H/F Ingénieur-e biologiste en traitement de données

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions :
Développer des méthodes de traitement et d’analyse des signaux EEG enregistrés pendant l’anesthésie, à partir des enregistrements provenant de Dan Longrois. Étudier les signatures EEG associées à la S-kétamine et les asymétries entre hémisphères droit et gauche. Contribuer au développement d’indicateurs et de modèles pour le suivi et, à terme, le pilotage de l’anesthésie dans un cadre de recherche.
Activités :
Structurer les enregistrements EEG et les métadonnées disponibles ; documenter leur qualité et leur synchronisation avec les événements anesthésiques.
• Développer des chaînes reproductibles de prétraitement : filtrage, détection et correction des artéfacts, segmentation et contrôle qualité.
• Réaliser des analyses spectrales et temps-fréquence ; caractériser les signatures associées à la S-kétamine selon les informations disponibles sur son administration.
• Quantifier les asymétries droite–gauche sur des dérivations homologues, en contrôlant les effets du montage, de la référence et des artéfacts.
• Développer et évaluer des indicateurs de suivi et des prototypes de modèles destinés à la recherche sur le pilotage de l’anesthésie.
• Documenter le code, assurer la traçabilité des analyses et présenter les résultats à l’équipe scientifique et clinique.
Compétences attendues :
• Traitement du signal, analyse de séries temporelles, statistiques et modélisation numérique.
• Programmation Python, notamment MNE et les bibliothèques scientifiques ; gestion de versions et analyses reproductibles.
• Connaissances en EEG, neurosciences et prétraitement des données neurophysiologiques.
• Apprentissage automatique apprécié ; capacité à évaluer les modèles et leurs limites.
• Rigueur, autonomie, travail avec des chercheurs et des cliniciens, anglais scientifique.

Contexte de travail :
L’Institut de biologie de l’ENS (IBENS) est un centre de recherche fondamentale qui mène des recherches originales visant à décrypter les mécanismes fondamentaux au cœur des processus biologiques.
Unité mixte ENS-CNRS-INSERM, l’IBENS accueille plus de 300 personnes regroupées en 30 équipes autonomes conduisant une recherche hautement collaborative et multidisciplinaire qui allie approches expérimentales et théoriques.
L’activité de recherche couvre des champs thématiques variés : Neurosciences, Biologie du développement, Génomique fonctionnelle, Écologie et biologie de l’évolution.
Plusieurs plateformes technologiques, notamment en imagerie, génomique, protéomique et bio-informatique sont à la disposition des chercheurs. Les recherches menées à l’IBENS bénéficient des interactions avec d’autres disciplines présentes à l’ENS (physique, chimie, sciences cognitives, mathématiques). L’IBENS est activement impliqué dans la formation des étudiants et jeunes chercheurs à tous les niveaux.
L’équipe d’accueil Mathématiques appliquées et Biologie computationnelle, dirigée par David Holcman comprend une dizaine de d
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Competences :
Mathématiques / physique / informatique / EEG neuroscience/ Simulations / analyse de données / python
Compétences relationnelles : interactions avec les partenaires biologiques

Contraintes et risques :
Travail sur écran et manipulation de données de santé ; respect de la confidentialité, des autorisations d’accès et des règles de sécurité applicables au projet. Les développements de pilotage seront évalués dans un cadre de recherche ; toute utilisation clinique nécessitera une validation et un cadre adaptés. Déplacements ou présence au bloc : à confirmer.