H/F, Offre de post-doc sur

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions :

Le CRBE, Centre de Recherche sur la Biodiversité et l’environnement, est une unité mixte de recherche (UMR5300) dont les thématiques scientifiques s’articulent autour de l’influence des changements environnementaux et de leurs interactions avec la terre vivante, et les rétroactions des systèmes socio-écologiques sur ces changements. La personne travaillera principalement avec Angélique Vétillard, en collaboration avec des collègues du CNAM Paris, et aura pour mission d’exploiter des méthodologies avancées d’intelligence artificielle pour aborder la question de l’infestation massive des ruchers d’abeilles par le parasite Varroa destructor. Plus précisément, la mission vise à découvrir les corrélations intrinsèques entre les niveaux d’infestation des abeilles par Varroa destructor, les types de sources de pollen consommées, les modulations du peptidome/protéome de l’hémolymphe indicatrices de dérégulations des voies, et les traits phénotypiques résultants des abeilles mellifères, en particulier la cognition. L’objectif final du projet consiste à générer un outil d’analyse prédictive qui soutient les enquêtes immunologiques et les tests cognitifs.

Activités :

- Etude de la biologie du parasite Varroa destructor élevé sur larves d’abeilles en conditions semi-contrôlées de laboratoire et de terrain.

- Analyses du peptidome/protéome de l’hémolymphe des abeilles émergentes élevées en laboratoire, via les sciences omiques.

- Analyses des effets à long terme des molécules candidates de l’hémolymphe sur les compétences cognitives et la capacité de tolérance des abeilles lors d’une infestation parasitaire.

- Participation, avec les collègues parisiens, aux analyses et aux traitements des données de masse provenant de ruches intelligentes équipées de caméras, de capteurs de température et d’humidité, de balances et d’autres appareils connectés à l’IoT afin de construire des outils d’analyse prédictive qui soutient les enquêtes immunologiques et les tests cognitifs. Ces méthodes pilotées par l’IA incluent des tâches telles que l’interprétation d’images de pollen.

- Rédaction d’articles scientifiques et communications.

Contexte de travail :

L’agent travaillera au sein d’un petit groupe dynamique ainsi qu’en lien avec les équipes du CNAM Paris, dans un environnement privilégié avec accès à des équipement de pointe. Télétravail possible sur certaines journées durant en dehors de la période de terrain sous réserve de l’autonomie de l’agent et de la déclaration via les outils de la tutelle.

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Competences :

- Compétences en biologie du parasite Varroa destructor et de son hôte l’abeille Apis mellifera

- Maîtrise des techniques des sciences omiques (protéomiques, métabolomiques, transcriptomiques)

- Compétences en analyses statistiques multivariées

- Compétences rédactionnelles et valorisation des données

- Proactivité, autonomie et rigueur

- Capacité à travailler en équipe

Contraintes et risques :

Bien que la possibilité qu’il n’y ait pas de marqueurs de résistance dans l’hémolymphe des abeilles ne puisse pas être écartée, elle est peu probable, d’autant plus que des résultats ont déjà été obtenus en protéomique sur cette question (Fang et al., 2022).

Les machines utilisées pour les différentes analyses permettront une quantification simple et précise des marqueurs sélectionnés. Dans le cas où la quantification est problématique, des comparaisons avec la littérature scientifique existante sur d’autres organismes permettront de proposer une concentration naturelle hypothétique comme base pour la suite des tâches et du projet.