Ingénieur.e chargé.e de recherche scientifique en Protéimique

Il y a 10 heures
Paris, Île-de-France Fonction publique Territoriale Temps plein

Vos missions en quelques mots

Mission
L'ingénieur·e recruté·e prendra en charge le volet protéomique du projet : adapter les protocoles de préparation et d'analyse aux soies sauvages, produire les données de spectrométrie de masse sur les échantillons de référence et les objets de collection, et contribuer à la base de données
d'identification qui en découlera.


La mission est à la fois méthodologique et applicative : il s'agit d'abord de rendre opérantes sur ces matériaux des techniques éprouvées ailleurs, puis de les mettre à l'épreuve sur des échantillons patrimoniaux précieux et souvent dégradés.


Activités


Préparation des échantillons


 Adapter aux soies sauvages les protocoles de décreusage des cocons et de purification des protéines de soie, peu efficaces en l'état car conçus pour le Bombyx mori


 Mettre au point la préparation d'échantillons patrimoniaux, en quantité limitée et parfois dégradés, dans une logique d'analyse la moins invasive possible


 Documenter chaque protocole de façon reproductible
Analyse par spectrométrie de masse


 Réaliser les analyses nanoLC-MS/MS sur les échantillons de référence et les objets de collection


 Participer aux analyses complémentaires menées dans le projet, notamment FTIR et MEB, en lien avec les partenaires concernés


 Assurer le suivi des instruments et la qualité des données produites
Traitement et valorisation des données


 Interpréter les données protéomiques en vue de l'identification des espèces séricigènes


 Contribuer à la construction de la base de données de référence sur les soies sauvages


 Participer à la rédaction des publications et présenter les résultats lors des réunions de projet
Travail collaboratif


 Échanger avec les entomologistes, historiennes et anthropologues du projet sur l'interprétation des résultats


 Dialoguer avec les conservateurs des collections mobilisées


 Contribuer à la réflexion méthodologique du projet sur les pratiques expérimentales

Profil recherché

Profil
Formation : diplôme d'ingénieur ou master 2 en chimie analytique, biochimie, biologie ou sciences des matériaux. Un doctorat n'est pas requis.


Expérience : première expérience en laboratoire d'analyse, stage de fin d'études compris. Le poste s'adresse à un·e jeune ingénieur·e, qui sera formé·e aux spécificités des matériaux étudiés.


Les candidatures de profils venant des sciences du patrimoine ou de l'archéométrie sont bienvenues, dès lors que les bases en spectrométrie de masse sont acquises

Compétences recherchées
Indispensables
 Pratique de la spectrométrie de masse appliquée aux protéines, en particulier le couplage
nanoLC-MS/MS
 Maîtrise des techniques de préparation d'échantillons protéiques : extraction, purification,
digestion enzymatique
 Traitement et interprétation de données protéomiques, avec les logiciels dédiés
 Rigueur dans la traçabilité des protocoles et la tenue des données
Appréciées
 Expérience sur des échantillons anciens, dégradés ou disponibles en faible quantité
 Connaissance des protéines fibreuses, en particulier les fibroïnes et séricines
 Notions de bio-informatique ou de programmation, par exemple R ou Python, pour le traitement des données
 Familiarité avec la FTIR ou la microscopie électronique à balayage
 Anglais scientifique écrit et oral


Qualités attendues
Le projet est résolument interdisciplinaire : vous travaillerez avec des entomologistes, des anthropologues et des historiennes des textiles. La capacité à expliquer vos résultats à des interlocuteurs non chimistes, et à tenir compte de leurs contraintes, comptera autant que la maîtrise technique. L'autonomie et le goût pour la mise au point méthodologique sont également essentiels, une large part du travail consistant à adapter des protocoles existants à des matériaux sur lesquels ils n'ont jamais été éprouvés.

Localisation

Localisation : Paris, France
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Éléments de candidature

Personnes à contacter

joelle.vinh@espci.fr

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