Ingénieur en bio-informatique H/F
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Vos missions en quelques mots
Une mission attractive
Dans le cadre du PEPR Agroécologie et Numérique, ce projet offre une opportunité de recherche en génomique de l’adaptation et d’étude de l’évolution associé aux climats.
Sous la responsabilité du directeur d’unité, votre mission sera de participer à comprendre l’adaptation des plantes et des mélanges de plantes aux variations du climats en utilisant des données génomiques et climatiques pour accompagner la transition agroécologique.
Dans ce cadre vos activités seront les suivantes :
- Développer des outils bio-informatiques pour analyser l’adaptation des plantes aux variations du climat et des climats futurs. L’approche sera basée sur l’utilisation de méthodes innovantes pour pouvoir interroger des données issues d’analyse de pangénome/pan-graphe.
- Construire des briques logicielles pour ces analyses et les intégrer dans un outil existant, Valider l’intégration et le développement de scripts en analysant des jeux de données sur différents modèles végétaux et proposer des tutoriels et la formation pour leur utilisation.
- Développer des outils bio-informatiques pour prendre en compte l’incertitude des séquences ADN (contamination, faible profondeur, type de donnée, repeats) due à l’ADN ancien (dommages post-mortem et fragmentation importante) dans l’analyse bio-informatique de la diversité et de l’association au climat.
Votre future équipe
Vous intégrerez l’équipe Dynadiv au sein de l’UMR DIADE à Montpellier. Le projet est fortement collaboratif et implique des échanges réguliers avec des chercheurs de différentes unités de recherche (AGAP, GDEC) et instituts (INRAE, CIRAD, MNHN).
Profil recherché
Vous avez développé les compétences suivantes :
Maîtrise des systèmes UNIX et expérience en manipulation de données sur HPC, connaissances en contenerisation (Docker, apptainner).
Maîtrise du langage de programmation Python et R, et si possible notion dans un des autres langages tels que C.
Connaissances en biologie et analyse de données de séquençage.
Vous faites preuve des qualités humaines suivantes :
Autonomie et rigueur.
Capacité de travail en équipe.
Capacité à gérer des interactions avec de multiples chercheurs.
Vous êtes titulaire d’un diplôme de niveau 7, ingénieur et/ou Master avec une expérience en bio-informatique
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 5 Diplômes de niveau bac +2
Éléments de candidature
Documents à transmettre
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Technicien support informatique
Il y a 20 heures
Montpellier, Occitanie, France Manpower Temps pleinManpower DIGITAL MONTPELLIER recherche pour son client, un acteur du secteur des services informatiques, un Technicien support informatique en Itinérance (H/F) Rattaché(e) au service technique, vous interviendrez directement chez les clients pour assurer : - Le déploiement et l'installation de logiciels métiers (poste de travail, serveurs,...
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Développeur informatique C#
Il y a 20 heures
Montpellier, Occitanie, France Manpower Temps pleinManpower DIGITAL MONTPELLIER recherche pour son client, un acteur du secteur de la santé, un Développeur informatique C# / .NET (H/F) afin de participer au développement d'applications logicielles innovantes dans un environnement technique exigeant. - Concevoir, développer et maintenir des applications en C# / .NET / WPF. - Participer à l'évolution...
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Ingénieur observabilité H/F
Il y a 1 jour
Montpellier, Occitanie, France Crédit Agricole Temps pleinInformations générales Entité CA-GIP EN QUELQUES MOTS… Travailler chez CA-GIP, c'est être acteur de la transformation du groupe Crédit Agricole et de ses métiers. C'est travailler dans une entreprise technologique de 1er plan en Europe, au service...
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Ingénieur QA
Il y a 2 jours
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Ingénieur Appel d'Offres Déchets H/F
Il y a 1 jour
Montpellier, Occitanie, France Agence Oriflam Temps plein 40 000 € - 55 000 € ContratPrésentation de la sociétéL’Agence Oriflam, cabinet de recrutement spécialisé dans les métiers du déchet, recrute pour une entreprise indépendante reconnue, intervenant auprès de collectivités et d’industriels sur des prestations liées à la gestion des déchets, à la propreté urbaine et aux services environnementaux.DescriptionDans le...
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Ingénieur Bases de Données PostgreSQL
Il y a 1 jour
Montpellier, Occitanie, France Sécurité sociale Temps pleinContexteAvec vous, agir pour une protection sociale durable et solidaire. L’Urssaf joue un rôle majeur dans le bon fonctionnement de notre système de protection sociale. Chaque jour, elle pilote la collecte, puis la redistribution des cotisations et contributions pour assurer le financement des prestations de santé, retraite, famille, chômage dont...
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Ingénieur DevOps Kubernetes expert H/F
Il y a 3 jours
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Développeur informatique C#
Il y a 4 jours
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Cheffe/Chef de projet informatique
Il y a 16 heures
Montpellier, Occitanie, France EURO-INFORMATION DEVELOPPEMENTS Temps pleinQui sommes nous Euro-Information, filiale technologique de Crédit Mutuel Alliance Fédérale, conçoit, réalise, maintient et exploite un système d’information commun utilisé par le Groupe. Les activités de développement et de production informatique au niveau national et international sont assurées par environ 5000 salariés répartis sur plusieurs...
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Cheffe/Chef de projet informatique
Il y a 16 heures
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