post doctorat au PMMH
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Vos missions en quelques mots
Missions :
Le/la postdoctorant(e) étudiera de façon fine l'hétéro-agrégation des microplastiques avec des micro-organismes dans des écoulements, en quantifiant l'effet des microplastiques et des conditions hydrodynamiques sur le développement des biofilms et sur la structure des agrégats formés. Ce travail s'appuiera sur une plateforme microfluidique et acousto-fluidique en cours de développement au laboratoire, permettant la culture, l'observation et la manipulation des objets. Une attention particulière sera portée à la composition biologique et propriétés des biofilms.
Activités :
• Mise en place et optimisation des protocoles expérimentaux : culture de micro-organismes (bactéries, micro-algues) en écoulement microfluidique, préparation et caractérisation de suspensions de microplastiques modèles
• Réalisation des expériences d'hétéro-agrégation et suivi de la formation des biofilms par microscopie optique et fluorescence
• Analyse et quantification de la structure et de la croissance des biofilms (imagerie, analyse d'images)
• Analyse de l'expression de gènes d'intérêt (RT-qPCR) en fonction des conditions de culture (écoulement, présence et propriétés des microplastiques)
• Analyse des données, rédaction d'articles scientifiques, présentation des résultats en conférences
• Participation à l'encadrement et à la vie scientifique du laboratoire
Contexte de travail :
Le/la postdoctorant(e) sera accueilli(e) au laboratoire PMMH (Physique et Mécanique des Milieux Hétérogènes, UMR 7636 CNRS–ESPCI–PSL–Sorbonne Université–Université Paris Cité), à Paris (5e arrondissement), au sein de l'équipe d'Alice Pelosse. Le projet se situe à l'interface entre la mécanique des fluides, la physique de la matière molle et la microbiologie environnementale. Il sera mené en collaboration étroite avec l'équipe d'Olivier Espeli au Centre interdisciplinaire de recherche en biologie, Collège de France, pour tous les aspects de microbiologie (biofilms, génétique bactérienne).
Profil recherché
Competences :
• Solide background en microbiologie, écologie microbienne et études de biofilms : culture de bactéries et/ou de micro-algues, techniques de caractérisation classiques (suivi de croissance, microscopie optique et confocale, marquages fluorescents) et
• analyses biomoléculaires (extraction d'ADN, PCR, qPCR, analyse de séquençage)
• Connaissance des microplastiques et de leurs interactions avec les micro-organismes, maîtrise des techniques avancées de caractérisation des polymères
• Maîtrise de l'analyse d'images et des outils de traitement de données (Python)
• Rigueur expérimentale, autonomie et capacité à travailler dans un environnement interdisciplinaire à l'interface physique–biologie
• Bonnes compétences en communication scientifique (anglais courant, rédaction scientifique)
Contraintes et risques :
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
- Spécialisation Formations générales
Langues
- Français Seuil