Doctorant F/H Shape analysis of microstructure-augmented whiter matter fascicles

il y a 4 semaines

Rennes, France INRIA Temps plein

Contexte et atouts du poste

Magnetic resonance imaging (MRI) and in particular diffusion MRI (dMRI) provide detailed information about the macroscopic organisation of brain white matter (WM) fiber bundles (see Figure), with a method called fiber tractography. Complementary to the geometry of fibers, dMRI is also sensitive to the microscopic tissue structure and its alteration with pathology. The joint analysis of white matter fascicles and their associated microstructure organisation requires the development of specific mathematical representations.

Mission confiée

The main objective of this thesis will be the development of mathematical models of microstructure-augmented fascicle (MAF), which convey both the macro-structural information provided by tractography and the microstructural information provided by the diffusion models along the WM fascicles. In the context of the PASTRAMI (**Pa**tient-specific **s**tatistics for micros**tr**ucture-**a**ugmented connecto**mi**cs) collaborative project (funded by the PRC program, agence nationale de la recherche, 2023-2028), these representations will be used to derive patient-specific biomarkers of functional recovery in patients suffering from severe traumatic brain injury.

Principales activités

We will develop upon a shape analysis frameworks such as the LDDMM (Large Diffeomorphic Metric Mapping) framework that relies on Riemannian geometry and is well adapted to the study of anatomical structures, to construct the models for the representation of fiber bundles (which can be defined as 1-dimensional curves or 2-dimentional surfaces in R3) and their associated microstructure. In continuation, we will also analyse the brain connectome, which represents the network of connected gray matter regions in the brain. We will build upon methods developed for the analysis of graphs with complex data.

Compétences

We look for candidates strongly motivated by challenging research topics in neuroimaging. The applicant should present a good background in applied mathematics. Basic knowledge in image processing would be a plus. Good knowledge of computer science aspects is also mandatory, especially in Python and C++.

Avantages

Prise en charge partielle des frais de transport en commun sur le trajet domicile-travail ou
FMD. Restauration subventionnée Prise en charge partielle des frais de mutuelle Possibilité de télétravail (à hauteur de 90 jours annuels) et d'aménagement du temps de travail

Rémunération

Salaire mensuel brut de 2 100 € les deux premières années et 2 190€ la troisième année.

  • Doctorant (F/H) Shape Analysis of

    il y a 4 semaines

    Rennes, France Inria Temps plein

    **Type de contrat **:CDD **Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent **Fonction **:Doctorant **A propos du centre ou de la direction fonctionnelle**: Le centre Inria de l'Université de Rennes est un des neuf centres d’Inria et compte plus d'une trentaine d’équipes de recherche. Le centre Inria est un acteur majeur et reconnu dans le...

  • Doctorant (F/H) Anatomical and Microstructure

    il y a 2 semaines

    Rennes, France Inria Temps plein

    **Type de contrat **:CDD **Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent **Fonction **:Doctorant **A propos du centre ou de la direction fonctionnelle**: Le centre Inria Rennes - Bretagne Atlantique est un des huit centres d’Inria et compte plus d'une trentaine d’équipes de recherche. Le centre Inria est un acteur majeur et reconnu dans le...

  • Doctorant F/H Anatomical and microstructure informed tractography for connectivity evaluation

    il y a 1 mois

    Rennes, France INRIA Temps plein

    Contexte et atouts du poste Diffusion MRI (dMRI) quantifies the diffusion of water molecules (constrained by their environment), enabling us to infer a number of microstructure parameters, such as the arrangement of nerve fibers, the different tissues making them up and their properties (axon diameter, proportion of neuronal cell bodies, etc.)....

  • Doctorant / Doctorante en Informatique (H/F)

    il y a 5 jours

    Rennes, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : lundi 27 mai 2024 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Doctorant / Doctorante en informatique (H/F)** Référence : UMR6074-ANNORG-006 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : RENNES Date de publication : lundi 6 mai 2024 Type de contrat...

  • Phd Position F/m Phd Position F/m Interacting with

    il y a 2 semaines

    Rennes, France Inria Temps plein

    Le descriptif de l’offre ci-dessous est en Anglais_ **Type de contrat **:CDD**Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent**Fonction **:Doctorant**Niveau d'expérience souhaité **:Jeune diplôméA propos du centre ou de la direction fonctionnelle The Inria Centre at Rennes University is one of Inria's eight centres and has more than thirty...

  • Optical Design Engineer for Augmented Reality Display

    Il y a 3 mois

    Rennes, France Optinvent Temps plein

    Job Description : Definition and design of complex optical systems for imagery and illumination Drafting of technical specifications based on customer input, definition of key performance criteria Interfacing with customers to optimize specific optical systems and performance analysis taking into account their requirements Development of algorithmic...

  • Doctorant en Physique Appliquée à L'environement

    il y a 3 semaines

    Rennes, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : vendredi 12 avril 2024 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Doctorant en Physique Appliquée à l'Environement (H/F)** Référence : UMR6118-JORHEY-010 Nombre de Postes : 2 Lieu de travail : RENNES Date de publication : vendredi 22...

  • Large Scale Code History Analysis for Improving

    il y a 4 semaines

    Rennes, France IRISA Temps plein

    **Large scale code history analysis for improving software stability**: - Réf **ABG-122828** - Sujet de Thèse- 12/04/2024- Contrat doctoral- IRISA- Lieu de travail- Rennes - Bretagne - France- Intitulé du sujet- Large scale code history analysis for improving software stability- Champs scientifiques- Informatique **Description du...

  • Doctorant (F/H) Limitation de La Taille Des

    il y a 3 semaines

    Rennes, France Inria Temps plein

    **Type de contrat **:CDD **Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent **Fonction **:Doctorant **Niveau d'expérience souhaité **:Jeune diplômé **A propos du centre ou de la direction fonctionnelle**: Le centre Inria de l'Université de Rennes est l'un des neuf centres d’Inria et compte plus d'une trentaine d’équipes de recherche. Le...

  • Doctorant (F/H) Limitation de La Taille Des

    il y a 2 semaines

    Rennes, Bretagne, France Inria Temps plein

    **Type de contrat **:CDD**Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent**Fonction **:Doctorant**Niveau d'expérience souhaité **:Jeune diplômé**A propos du centre ou de la direction fonctionnelle**:Le centre Inria de l'Université de Rennes est l'un des neuf centres d'Inria et compte plus d'une trentaine d'équipes de recherche. Le centre Inria est...

  • Gdpr-compliant Sharded Blockchain

    il y a 2 semaines

    Rennes, France Inria Temps plein

    Le descriptif de l’offre ci-dessous est en Anglais_ **Type de contrat **:CDD**Contrat renouvelable **:Oui**Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent**Autre diplôme apprécié **:PhD**Fonction **:Ingénieur scientifique contractuelA propos du centre ou de la direction fonctionnelle The Inria Rennes - Bretagne Atlantique Centre is one of Inria's...

  • Web Front-end Testing: Large Scale Analysis and

    il y a 4 semaines

    Rennes, France IRISA Temps plein

    **Web front-end testing: large scale analysis and techniques improvement**: - Réf **ABG-122829** - Sujet de Thèse- 12/04/2024- Contrat doctoral- IRISA- Lieu de travail- Rennes - Bretagne - France- Intitulé du sujet- Web front-end testing: large scale analysis and techniques improvement- Champs scientifiques- Informatique **Description du...

  • Phd Position F/m Reliability Enhancement of

    il y a 4 semaines

    Rennes, France Inria Temps plein

    Le descriptif de l’offre ci-dessous est en Anglais_ **Type de contrat **:CDD **Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent **Fonction **:Doctorant **A propos du centre ou de la direction fonctionnelle**: The Inria Rennes - Bretagne Atlantique Centre is one of Inria's eight centres and has more than thirty research teams. The Inria Center is a...

  • Security Researcher

    il y a 4 semaines

    Rennes, France Ericsson Temps plein

    Join Ericsson R&D Center in Massy - a part of Paris-Saclay, one of the largest innovation zones in Europe. Located south of Paris, the hub, aspiring to become "the French Silicon Valley"! Being within the Paris-Saclay hub allows us to benefit from its extensive R&D infrastructure, leverage the richness of its ecosystem, and foster industrial and academic...

  • Doctorant(E) (H/F) super-réseaux de Moiré Dans

    il y a 2 semaines

    Rennes, Bretagne, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes:- Français- AnglaisDate Limite Candidature : samedi 22 avril 2023**Informations générales**:**Intitulé de l'offre **:Doctorant(e) H/F "Super-réseaux de moiré dans des hétérostructures de dichalcogénures de métaux de transition"**Référence : UMR6251-THOJAO-001Nombre de Postes : 1Lieu de travail...

  • Phd Position F/m Reliability and Security of Large

    il y a 3 semaines

    Rennes, France Inria Temps plein

    Le descriptif de l’offre ci-dessous est en Anglais_ **Type de contrat **:CDD **Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent **Fonction **:Doctorant **A propos du centre ou de la direction fonctionnelle**: The Inria Rennes - Bretagne Atlantique Centre is one of Inria's eight centres and has more than thirty research teams. The Inria Center is a...

  • Doctorant (F/H) Commande Partagée Par Cartographie

    il y a 5 jours

    Rennes, France Inria Temps plein

    **Type de contrat **:CDD **Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent **Fonction **:Doctorant **A propos du centre ou de la direction fonctionnelle**: Le centre Inria Rennes - Bretagne Atlantique est un des huit centres d’Inria et compte plus d'une trentaine d’équipes de recherche. Le centre Inria est un acteur majeur et reconnu dans le...

  • Phd Position at Ietr

    il y a 3 semaines

    Rennes, France INSA RENNES Temps plein

    **About us**: INSA Rennes, a founding member of the INSA Group, is the largest public engineering school in Brittany. It welcomes 2,200 students and apprentices and graduates more than 340 engineers, 60 masters and 40 PhDs per year. Composed of 10 teaching departments, including 7 specialties and an apprenticeship program, and supervised by 6 research...

  • Phd Position F/m Reliability and Security of Large

    il y a 2 semaines

    Rennes, Bretagne, France Inria Temps plein

    Le descriptif de l'offre ci-dessous est en Anglais_**Type de contrat **:CDD**Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent**Fonction **:Doctorant**A propos du centre ou de la direction fonctionnelle**:The Inria Rennes - Bretagne Atlantique Centre is one of Inria's eight centres and has more than thirty research teams. The Inria Center is a major and...

  • Synthesis of Functionalized Lipids for Drug Delivery

    il y a 2 semaines

    Rennes, Bretagne, France Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Rennes - UMR CNRS 6226 Temps plein

    Site web:Poste et missions:Mobilité géographique: EuropéenneTélétravail: OccasionnelPrise de fonction: 02/10/2023Profil:Applicants must have obtained a PhD in organic chemistry and have skills/knowledge in NMR analysis, chemistry of lipids and possible in formulation of nanoparticles for drug delivery. Moreover, the ability to work as part of french and...