1 postdoc en conception de protéines assistée par IA

Missions :
Un poste de chercheur postdoctoral (H/F) est ouvert pour une durée de deux ans au sein de l'unité « Biologie Structurale Computationnelle », dirigée par le Dr Max Bonomi. Cette unité fait partie de l'UMR3528 CNRS et du Département de Biologie Structurale et Chimie de l'Institut Pasteur (Paris, France).

La personne recrutée aura pour mission principale de développer et d'appliquer des méthodes de pointe fondées sur l'intelligence artificielle pour la conception de protéines (protein design). Ces travaux seront menés en étroite collaboration avec des équipes expérimentales de l'Institut Pasteur ainsi que d'autres institutions de recherche, afin de répondre à des questions biologiques et de concevoir des protéines aux propriétés et fonctions spécifiques.

La personne recrutée sera également chargée de coordonner les collaborations scientifiques associées aux projets, de contribuer à l'analyse et à l'interprétation des résultats, ainsi qu'à leur valorisation sous forme de publications scientifiques et de présentations lors de conférences internationales. Elle participera activement à la vie scientifique de l'unité et au développement de nouvelles approches méthodologiques dans le domaine de la biologie structurale computationnelle.
Activités :
- Développer, adapter et mettre en œuvre des méthodes de pointe basées sur l'intelligence artificielle pour la conception de protéines, notamment à l'aide de modèles génératifs, de modèles de diffusion et de modèles de langage protéique.
- Concevoir et optimiser des protéines présentant des structures, des propriétés ou des fonctions spécifiques, en fonction des objectifs scientifiques des projets.
- Mettre en place des pipelines computationnels intégrant la génération de séquences, la prédiction de structures et l'évaluation in silico des protéines conçues.
- Analyser et interpréter les résultats des simulations et des prédictions, et proposer des stratégies pour améliorer les performances des méthodes utilisées.
- Travailler en étroite collaboration avec les équipes expérimentales pour définir les objectifs de conception, sélectionner les candidats à tester et intégrer les résultats expérimentaux dans des cycles itératifs d'optimisation.
- Assurer la coordination scientifique et le suivi des projets collaboratifs avec les équipes de l'Institut Pasteur et d'autres institutions partenaires.
- Contribuer au développement, à la documentation et au partage des outils informatiques et des codes développés au sein de l'unité.
- Présenter les résultats lors de réunions scientifiques, de séminaires et de conférences internationales, et participer à la rédaction d'articles scientifiques.
- Participer à la vie scientifique de l'unité et contribuer à l'encadrement ponctuel d'étudiants et de stagiaires.
Contexte de travail :
L'unité « Biologie Structurale Computationnelle », dirigée par le Dr Max Bonomi, fait partie de l'UMR3528 CNRS et du Département de B
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