Chercheur postdoctorat/Chercheuse postdoctorat en microbiologie

🔬 Poste : Chercheur(e) H/F en microbiologie – Projet ANR sur les sidérophores et le microbiote intestinal 📍 Localisation : Illkirch-Graffenstaden (Strasbourg, France) | 📅 CDD 9 mois (début : 9 novembre 2026) | 💰 Salaire : 3 071,50 – 3 501,51 €/mois 📌 Contexte scientifique : Rejoignez l’équipe MMBCA (Métaux et Microorganismes : Biologie, Chimie et Applications), dirigée par le Dr. Isabelle Schalk et le Dr. Gaetan Mislin, au sein du laboratoire BSC (UMR 7242, CNRS/Université de Strasbourg). Ce poste s’inscrit dans un projet financé par l’ANR visant à décrypter le rôle des sidérophores — des molécules produites par les bactéries intestinales pour capter le fer — dans la compétition microbienne et la résistance à la colonisation par des pathogènes. Ce projet multidisciplinaire combine : ✔ Microbiologie moléculaire ✔ Biochimie ✔ Analyses génomiques ✔ Modèles cellulaires et co-cultures 🎯 Objectifs :
• Caractériser la production de sidérophores chez des souches bactériennes intestinales (commensales et pathogènes).
• Étudier leur impact sur la dynamique du microbiote et les mécanismes de compétition.
• Développer des stratégies probiotiques ou thérapeutiques pour moduler le microbiote. 🔬 Missions clés :
• Développement de protocoles pour détecter et quantifier les sidérophores en conditions anaérobies (milieu limitant en fer).
• Étude des interactions entre bactéries productrices de sidérophores, microbiote résident et pathogènes (modèles in vitro, co-cultures, modèles cellulaires).
• Analyses moléculaires et cellulaires :
• Techniques : PCR, qPCR, séquençage, cytométrie en flux, tests de compétition bactérienne, microscopie à fluorescence.
• Outils : ImageJ/Fiji pour le traitement d’images.
• Construction de souches mutant (mutagenèse ciblée, souches rapporteurs fluorescents).
• Analyse bioinformatique et statistique des données pour identifier les corrélations entre production de sidérophores, composition du microbiote et résistance à la colonisation.
• Rédaction d’articles scientifiques et présentations en conférences internationales. 👤

Profil recherché
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Formation:
Doctorat en microbiologie, biologie moléculaire, biochimie ou domaine connexe.
• Expérience souhaitée : 1 à 4 ans d’expérience post-doctorale ou équivalente, avec une expertise avérée en :
• Culture bactérienne anaérobie.
• Manipulation de souches pathogènes en niveau de biosécurité L2.
• Modèles cellulaires infectieux (culture de cellules eucaryotes, infections bactériennes).
• Cytométrie en flux, microscopie à fluorescence, traitement d’images (ImageJ/Fiji).
• Mutagenèse ciblée et construction de souches rapporteurs.
• Langues : Anglais C2 (indispensable pour la rédaction d’articles et les collaborations internationales).
• Soft

skills:
Autonomie, rigueur, esprit d’équipe, capacité à travailler dans un environnement pluridisciplinaire (biologistes, chimistes). 🏢 Environnement de travail :
• Laboratoire BSC (UMR 7242) : ~100 personnes, équipe MMBCA de ~23 chercheurs (biologistes et chimistes).
• Accès : Tram depuis Strasbourg.
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Avantages:
• Restaurant collectif CROUS sur le campus.
• Prise en charge des transports à 75% + forfait mobilité jusqu’à 300 €.
• Participation à la mutuelle, 44 jours de congés + RTT/an, télétravail possible.
• Comité d’Action Sociale (activités sportives, loisirs, billetterie). ⚠️ Contraintes :
• Travail en laboratoire de niveau de biosécurité L2.
• Respect strict des protocoles de sécurité pour la manipulation de souches pathogènes.