Ingénieur/e chargé/e de recherche en Protéomique et Signalisation Redox
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Vos missions en quelques mots
Présentation du projet :
Le projet ERXCUE, financé par l’ANR, vise à étudier comment les cellules s’adaptent – ou
échouent à s’adapter – au stress du réticulum endoplasmique (ER), en se concentrant sur le
remaniement du métabolisme thiol-redox. L'objectif est d'identifier les processus redox qui
influencent la décision cellulaire entre la survie et l’apoptose lors de la réponse aux protéines non
repliées (UPR). En combinant des approches -omiques non biaisées et des études ciblées au niveau
protéomique subcellulaire, l’ingénieur/e sera explorera comment les activités redox participent à la
régulation de l'UPR et au destin cellulaire.
Missions & responsabilités :
• Analyse Protéomique et Redoxomique :
o Concevoir et réaliser des expériences de spectrométrie de masse (LC-MS/MS) pour
identifier et quantifier les modifications redox et post-traductionnelles dans les
protéines impliquées dans l’UPR.
o Se concentrer sur les modifications des thiols et les protéines redox-actives.
• Intégration des Données :
o Intégrer les données de protéomique redox avec les données de transcriptomique
pour créer une cartographie complète des voies redox régulées par l’UPR.
o Utiliser des outils de bioinformatique pour corréler les données protéomiques avec
les états redox cellulaires et les transitions UPR.
• Conception Expérimentale :
o Développer et optimiser des méthodes de fractionnement subcellulaire et de redoxomique ciblant des organites spécifiques, en particulier le réticulum endoplasmique (ER).
o Mettre en œuvre des workflows innovants pour cartographier les modifications
redox spécifiques à l’ER et l’activité redox sous conditions de stress UPR.
• Recherche Collaborative :
o Travailler en étroite collaboration avec les équipes de biologie redox et de métabolomique pour comprendre comment les changements dans le métabolisme
thiol-redox et d'autres voies affectent les réponses cellulaires au stress de l'ER.
o Étudier le remaniement métabolique sous UPR et son impact sur le protéome.
Profil recherché
Connaissances et qualités recherchées :
• Principes et expériences en analyse protéomique,
• Traitement des données quantitatives de protéomique,
• Culture cellulaire humaine
• Connaissance du langage R
Diplome : PhD en biochimie, chimie analytique, biologie
Expérience souhaitée : 3ans
Localisation
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