Ingénieur de Recherche – développement d'outils d'analyse et de visualisation des répertoires Immunoglo

Il y a 1 jour
Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

Vos missions en quelques mots

Missions :
Analyses de la diversité du répertoire des récepteurs d’antigènes des cellules B et T, développements d’outils de visualisation interactifs des résultats d’IMGT/HighV-QUEST.
Activités :
Analyse des répertoires exprimés des immunoglobulines et des récepteurs T avec IMGT/HighV-QUEST
- Extraction des informations pertinentes : profils d’expression des gènes et allèles, analyse détaillée des jonctions, caractérisation des mutations somatiques
- Développement d’outils de visualisation des résultats d’IMGT/HighV-QUEST destinés à être publiés sur le site Web d’IMGT
- Développement de l’outil StatMutations
- Principal interlocuteur de la collaboration avec ImmGenT, responsable des analyses, des échanges et des travaux de valorisation
- Implication dans les développements bioinformatiques IMGT développés dans le cadre la contribution d’IMGT dans l’IHU Immun4cure
- Présentation d’IMGT dans les congrès et les workshops

Contexte de travail :
Système d’information IMGT®, the international ImMunoGenetics information system certifié ISO 9001:2015 and NFX 50-900:2016, qui est la référence en immunogénétique et immunoinformatique. Laboratoire de la Professeure Sofia Kossida (20 personnes) qui fait partie de l’Institut de Génétique Humain, IGH, UMR 9002 CNRS - Université de Montpellier. Développements d’outils en immunogénétique et immunoinformatique, et de partenariats/collaborations nationales et internationales.
L' IGH est situé sur le campus Arnaud de Villeneuve, partie prenante du programme Objectif Employeur Pro-Vélo.

Profil recherché

Competences :
- Savoirs / connaissances
Recueil, analyse et traitement des données issues du séquençage haut-débit, (connaissance approfondie)
Bio- Informatique appliquée (connaissance approfondie)
Connaissances approfondies en immunogénétique et immunoinformatique
Langue anglaise : C1
- Savoir-faire
Expertiser : rechercher, comparer, identifier, décrire les répertoires exprimés des immunoglobulines et des récepteurs T, mettre à disposition de ces données, des analyses et interprétations des résultats
Développement en langage Python et R
Savoir gérer ses projets sous Redmine
Collaborer avec le personnel de l’équipe (multidisciplinarité) et avec les partenaires nationaux et internationaux d’IMGT
Communiquer : valoriser, donner une visibilité, rédiger
- Savoirs-être
Travailler en équipe
Etre à l’interface de plusieurs projets
Savoir être à l’écoute des utilisateurs et collaborateurs nationaux et internationaux d’IMGT
Savoir représenter IMGT dans les congrès et workshop

Contraintes et risques :
Travail exclusivement sur ordinateur.

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
  • Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)

Langues

  • Français Seuil

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