Thèse (H/F)

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Sujet de thèse :
La maladie rénale chronique (MRC) touche environ 10 % de la population mondiale et induit un remodelage vasculaire majeur, avec rigidité artérielle, hypertrophie ventriculaire gauche et calcifications vasculaires (CV). Les CV constituent une complication cardiovasculaire majeure de la MRC, associée à une surmortalité pouvant atteindre un facteur 1000 par rapport à la population générale du même âge. Malgré les traitements actuels ciblant les troubles minéraux et osseux (CKD-MBD), la progression des CV n'est pas efficacement prévenue, y compris après transplantation rénale.
Alors que les CV associées à la MRC sont largement étudiées chez l'adulte, les mécanismes sous-jacents restent mal connus chez l'enfant. La MRC pédiatrique constitue pourtant un modèle unique pour étudier les CV : les causes de la maladie sont le plus souvent des anomalies congénitales limitées au rein et aux voies urinaires (CAKUT), sans les comorbidités systémiques (diabète, tabac, vieillissement) qui compliquent l'interprétation chez l'adulte. Les données préliminaires de l'équipe (analyses multi-omiques d'artérioles pédiatriques) ont permis d'identifier un réseau moléculaire dysrégulé impliquant la matrice extracellulaire et la signalisation immunitaire, reliant remodelage matriciel et voie Wnt/β-caténine.
Le projet VASC-OPATH propose une stratégie translationnelle combinant l'analyse de prélèvements pédiatriques et la validation fonctionnelle des mécanismes moléculaires identifiés dans un modèle in vitro innovant. Le/la doctorant(e) recruté(e) contribuera aux trois axes de recherche du projet :
• Analyse en séquençage d'ARN en cellule unique (snRNAseq) d'artérioles microdisséquées provenant d'enfants avec fonction rénale normale et d'enfants atteints de MRC de stade 5 (avant dialyse), afin d'établir la cartographie cellulaire et moléculaire de la vasculopathie pédiatrique précoce (cellules endothéliales, cellules musculaires lisses, fibroblastes, cellules immunitaires dont les macrophages).
• Modélisation de l'atteinte vasculaire de type MRC dans des organoïdes vasculaires 3D dérivés de cellules souches pluripotentes induites (iPSC), exposés au phosphate, à des toxines urémiques et à des cytokines pro-inflammatoires, afin de caractériser le remodelage vasculaire, de la matrice extracellulaire et de la signalisation Wnt/β-caténine.
• Validation fonctionnelle par invalidation génique CRISPR/Cas9 (lignées iPSC isogéniques knock-out pour les gènes ciblés sur le modèle d'organoïde vasculaire, afin d'établir un lien causal entre ces gènes cibles et le phénotype de calcification vasculaire.
Ce travail de thèse, à l'interface entre biologie vasculaire, immunologie, biologie des cellules souches et néphrologie translationnelle, vise à mieux comprendre les mécanismes cellulaires et moléculaires précoces des CV afin d'identifier de nouveaux biomarqueurs diagnostiques et cibles thérapeutiques potentielles chez l'enfan
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Contraintes et risques :
Travail sur échantillons biologiques humains (artérioles pédiatriques, prélèvements biobanqués), dans le strict respect des exigences éthiques et réglementaires (Déclaration d'Helsinki, RGPD, comités d'éthique). Manipulation de lignées iPSC génétiquement modifiées par CRISPR/Cas9. Travail isolé possible ponctuellement (horaires de manipulation, plateformes).