Responsable d'une plateforme de phénotypage

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Vous rejoindrez la plateforme de phénotypage végétal à haut débit, Toulouse Plant Microbe Phenotyping (TPMP), dédiée à l'étude des réponses des plantes à différents stress biotiques et abiotiques. Cette infrastructure est adossée au laboratoire Toulouse Plant Science (TPS) issu de la fusion du LIPME (INRAE-CNRS), du LRSV (CNRS-Univ Toulouse) de la fédération de recherche FR AIB (CNRS-Univ Toulouse). TPS rassemble environ 170 personnels permanents (chercheurs, enseignants-chercheurs, ingénieurs et techniciens) et une centaine de personnels non permanents (doctorants, post-docs en particulier) et est intégrée au dispositif PHENOTOUL, fédérant le continuum du phénotypage végétal sur le site toulousain. TPMP s'inscrit dans le réseau national PHENOME-EMPHASIS et contribue aux priorités du département Santé des Plantes et Environnement (SPE) d'INRAE. TPMP permet des expérimentations à grande échelle dans des environnements contrôlés et automatisés, incluant des dispositifs compatibles avec le confinement S2 et l'étude d'organismes réglementés.

Vous travaillerez au sein d'un collectif associant des expertises en expérimentation végétale, acquisition de données, automatisation, imagerie et analyse de données.

Dans un contexte de développement des infrastructures de recherche et d'augmentation des besoins en phénotypage, vous assurerez le pilotage opérationnel de la plateforme ainsi que la coordination des activités nécessaires à son bon fonctionnement (50 %). Vous contribuerez également à la structuration au sein de PHENOTOUL des données d'imagerie produites et à l'évolution des services proposés aux équipes de recherche (40 %). Vous contribuerez à une mission transversale département SPE / PHENOME-EMPHASIS (10 %), en participant à l'animation de réseaux scientifiques, aux actions de visibilité et à l'adéquation durable entre moyens et besoins pour maintenir un service de recherche de haut niveau.

Ce poste occupe une position centrale entre les utilisateurs, les personnels techniques et les réseaux nationaux de recherche. Votre action contribuera à garantir la qualité des expérimentations, la valorisation des données produites et le maintien d'une infrastructure de référence au service de projets scientifiques ambitieux.

Dans ce cadre, vous serez en charge des activités suivantes :

Pilotage de la plateforme et accompagnement des projets

- Organiser et coordonner le fonctionnement quotidien de la plateforme de phénotypage végétal.

- Interagir avec une équipe pluridisciplinaire composée de personnels aux compétences complémentaires (maintenance, automatismes, contrôle climatique, conduite de cultures, acquisition de données, expertise biotique, analyse d'images).

- Planifier les expérimentations et assurer le suivi des projets accueillis.

- Accompagner les utilisateurs dans la mise en œuvre des dispositifs expérimentaux.

- Garantir l'application des procédures qualité, de traçabilité et de reproductibilité.

- Contribuer à l'évolution de l'offre technologique et à la préparation de réponses à appels à projets.

- Assurer l'animation fonctionnelle du personnel impliqué dans les activités de la plateforme.

Gestion et valorisation des données d'imagerie

- Structurer les flux de données issus des dispositifs d'imagerie.

- Définir et mettre en œuvre des workflows de gestion des données.

- Contribuer à la documentation, à la qualité et à la traçabilité des jeux de données aux principes FAIR.

- Veiller à la conformité des données aux principes de gestion et de partage des données de recherche.

- Collaborer avec les spécialistes de l'analyse d'images afin d'optimiser les chaînes de traitement.

Animation scientifique et contribution aux réseaux

- Participer à l'animation de réseaux scientifiques nationaux.

- Contribuer à la visibilité et au rayonnement des infrastructures de phénotypage.

- Favoriser la mutualisation des pratiques et des méthodes entre plateformes.

- Participer à la réflexion sur l'adéquation entre les moyens techniques disponibles et les besoins scientifiques.

Vous avez une formation supérieure en biologie végétale, agronomie, sciences du végétal ou phénotypage.

Une expérience en pilotage de plateforme scientifique, en phénotypage végétal ou en gestion d'infrastructures expérimentales serait fortement appréciée.

Savoir-faire :

- Piloter une plateforme scientifique ou un dispositif collectif de recherche.

- Concevoir et suivre des expérimentations en environnement contrôlé.

- Utiliser ou développer des outils de phénotypage végétal et d'acquisition de données.

- Structurer, documenter et gérer des données scientifiques à grande échelle.

- Mettre en œuvre des démarches qualité et assurer la traçabilité des activités.

- Coordonner des projets et accompagner des utilisateurs.

- Rédiger des procédures, des bilans et des contributions à des appels à projets.

Le poste nécessite de communiquer en français et en anglais dans un contexte scientifique et technique.

Savoir-être :

- Capacités d'organisation et de pilotage.

- Aptitude à coordonner des équipes aux compétences variées.

- Sens du service et de l'accompagnement des utilisateurs.

- Esprit d'initiative et capacité à proposer des améliorations.

- Rigueur et sens des responsabilités.

- Qualités relationnelles et goût pour le travail collaboratif.

- Capacité à évoluer dans un environnement scientifique multidisciplinaire.