Chercheur - Stratégie antivirale pour l'émergence dans les Suds H/F

Institut international de recherche, l’IRD contribue à renforcer la résilience des sociétés face aux bouleversements globaux. Il est présent dans plus de 50 pays d’Afrique, d’Amérique latine, d’Asie et du Pacifique, ainsi que dans les Outre-mer.

Ses activités de recherche répondent de manière concrète à des besoins prioritaires : atténuation et adaptation aux changements climatiques, lutte contre la pauvreté et les inégalités, préservation de la biodiversité, accès aux soins, prise en compte des dynamiques sociales. Les questions de recherche sont élaborées avec les acteurs de terrain et les populations locales. Les équipes croisent les regards, les disciplines et les connaissances à travers des partenariats de long terme pour construire des solutions robustes et à fort impact.

L’IRD défend une recherche qui bénéficie au plus grand nombre. Il partage les résultats de ses projets et met la science au service de l’action. Il accompagne ainsi la transformation des sociétés vers des modèles sociaux, économiques et écologiques plus justes et durables.

L’Unité des Virus Émergents (UVE) est une unité mixte de recherche implantée sur le site Timone à Marseille (Aix-Marseille Université, Università di Corsica, IRD 190, Inserm 1207, IRBA) qui se consacre à la surveillance des maladies virales émergentes. Ses travaux couvrent les aspects virologiques (virologie médicale et moléculaire, antiviraux, évolution) et environnementaux (écologie, entomologie, réservoirs animaux..), les sciences humaines (sociologie de la perception du risque infectieux, géographie de la santé), l’épidémiologie, la modélisation et la santé publique. Les recherches portent principalement sur les arbovirus et les virus respiratoires.

L’UVE possède plusieurs plateformes technologiques (en biologie moléculaire, immunodiagnostic, antiviraux) qui viennent en soutien aux programmes au Sud portés des personnels de recherche de l'IRD, d'Aix Marseille université, de l'IRBA et de l'Inserm. Les projets sont menés en Afrique (Cameroun et Mali), en Asie (Laos et Cambodge) et en Amérique Latine (Bolivie et Colombie). Ils portent principalement sur la surveillance des pathogènes viraux à potentiel épidémique avec une approche globale : étude des causes virales des fièvres indifférenciées, études de séroprévalence en population générales, recherche des pathogènes viraux dans les réservoirs animaux et les moustiques vecteurs, études cliniques et le développement d’antiviraux.

Le ou la post-doctorant·e sera recruté·e dans le cadre de la chaire CPJ stratégie antivirale pour l’émergence dans les Suds qui vise à développer des thérapeutiques antivirales (petites molécules ou biothérapie) contre les virus émergents circulant dans les Pays du Sud.  Parmi les projets menés, une combinaison de molécules repositionnées est particulièrement prometteuse. La mission principale sera de poursuivre le développement préclinique de cette combinaison qui associe favipiravir et nitazoxanide, contre le virus de la fièvre de la Vallée du Rift (RVFV) mais aussi d’autres virus d’importance médicale. Le projet vise à générer les données virologiques, pharmacologiques et translationnelles nécessaires pour évaluer cette combinaison comme future contre-mesure contre dess infections virales émergentes.

Le ou la post-doctorant·e contribuera directement à la production de données précliniques de haut niveau de preuve, depuis la caractérisation de l’activité antivirale dans des modèles cellulaires pertinents jusqu’à l’interprétation des résultats d’efficacité in vivo. Il ou elle travaillera au sein de l’Unité des Virus Émergents (UVE), en interaction avec les partenaires impliqués en virologie, pharmacocinétique/pharmacodynamie (PK/PD), modélisation et développement préclinique.

Sous la responsabilité du porteur scientifique de la chaire :

Mettre en œuvre et optimiser des modèles cellulaires pertinents d’infection, par le RVFV, Hazara et d’autres virus d’intérêt clinique, notamment des cellules primaires ou des modèles complexes adaptés à l’évaluation d’antiviraux
Évaluer l’activité du favipiravir, du nitazoxanide et de leur combinaison dans des essais dose-réponse, en déterminant les valeurs d’efficacité antivirale, de cytotoxicité et de sélectivité dans ces modèles
Contribuer à la préparation, au suivi et à l’analyse d’études d’efficacité in vivo, incluant la collecte, le traitement et l’analyse d’échantillons biologiques
Participer à l’interprétation intégrée des données virologiques et pharmacologiques, en lien avec les équipes responsables de la PK/PD et de la modélisation
Contribuer à la définition des schémas posologiques et des critères de décision nécessaires au passage vers les études chez le primate non humain et, à terme, à la préparation d’un développement clinique
Participer à la structuration des données, à leur traçabilité, à leur archivage et à la rédaction des procédures expérimentales
Rédiger des rapports, et des publications scientifiques
Encadre des stagiaires et des étudiant·es impliqué·es
Participer aux astreintes pour contribuer au fonctionnement de l’animalerie

À titre secondaire, le ou la post-doctorant·e pourra également contribuer à d’autres travaux de la Chaire « Stratégie antivirale pour l’émergence dans les Suds », portée par le responsable scientifique du projet. Cette participation, organisée en fonction des priorités de COMBORIFT, pourra inclure l’évaluation de l’activité antivirale de molécules et de biothérapies contre d’autres virus émergents, la caractérisation de la sensibilité de souches circulantes aux antiviraux, ou encore l’appui à des projets associant développement préclinique et préparation à la réponse aux émergences dans les pays du Sud.

La personne recrutée travaillera au sein d’un groupe de recherche pluridisciplinaire de l’UVE réunissant des virologues, pharmacologues, modélisateurs et spécialistes des modèles animaux. Elle contribuera au lien entre les volets de recherche fondamentale et préclinique, ainsi qu’aux perspectives de recherche pour le développement du projet, notamment en vue d’une future étude de faisabilité en Afrique de l’Ouest avec des partenaires.

L’intégration dans l’environnement de la Chaire offrira également une ouverture sur des projets complémentaires portant sur d’autres arbovirus ou fièvres hémorragiques virales.

• Doctorat en virologie, microbiologie, biologie cellulaire, maladies infectieuses ou discipline équivalente
• Expertise solide en virologie expérimentale et en biologie moléculaire
• Maîtrise des méthodes de culture cellulaire, infection virale, extraction d’acides nucléiques, RT-qPCR et titrage viral
• Expérience en BSL-3 requise
• Expérience en expérimentation animal requise
• Expérience des modèles précliniques d’infection virale, incluant la préparation et l’analyse d’études in vivo
• Capacité à organiser, documenter et analyser des jeux de données expérimentales complexes
• Très bonne capacité de rédaction scientifique en anglais
• Aptitude à présenter les résultats dans un cadre d’équipe, de consortium et de conférences scientifiques

Qualités attendues

• Autonomie 
• Gestion de projet (scientifique et administratif)
• Management de personnel
• Rigueur expérimentale, sens critique et souci de reproductibilité
• Capacité à organiser plusieurs activités en parallèle
• Goût du travail en équipe, dans un environnement pluridisciplinaire et multi-partenarial
• Respect strict des règles de biosécurité, de confidentialité, d’éthique et de traçabilité des données
• Intérêt marqué pour la préparation aux épidémies, les maladies émergentes et la recherche pour le développement