Bourse de thèse. Détermination de l’environnement tridimensionnel dynamique des télomères.

Sujet de thèse :
La sortie de mitose constitue une étape majeure de la réorganisation du génome dans les cellules de mammifères. Au début de la phase G1, l’enveloppe nucléaire se reforme et les chromosomes retrouvent progressivement leur organisation dans le noyau. Les mécanismes permettant aux chromosomes d’atteindre leur position finale restent cependant encore mal compris. Les télomères, situés aux extrémités des chromosomes, pourraient participer activement à cette réorganisation. En effet, leur position dans le noyau évolue au cours du cycle cellulaire et ils interagissent transitoirement avec l’enveloppe nucléaire lors de sa reformation. Ces observations suggèrent que les télomères pourraient contribuer à la dynamique de l’organisation tridimensionnelle du génome. Cependant, leur environnement spatial et leurs interactions avec la chromatine restent largement inconnus. La nature répétitive des télomères rend en effet difficile l’étude de leurs interactions par les approches classiques de cartographie du génome en trois dimensions. Le développement de nouvelles approches telles que Micro-C et, plus récemment, Region Capture Micro-C (RCMC), offre la possibilité d’étudier ces interactions avec une résolution accrue. L’objectif de ce projet de thèse sera de caractériser l’environnement tridimensionnel des télomères au cours du cycle cellulaire grâce à l’approche RCMC. Le projet cherchera également à identifier les mécanismes moléculaires sous-jacents aux interactions observées.
Contexte :
Le doctorant sera intégré au sein d’une équipe de recherche spécialisée en biologie moléculaire et en organisation du génome, offrant un environnement scientifique stimulant et collaboratif au sein du Centre de Biologie Intégrative de Toulouse. L’encadrement sera assuré par Kerstin Bystricky et David Umlauf. Des labmeetings hebdomadaires seront organisées afin d’assurer un suivi étroit de l’avancement du projet, de discuter des résultats obtenus afin d’ajuster la conduite du projet si nécessaire. Le doctorant présentera également ses travaux lors de réunions d’équipe, de séminaires internes et, le cas échéant, lors de congrès nationaux et internationaux. Un comité de thèse sera mis en place et se réunira annuellement afin d’évaluer la progression du doctorant, la qualité de l’encadrement et les conditions de réalisation du projet. Ce comité formulera des recommandations visant à garantir le bon déroulement de la thèse.