Assistant Ingénieur en biologie H/F

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions :
Réaliser des travaux de biologie moléculaire sur des échantillons biologiques et cellulaires.
Mettre en œuvre et optimiser les protocoles de microdissection à capture laser.
Assurer l'extraction, la purification et le contrôle qualité de l'ADN, de l'ARN et des protéines.
Analyser les modifications épigénétiques et participer à l'interprétation des résultats expérimentaux.
Développer, maintenir et caractériser des modèles cellulaires tridimensionnels (3D).
Participer à la conception expérimentale, à l'analyse des données et à la rédaction des rapports scientifiques.
Contribuer au développement de nouvelles méthodes et au transfert de compétences au sein de l'équipe.
Activités :
Réalisation d'extractions d'ADN, d'ARN et de protéines à partir d'échantillons tissulaires et cellulaires.
Contrôle qualité et quantification des biomolécules extraites.
Mise en œuvre de techniques de PCR, RT-qPCR, Western blot et autres méthodes d'analyse moléculaire.
Gestion, organisation et traçabilité des échantillons biologiques.
Préparation des coupes tissulaires et des échantillons.
Réalisation de campagnes de microdissection à capture laser.
Optimisation des protocoles de prélèvement et de conservation des biomolécules.
Interface avec les plateformes technologiques et les équipes partenaires.
Analyse des mécanismes de régulation épigénétique.
Participation à l'étude des modifications de méthylation de l'ADN et des modifications des histones.
Interprétation des résultats et contribution aux publications scientifiques.
Culture et maintenance de lignées cellulaires en conditions stériles.
Développement, optimisation et suivi de modèles cellulaires en 3D (sphéroïdes, organoïdes ou modèles équivalents).
Réalisation de tests fonctionnels et analyses phénotypiques.
Validation expérimentale des modèles développés.
Analyse et présentation des résultats lors des réunions d'équipe.
Rédaction de comptes-rendus, rapports techniques et documents scientifiques.
Participation à la valorisation des résultats (publications, communications, projets collaboratifs).
Application des bonnes pratiques de laboratoire et respect des règles de qualité, d'hygiène et de sécurité.
Contexte de travail :
Les travaux de thèse seront effectués dans les locaux du Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (CRCL, UMR CNRS 5286, Inserm U1052, UCBL, CLB), dans l'équipe Gastroentérologie et technologies pour la santé, dirigée par Benjamin Gibert et Thomas Walter, sous la direction scientifique de Maria Ouzounova, Chargé de Recherche au CNRS.
Le candidat bénéficiera d'un environnement scientifique international dédié à la recherche sur le cancer (environ 550 personnes), grâce à la présence des 26 équipes de recherche et des 13 plateformes technologiques présentes sur le site.
Le CRCL est affilié à 4 tutelles, le CNRS, l'INSERM, l'Université Claude Bernard Lyon 1 et l'hôpital oncologique Centre Léon Bérard.

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Competences :
Poste accessible à partir d'un BAC+2 en biologie moléculaire, biologie cellulaire, génétique, épigénétique ou discipline équivalente (Master ou doctorat apprécié)
Solide expérience en biologie moléculaire.
Maîtrise de la microdissection à capture laser.
Expertise dans l'extraction et l'analyse de l'ADN, de l'ARN et des protéines.
Bonnes connaissances des mécanismes et analyses des modifications épigénétiques.
Expérience confirmée en culture cellulaire et développement de modèles cellulaires 3D.
Capacité à analyser et interpréter des résultats expérimentaux complexes.
Maîtrise des outils informatiques de traitement et d'analyse des données scientifiques.
Rigueur scientifique et sens de l'organisation.
Autonomie et esprit d'initiative.
Capacité à travailler en équipe dans un environnement multidisciplinaire.
Excellentes capacités rédactionnelles et de communication scientifique.
Contraintes et risques :
Activité nécessitant une grande rigueur expérimentale et le respect strict des protocoles de recherche et des procédures qualité.
Manipulation d’échantillons biologiques parfois de quantité limitée, nécessitant une optimisation constante des protocoles de microdissection et d’extraction.
Gestion simultanée de plusieurs projets de recherche avec des échéances pouvant être contraintes par les objectifs scientifiques, les financements ou les collaborations.
Travail impliquant l’utilisation d’équipements de haute technicité (microdissection à capture laser, instruments de biologie moléculaire, plateformes analytiques) nécessitant une maintenance et une utilisation rigoureuses.
Nécessité d’assurer une traçabilité complète des échantillons, des données expérimentales et des résultats obtenus.
Participation ponctuelle à des réunions scientifiques, formations ou collaborations nationales et internationales.
Exposition à des agents biologiques dans le cadre de la manipulation d’échantillons humains ou animaux, conformément à la réglementation en vigueur.
Utilisation de produits chimiques potentiellement dangereux (solvants, réactifs d’extraction, colorants, fixateurs), nécessitant le port des équipements de protection individuelle adaptés.
Risques liés à l’utilisation d’équipements laser lors des opérations de microdissection à capture laser.