Chargé-e de Recherche en Génomique Structurale

Il y a 7 mois


Montpellier, France INRAE Temps plein

34398 MONTPELLIER _

**RETOUR À LA LISTE DES POSTES DE LA CAMPAGNE**

**Présentation d'INRAE**:
L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche placé sous la double tutelle du ministère en charge de l’agriculture et du ministère en charge de la recherche.

C'est un acteur majeur de la recherche et de l’innovation créé le 1er janvier 2020. Institut de recherche finalisé issu de la fusion entre l’Inra et Irstea, INRAE rassemble une communauté de 12 000 personnes, avec 268 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France.

L’institut se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal, et se classe 11ème mondial en écologie-environnement. Face à l’augmentation de la population, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE construit des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

**Environnement de travail, missions et activités**:
Au cœur du dispositif d’analyse fine du pangénome de la vigne, le/la chercheur.e interagira à la fois avec les collègues du Centre de rressources génétiques Vigne, les scientifiques impliqués dans l’étude des bases génétiques de caractères d’intérêt, les scientifiques impliqués dans la physiologie et la génomique fonctionnelle et la prédiction génomique, de DAAV et des autres équipes du groupe Vigne du Département BAP.

Mission:
Vous déveloperez un projet de recherche visant à l’identification des polymorphismes au niveau du génome entier pour définir le ‘Pangénome’ de Vitis vinifera i.e. identifier les gènes appartenant aux parties « Cloud & shell » du pangénome, enrichies pour des fonctions « bénéfiques » (défenses, développement, adaptation; Gordon et al, 2017), des gènes liés aux stress abiotiques et contrôlant la floraison (Tranchant-Dubreuil et al, 2019), ou participant à des voies métaboliques spécifiques (exemple / soja : biosynthèse des acides gras ; Liu et al, 2020) et leur diversité. Une attention particulière sera aussi apportée aux polymorphismes de type « Presence-Absence » (PAV) et « Copy Number Variation » (CNV) qui ont été une source importante de variation génétique au cours de la domestication (Lye & Purugganan, 2019, Zhou et al 2019) et aux éléments mobiles (transposons et rétroéléments) et leur impact sur l’adaptation et la résilience.

Activités:
Les travaux débuteront sur la base de données des séquences complètes (assemblage haplotypique) de génomes disponibles dans l’équipe (Cabernet Franc, Chenin, Madeleine Noire des Charentes, Merlot, Pinot) et des données disponibles dans les bases de données internationales. Nous envisagerons ensuite le séquençage profond Pacbio des core-collections de Vitis vinifera (panel 279, core C4) choisies pour présenter un fort gradient environnemental ou sur lesquelles des données phénotypiques précises seront disponibles soit dans le cadre du CRB Vigne soit de projets de recherche en cours (G2WAS) ou à venir (implantation du panel 279 sur le domaine expérimental de Pech Rouge).

L’étude de la diversité génétique à cette échelle fine, permettra également d’identifier des cibles potentielles pour validation fonctionnelle par édition et éclairera les programmes de création variétale et les outils de prédiction génomique en prenant mieux en compte, en plus de la diversité SNP, les autres types de variation du génome : PAV, CNV, éléments transposables. En collaboration avec d’autres équipes d’AGAP et du groupe vigne, l’étude des marqueurs épigénétique pourra également être réalisée (petits ARNs, méthylation,).

**Permis de conduire recommandé**

***

**Formations et compétences recherchées**:
**Doctorat**

Doctorat en génomique structurale, avec des compétences en génomique et génétique des populations et des compétences solides en bio-informatique.

De bonnes connaissances en statistiques, notamment en statistiques bayésiennes et concepts de programmation et logiciel R sont également demandées.

Une connaissance préalable de la diversité de la vigne (ampélographie) serait un plus.

**Votre qualité de vie à INRAE**:
En rejoignant INRAE, vous bénéficiez:

- de 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activ



  • Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : jeudi 31 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Checheur en biologie structurale (H/F)** Référence : UMR5048-MANLEP-006 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de publication : jeudi...


  • Montpellier, France Qualtech Groupe Temps plein

    **Présentation de la société**: Le Groupe Qualtech à travers la société ADNId est un laboratoire de service en génomique, spécialisé dans le développement et l’utilisation diagnostique de bio-marqueurs génétiques ADN. ADNid est installé sur le Campus International de Baillarguet à Montferrier sur Lez (34) et dispose d’un laboratoire...

  • Offre de Thèse

    Il y a 3 mois


    Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : jeudi 24 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Offre de thèse (H/F) : Profilage Intégratif de Virus par Analyse Mutationnelle de Génome Entier** Référence : UMR5048-MANLEP-004 Nombre de Postes :...

  • Projet These

    Il y a 2 mois


    Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mardi 26 novembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:PROJET THESE H/F: Développement de biosenseurs fluorescents pour la détection de kinases chez les virus géants (Pandoravirus)** Référence :...


  • Montpellier, France [E-ETHYLENE] Valorisation du CO2 en e-ethylène et autres e-produits Temps plein

    **Contexte marché et proposition de valeur** Les émissions de CO2 croissantes ont un impact considérable sur le climat de notre planète. Au regard de l’urgence de la situation, de nombreuses équipes de recherche imaginent et développent des technologies, notamment dans la conversion du CO2 en CO, en acide formique ou en méthanol. Cependant, la...


  • Montpellier, France INRAE Temps plein

    Montpellier _ **RETOUR À LA LISTE DES RÉSULTATS** **Présentation INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées...


  • Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : jeudi 26 septembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:H/F Thèse en génétique de la Drosophile et en Biologie moléculaire** Référence : UMR9002-JERMAN-002 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail :...


  • Montpellier, France LORELL E-COMMERCE SARL Temps plein

    **POSTE A POURVOIR**: Spécialiste des chaussures femmes, homme et enfants 100% made in Spain, notre mission est de promouvoir le style, confort et bonheur de nos clients. De formation marketing digital, communication web ou web marketing, tu es passionné(e) par la création de vidéos et la communication sur les réseaux sociaux. Si tu veux apporter ton...


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    34000 MONTPELLIER _ **RETOUR À LA LISTE DES POSTES DE LA CAMPAGNE** **Présentation d'INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche placé sous la double tutelle du ministère en charge de l’agriculture et du ministère en charge de la...


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  • Thèse (H/F)

    Il y a 4 mois


    Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : jeudi 26 septembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Thèse (H/F) : Génomique de l'adaptation à l'envrionnement portuaire** Référence : UMR5554-NICBIE-005 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail :...


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    **CHARGE DE VALORISATION** Le CHU de Montpellier est le **1er employeur de l’Hérault et établissement support du Groupement Hospitalier de Territoire de l’Est-Hérault.** Le CHU de Montpellier s’organise autour de 12 pôles hospitalo-universitaires. Toutes les spécialités médico-chirurgicales, y compris les plus pointues, sont représentées: -...


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  • Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : lundi 9 décembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Chercheur(e) H/F en Virologie et Microscopie Photonique** Référence : UMR9004-DELMUR-005 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de...


  • Montpellier, France LIP Solutions RH Montpellier Santé Temps plein

    Avec 160 agences d’emploi spécialisées par domaine d’activité et réparties sur l’ensemble du territoire, le Groupe LIP Intérim et Recrutement propose toute l’année de nombreux postes en CDI, CDD et Intérim. Nos consultants se consacrent exclusivement au recrutement de professionnels du tertiaire, de l’ingénierie, des services, de la santé...


  • Montpellier, France INRAE Temps plein

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  • Constructeur Bois

    Il y a 7 mois


    Montpellier, France Actual Interim Insertion (A2i) SUD MONTPELLIER Temps plein

    **Votre Mission**: Notre agence ACTUAL INTERIM INSERTION (A2I) recherche un Constructeur Bois (H/F) pour l'un de nos client ACTUAL INTERIM INSERTION (A2I), numéro 1 de l'Entreprise de Travail Temporaire d'insertion Nous recrutons et suivons des jeunes peu qualifiés, seniors, familles monoparentales, des personnes en situation de handicap, des demandeurs...