Ingénieur Techniques Biologiques_072_NCB_

Ce poste s’inscrit dans le cadre d’un projet ANR dans l’équipe « RNA Disease », qui comprends cinq personnes et fait partie de l’IGBMC, situé sur le parc d'innovation d'Illkirch à Strasbourg. L’IGBMC associe le CNRS, l'Inserm, et l'Université́ de Strasbourg, et regroupe ~600 personnes, repartis dans 3 bâtiments, ~50 équipes de recherches et une douzaine de plateformes technologiques et scientifiques.

Mission principale

Étude de maladies génétique musculaires et neurodégénératives humaines par des approches de biologie moléculaire, cellulaire et d’analyse de modèles souris.

Contexte Scientifique :

L'une des révélations marquantes du séquençage du génome humain est que notre ADN ne contient que ~23 000 gènes codants, occupant ~2 % de notre génome. La majeure partie de notre ADN est donc constituée de séquences annotées comme non codantes et de séquences répétées, mal caractérisées.

Parmi ces éléments répétés, les microsatellites sont de courtes séquences d'ADN généralement constituées d'environ 3 à 30 répétitions de motifs d'ADN longs de 2 à 6 nucléotides (par exemple CGG12x, CAG22x, etc.). L'expansion de certains microsatellites au-delà d'un certain seuil (généralement 30 ou 40 répétitions) est responsable de plus de 60 maladies génétiques neurodéveloppementales, musculaires et/ou neurodégénératives (maladie de Huntington, Syndrome de l’X fragile, etc.). Toutefois, la plupart de ces mutations sont dissimulées au sein de séquences mal définies, annotées par défaut comme non codantes, ce qui questionne leur mécanisme de toxicité.

En combinant diverses approches Omiques, moléculaires et cellulaires ainsi que la création de modèles cellulaires et animaux (cellules iPS et modèles souris), nous avons découvert un nouveau mécanisme où ces expansions « non codants » sont traduites en de nouvelles protéines toxiques polyglycine, responsable de diverses maladies musculaires et neurodégénératives (FXTAS, NIID, OPDM etc.).

Nous recherchons donc un-e candidat-e avec une forte expérience en équipes de recherche et une bonne maîtrise des approches de biologie moléculaire et cellulaire ainsi que des modèles souris.

Activités principales

& Savoir-faire

·  Maîtrise de techniques de biologie moléculaire et cellulaire : clonages, culture de lignées cellulaire type HEK, U2OS, etc., transfection cellulaires, extraction ARN et RT-qPCR, extraction protéines, immunoprécipitation et western blot, immunofluorescence, microscopie à fluorescence, etc.

·  Maîtrise de l’étude de modèle murins : Injections rétro orbitales et intrapéritonéales, phénotypage locomoteur : open Field, Rotarod, barre crantée, etc.

·  Maitrise des techniques d’immunohistochimie et immunofluorescence sur coupes de tissus.

Aptitudes

·        Analyser et présenter avec esprit critique ses résultats.

·       Savoir utiliser des logiciels d’analyses d’images de microscopie, d’analyses statistiques, de clonage et de bureautique : Fiji/ ImageJ, Prism/ GraphPad, SnapGene, Word, Power point, etc.

·       Travail en équipe, apprécier interagir avec d’autres chercheurs, ingénieurs et étudiants, mais aussi former et encadrer les nouveaux arrivants (stagiaires, étudiants, etc.).

·       Participation à la gestion des commandes et au bon fonctionnement de l’équipe. Respect des règles d’éthique, de sécurité et d’hygiène.

·       Sens de l’organisation et rigueur. Polyvalence, capacité à se former, s’adapter et à proposer et développer des modifications ou de nouveaux protocoles et approches méthodologiques.

Connaissances

·      Bonnes connaissances en techniques de biologie moléculaire et cellulaire 

·      Connaissance en modèle murins (si possible : Titulaire d’une Formation à l’Expérimentation Animale « Applicateur de procédures / Réalisateur » ancien Niveau 2).

Spécificité(s) et environnement du poste

·     Travail à la paillasse

·     Travail en salle de culture L1/L2

·     Travail en animalerie

Contact

Nicolas CHARLET, IGBMC, Illkirch

ncharlet@igbmc.fr

Envoyer :

·   CV +

·   Lettre motivation +

·   Adresses emails de plusieurs référents +

·   Éventuellement tout autres documents jugés relevant (lettres de recommandations, relevés de notes, rapport de master, etc.).