Doctorant en biophysique des complexes ADN-azobenzene

Sujet de thèse :
Les méthodes de diffusion et de diffraction des rayons X résolues en temps ont révolutionné la biologie structurale, en mettant en lumière la dynamique structurale qui accompagne des fonctions biologiques essentielles. Le doctorant utilisera la diffusion statique et résolue en temps des rayons X en solution pour suivre les changements structuraux des photoswitches à base d’ADN azobenzène-G-quadruplex (AzO-G4) après excitation par la lumière, révélant ainsi les variations de volume induites par la photoisomérisation de l’azobenzène et apportant un éclairage sur la dynamique et la hiérarchie structurelle des changements conformationnels de l’AzO-G4.
Contexte :
Situé sur le Polygone scientifique de Grenoble (ESRF/ILL/EMBL/IBS), l’Institut de Biologie Structurale (IBS) est un acteur d’envergure nationale et internationale dans le domaine de la biologie structurale intégrée. A la fois centre de recherche, plateau technique, site d'accueil et de formation scientifique, l'IBS a pour vocation le développement de recherches en biologie structurale, un champ de recherche capital pour la compréhension des mécanismes biologiques fondamentaux. Il s’appuie sur 12 plateformes à la pointe de la technologie.
En tant qu’unité mixte de recherche (CEA-CNRS-UGA) l’IBS est composé de 20 groupes de recherche, chacun de ces groupes proposant une approche multi-disciplinaire, aux frontières de la biologie, de la physique et de la chimie, en cohérence avec 3 axes de recherche. Près de 320 personnes y travaillent : chercheurs, doctorants, ingénieurs et techniciens dans un environnement multiculturel et international.
La personne recrutée intégrera le groupe Dynamop qui se focalise sur l’étude de la dynamique structurale des macromolécules biologiques :
https://www.ibs.fr/en/research/assembly-dynamics-and-reactivity/dynamics-and-kinetics-of-molecular-processes-group-m-weik/?lang=en
Activités :
- Préparer des échantillons de AzO-G4 en solution
- Participer à des expériences de diffusion de rayons X résolue en temps
- Analyser et interpréter des données expérimentales
- Modéliser les données expérimentales par simulations de dynamique moléculaire
- Mettre en forme les résultats pour des rapports et des présentations orales en anglais
- Être force de proposition pour la mise au point et l’amélioration des expériences
- Rédiger en anglais des protocoles et des articles de recherche pour la publication des travaux réalisés
- Participer à la vie en commun du groupe de recherche
- Aider à la supervision de stagiaires
- Participer aux événements scientifiques de l’Institut
Compétences :
- compétences en biophysique ou physique de la matière molle
- notions de biochimie des molécules biologiques
- maîtrise d’outils d’analyse de données expérimentales
- connaissance d’un langage de programmation (Python, C++, etc.)
- Anglais (écrit/oral) niveau B2
- Capacité d’autonomie
- Pro-activité dans la recherche, curios
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