Ingénieur en expérimentation et bio-informatique biologiques
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Vos missions en quelques mots
Mission principale
La personne recrutée aura pour mission de mettre en œuvre et optimiser la culture 3D d’organoïdes mammaires en milieu de culture de type Clevers.
Activités principales
- Réaliser des Cultures 3D d'organoïdes mammaires en milieu Clevers
- Effectuer l’Agrégation de cellules en Aggrewells et les Infections lentivirale pendant agrégation
- Réaliser l’Ensemencement d'organoïdes en dômes d'hydrogel dans plaques 96 puits
- Analyser les données de Culture en Incucyte/CellCyte
- Analyses et traitement en bioinformatiques de données Incucyte/CellCyte et transcriptomique spatiale
Spécificités et environnement du poste
Ce poste sera situé dans l’équipe 7 de l’unité de cancérologie BRIC (BoRdeaux Institute of onCology) qui comprend 11 équipes de recherche. Cette unité est associé à l’UAR TBMCore et donc aux différentes plateformes technologiques qui la constituent
U1312
Bâtiment Bordeaux Biologie Santé
2 rue Hoffmann Martinot
33 000 Bordeaux
Profil recherché
Connaissances
- Connaissances en biologie moléculaire et cellulaire
- Connaissances en biologie du cancer du sein
- Connaissances en bioinformatique
Savoir-faire
- Culture 3D d'organoïdes en milieu Clevers
- Agrégation et infection lentivirale en Aggrewells de cellules primaires
- Ensemencement d'organoïdes en plaques 96 puits et culture en Incucyte/CellCyte
- Cytométrie en flux
- Clonage moléculaire, qPCR, Western
- R/Bioconductor et Python pour bulk, single cell et transcriptomique spatiale (Seurat, scanpy, anndata, squidpy, proseg)
- Analyses d'images avec ImageJ, QuPath et Python depuis YAML en VS Code
- Linux et HPC/SLURM
- Analyse transcriptomique spatiale (Visium ou Xenium préférée)
- Analyses statistiques avec modèles mixtes
- Maîtrise professionnelle de l’anglais
Aptitudes
- Sens réel du service, de l’écoute et savoir faire preuve de discrétion
- Faire preuve de curiosité et rechercher les informations
- Capacité à s’intégrer dans un collectif et faire preuve d’esprit d’équipe
- Intégrité scientifique et rigueur
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 2 Effectuer des activités simples
- Spécialisation Chimie-biologie, biochimie
Éléments de candidature
Documents à transmettre
Personnes à contacter
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Ingénieur en expérimentation et bio-informatique biologiques
Il y a 22 heures
Bordeaux, Nouvelle-Aquitaine, France Inserm Temps plein 2 421 € - 3 534 € CDDStructure Délégation Régionale Inserm Nouvelle-Aquitaine - U 1312 dirigée par Monsieur Frédéric SALTEL Description de la structure Vous souhaitez mettre vos compétences au service d’un laboratoire de recherche contre le cancer ? Rejoignez l’unité de recherche BoRdeaux Institute of onCology (BRIC) située à l’Université de Bordeaux ! Cette...
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INGÉNIEUR EN EXPÉRIMENTATION ET BIO-INFORMATIQUE BIOLOGIQUES
Il y a 3 jours
Bordeaux, Aquitaine, France Inserm Temps pleinDescription : STRUCTURE DÉLÉGATION RÉGIONALE INSERM NOUVELLE-AQUITAINE - U 1312 DIRIGÉE PAR MONSIEUR FRÉDÉRIC SALTEL DESCRIPTION DE LA STRUCTURE Vous souhaitez mettre vos compétences au service d'un laboratoire de RECHERCHE contre le cancer ? Rejoignez l'unité de recherche BoRdeaux Institute of onCology (BRIC) située à...
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Ingénieur en techniques biologiques H/F
Il y a 4 jours
Bordeaux, Nouvelle Aquitaine, France CNRS Temps pleinVos missions en quelques mots Missions :L'ingénieur en techniques biologiques sera impliqué dans le développement et la mise en œuvre de protocoles de biochimie, de cytométrie en flux et de biologie cellulaire et moléculaire permettant d'étudier le contenu des synapses sur des modèles Rongeurs.Activités :Choisir, adapter et développer des...
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Ingénieur d'étude en biologie sur plateforme cytométrie/imagerie H/F
Il y a 3 semaines
Bordeaux, Nouvelle Aquitaine, France CNRS Temps pleinVos missions en quelques mots Missions :Dans le cadre du PEPR PROPSY, l’ingénieur a pour mission la planification et la mise en œuvre de techniques de biologie cellulaire, sur des prélèvements sanguins de patients présentant des symptômes neurologiques et psychiatriques avec soupçon d'auto-immunité. La détection de la présence des...
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Ingénieur en techniques biologiques H/F
Il y a 3 semaines
Bordeaux, Aquitaine, France Temps pleinDescription du Poste Les Missions L'ingénieur en techniques biologiques sera impliqué dans le développement et la mise en œuvre de protocoles de biochimie, de cytométrie en flux et de biologie cellulaire et moléculaire permettant d'étudier le contenu des synapses sur des modèles Rongeurs. L'Activité Choisir, adapter et développer des...
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Ingénieur en expérimentation et bio-informatique biologiques
Il y a 4 jours
Bordeaux, Nouvelle-Aquitaine, France Inserm Temps plein 2 422 € - 3 534 € CDDL’Inserm est le seul organisme public français entièrement dédié à la recherche biologique, médicale et en santé des populations. Il dispose de laboratoires de recherche sur l’ensemble du territoire, regroupés en 12 Délégations Régionales. Notre institut réunit 15 000 chercheurs, ingénieurs, techniciens et personnels administratifs, avec un...
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Ingénieur en techniques biologiques H/F
Il y a 4 jours
Bordeaux, France Choisir le Service Public Temps plein 2 662 € CDDInformations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UMR5297-MELDES0-329 Date de début de diffusion ...
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Ingénieur d'étude en biologie cellulaire et imagerie de super
Il y a 3 semaines
Bordeaux, France Choisir le Service Public Temps plein 2 662 € CDDInformations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UMR5297-MELDES0-327 Date de début de diffusion ...
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Ingénieur d'étude en biologie sur plateforme cytométrie/imagerie H/F
Il y a 3 semaines
Bordeaux, France Choisir le Service Public Temps plein 2 662 € CDDInformations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UMR5297-MELDES0-328 Date de début de diffusion ...
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Ingénieur d’étude en neurobiologie H/F
Il y a 3 semaines
Bordeaux, France Choisir le Service Public Temps plein 2 662 € CDDInformations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UMR5297-MELDES0-325 Date de début de diffusion ...
