Ingénieur-e biologiste en traitement de données

Au cœur de l’Oncopole de Toulouse, le CRCT, avec tous ses partenaires (institutionnels, universitaires, cliniques, industriels, caritatifs…), stimule l’innovation en termes de recherche et d’enseignement dans la lutte contre le cancer.

Le CRCT conduit une approche intégrée entre la recherche, les soins et l’enseignement, dans une logique transversale et multidisciplinaire. Il accueille 18 équipes de recherche très performantes et huit installations centrales regroupées au sein d'un centre technologique.

La personne recrutée au sein de l'équipe Network Biology for Immuno-oncology " NetB(IO)² " aura pour mission de collaborer à l'analyse de plusieurs ensembles de données disponibles dans l'équipe, en particulier à l'analyse des données de transcriptomique obtenus à partir d'expériences de co-culture cellulaire pour la création de simulations de ces systèmes sur ordinateur, en utilisant les logiciels existants et en développant de nouveaux outils si nécessaire.

Catégorie : A

Corps : Ingénieur d'Etudes

Emploi-type : A2A41 : Ingénieur-e en traitement de données

Rémunération : A partir de 2.421,65€ brut mensuel, en fonction de l'expérience professionnelle sur des postes de niveau équivalent

Pour en savoir plus : 

• Sur l’Inserm : https://www.inserm.fr/ ; site RH : https://rh.inserm.fr/Pages/default.aspx
• Sur la politique handicap de l’Inserm et sur la mise en place d’aménagements de poste de travail, contactez la Mission Handicap : emploi.handicap@inserm.fr

Activités principales :

• Activités à la paillasse sur un système de co-culture de cellules in vitro
• Développement de codes pour la transcriptomique, l'analyse de données omiques
• Développement de modèles mathématique pour la simulation de ces culture in silico

L'équipe NetB(IO)² "est composée de plusieurs post-doctorants et doctorants ayant une formation mixte en biologie ou en sciences quantitatives, ainsi que d'un autre bio-informaticien, et d'un groupe indépendant de biologistes travaillant sur des expériences en laboratoire.

La personne recrutée va travailler en particulier sur une co-culture des cellules cancéreuse dans un microenvironnement tumoral.

Connaissances :

• Expérience en co-culture des cellules humaines
• Maîtrise du phénotypage cellulaire par FACS
• Connaissances théoriques en immunologie
• Expérience en analyses de données RNAseq
• Utilisation d’outils bio-informatiques et travail en laboratoire de bio-informatique
• Expérience avec le logiciel PhysiCell pour la simulation des modèles individu-centrés (agent based) d’interaction cellulaire
• Compétences en science des données et statistiques
• Utilisation de systèmes d'exploitation basés sur Unix
• Maîtrise des langages R, python, shell scripting, avec une capacité à apprendre d'autres langages de programmation
• Expérience avec Github et le versioning

Savoir-faire :

• Savoir synthétiser les résultats de recherche sur un document PowerPoint et le présenter à ses collègues
• Garantir la qualité et la pertinence des outils d’analyse et des résultats
• Excellentes aptitudes à la communication, orale et écrite en Anglais, à l'organisation et à la gestion de projets

Aptitudes :

• Capacité à travailler de manière autonome tout en s’intégrant pleinement dans une équipe pluridisciplinaire
• Savoir accueillir et intégrer les retours pour ajuster ses pratiques professionnelles et garantir une progression constante
• Faire preuve de solidarité et partage d’expertise en apportant un soutien aux autres collègues en cas de besoin
• Prioriser et planifier efficacement son travail pour respecter les échéances
• Faire preuve de rigueur
• Esprit d’initiative

Niveau de diplôme et formation(s) : M2 bio-informatique / biologie

Avantages : 

• 32 jours de Congés Annuels et 13 jours de RTT
• Mutuelle santé collective obligatoire MGEN avec participation de l’employeur à hauteur de 50% pour le socle de base et à hauteur de 50% dans la limite de 5€ pour les options
• Prévoyance collective facultative avec participation de l’employeur à hauteur de 7€ pour le socle de base
• Restauration collective subventionnée sur place
• Comité d'action sociale (prestations sociales, culturelles, sportives)
• Transports publics remboursés à 75%
• Forfait mobilité durable