. Les candidat(e)s doivent posséder une bonne maîtrise de la méthode comparative et des approches omiques fonctionnelles afin d'identifier et d'affiner les relations structure-fonction à partir de vastes ensembles de données. Les compétences scientifiques requises comprennent la maîtrise du matériel de labo ainsi que des compétences informatiques (Unix, R, etc.). Des compétences en apprentissage automatique supervisé et semi-supervisé, y compris en apprentissage profond, est un atout supplémentaire. Elle/Il doit également maîtriser l'anglais, tant à l'oral qu'à l'écrit, et faire preuve d'une grande capacité à travailler de manière autonome et en équipe, ainsi que d'un sens aigu des priorités et d'un esprit d'initiative.
Contraintes et risques :
Risques liés au travail en laboratoire de biologie et biochimie et au travail sur écran. Quelques déplacements sont à prévoir en France, mais aussi à l'étranger (Los Angeles, Tokyo).

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
  • Spécialisation Formations générales

Langues

  • Français Seuil