Doctorant.e en problèmes inverses pour les images biomédicales

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Sujet de thèse :
Le cancer du sein est le plus répandu chez les femmes dans le monde et une cause majeure de mortalité. Une détection précoce est essentielle à la survie des patientes. Cela motive des campagnes de dépistage à grande échelle, qui reposent principalement sur la mammographie par rayons X. Au cours des dernières années, la recherche a élargi ses objectifs au-delà de la simple détection des tumeurs et consacre désormais beaucoup d’efforts à l’évaluation du risque de cancer du sein, afin de renforcer la surveillance des femmes présentant un risque plus élevé. On sait depuis des décennies que les motifs parenchymateux visibles sur les mammographies reflètent ce risque. Pourtant, identifier les motifs à risque dans les images de rayons X reste très difficile, même pour des radiologues expérimentés, car l’aspect visuel des tissus denses sains et des tissus dégradés peut être très similaire, ce qui complique leur discrimination précise à l’œil nu.

Des travaux récents ont montré que la dégradation du microenvironnement, qui entrave la suppression des lésions émergentes et constitue ainsi un motif de risque important, peut être évaluée en analysant les propriétés d’auto-similarité des textures mammographiques. La principale limite de cette approche est que les propriétés d’auto-similarité sont très sensibles au bruit de mesure dans les mammographies par rayons X. Une observation précise des propriétés fines des textures mammographiques nécessite donc de débruiter les mammographies par rayons X tout en préservant l'auto-similarité.

L’objectif principal de cette thèse de doctorat est de développer des méthodes de débruitage non gaussien préservant les propriétés fractales des textures présentes dans l’image, dans le but d’analyser des mammographies par rayons X à travers le prisme de l’analyse multi-échelle. Le ou la doctorant·e explorera à la fois les approches basées sur des modèles et les approches orientées données pour le débruitage d’images. Il ou elle combinera ensuite des procédures d’optimisation et des techniques d’apprentissage profond afin d’obtenir des méthodes précises, robustes et interprétables.

Un sujet détaillé, en anglais, est disponible ici : https://uncloud.univ-nantes.fr/index.php/s/ZqrKQ54RdHQF79E.
Contexte :
Le ou la doctorant·e bénéficiera du soutien financier du projet UNGRAM, financé par l'ANR, pour participer à des ateliers et conférences, ainsi que de l’environnement scientifique riche du consortium UNGRAM, qui rassemble des chercheurs de Nantes, Vannes et Tours, ainsi que des collaborateurs internationaux aux États-Unis et en Italie. Il ou elle aura également l’opportunité de collaborer avec un·e postdoctorant·e ainsi qu’avec deux stagiaires à recruter dans le cadre du projet.

Le ou la candidat·e recruté·e sera employé·e par le Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) dans le cadre du projet ANR UNGRAM, porté par B. Pascal. Il ou elle intégrera
Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr...

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Contraintes et risques :
Le site de Centrale Nantes a deux périodes de fermeture annuelle :
- une semaine en fin d'année civile
- trois semaines durant l'été
qui sont des congés contraints.