Mission de Stage «auto-encoders Dans La Réduction

Il y a 2 mois


Lyon, France BIOASTER Temps plein

BIOASTER est l'unique Institut de Recherche Technologique dans le domaine de la santé en France. Dédié à l'infectiologie et à la microbiologie, il rassemble les compétences de l'industrie et de la recherche publique pour répondre aux enjeux de santé publique liés aux maladies infectieuses. _
- Fondation de Coopération scientifique dotée d'infrastructures et de moyens propres, l'IRT BIOASTER s'inscrit résolument dans une optique de développement des compétences et en cela, propose chaque année des missions de stage riches en enseignements à des étudiants de niveau ingénieur ou master 2._
- Nous recherchons un(e) stagiaire motivé(e), ayant des bases théoriques complétées d’un premier niveau de pratique et se destinant à la R&D pour réaliser la mission suivante :_

**Poste**:
**I/ MISSION et objectif**:
La réduction dimensionnelle est une étape essentielle dans l’analyse des données des OMICS. Elle permet de réduire le bruit, faciliter la visualisation, améliorer l'efficacité des calculs et améliorer l'interprétabilité. Cette simplification des données de grande dimension évite le surajustement du modèle et révèle des tendances significatives, facilitant ainsi la compréhension de systèmes biologiques complexes.

L'analyse en composantes principales (ACP), une méthode couramment utilisée, projette les données sur des axes orthogonaux (composantes principales) pour maximiser la capture de la variance. Cependant, dans certains cas, il se peut qu’elle ne reflète pas efficacement les relations complexes et non linéaires. En revanche, les auto-encodeurs, une approche de Deep Learning, peuvent capturer des modèles et des relations complexes, à la fois linéaires et non linéaires. Ils offrent une plus grande flexibilité pour les ensembles de données complexes, mais nécessitent davantage de ressources informatiques et de choix d’hyper-paramètres.

L'objectif de ce stage est de comparer les techniques de réduction dimensionnelle existantes (ex. PCA) et les approches Deep Learning (ex. auto-encodeurs). Par ailleurs un objectif sera de mieux comprendre deux frameworks de Deep Learning fréquemment utilisés : Tensorflow et PyTorch.

Activités principales:

- Identifier des méthodes prometteuses basées sur les auto-encoders
- Appliquer les méthodes sélectionnées sur des jeux de données réels et/ou simulés, prétraités au préalable.
- Évaluer leur efficacité à capturer des caractéristiques significatives, à préserver la structure des données et à faciliter l'analyse en aval. Critères d'évaluation à déterminer.
- Produire un rapport analytique des résultats

**II. **RATTACHEMENT**

La mission sera rattachée à l’unité technologique Sciences des Données, Gestion des Données et Solutions Numériques (xData).

**Profil**:
Niveau : M 2 / (BAC +5) Bioinformatique /biostatistique /Data science

**_
Compétences:_**
- Maitrise des langages de programmation R & Python. La connaissance d’un framework de Deep Learning (ex : TensorFlow, PyTorch) est un plus.
- Maitrise des méthodes statistiques multivariées : PCA, PLS, analyse canonique de corrélation et de machine learning: SVM, forêt d’arbres décisionnels
- Connaissance en life science est un plus
- Bonnes capacités de rédaction
- Anglais scientifique

**_ Qualités personnelles:_**
- Aisance relationnelle
- Adaptabilité
- Rigueur, organisation et méthode
- Capacité à travailler en équipe

**Autres informations**:
Durée 6 mois



  • Lyon 8e, France Handicap International Temps plein

    Handicap International / Humanité & Inclusion (HI) est une association de solidarité internationale indépendante et impartiale, qui intervient dans les situations de pauvreté et d’exclusion, de conflits et de catastrophes. Œuvrant aux côtés des personnes handicapées et vulnérabilisées, elle agit et témoigne pour répondre à leurs besoins...


  • Lyon, France Stage Agent d'accueil - Médiation Temps plein

    **Stage / Ain / **STAGE AGENT D'ACCUEIL - MÉDIATION** **[STAGE] Stage Agent d'accueil - médiation**: L'écomusée Maison de Pays en Bresse est géré par une association loi 1901, créée le 24 janvier 1985 par un groupe de Bressans passionnés. Depuis, ils collectent, entretiennent, répertorient et partagent la richesse du patrimoine de la Bresse du...


  • Lyon, France Groupama Rhône Alpes Auvergne Temps plein

    **Description du poste**: **Intitulé du poste**: STAGE - Gestionnaire flotte auto H/F **Description de la mission**: Au sein du service Prestations & Parc auto, vous êtes rattaché(e) au pôle chargé de la gestion de la flotte automobile de Groupama Rhône-Alpes Auvergne. Vos missions en tant que stagiaire sont les suivantes: - Gérer les tâches...


  • Lyon, France ALIX FORMATION - ECF Temps plein

    Après une période d'intégration, vous suivrez la formation des élèves qui vous seront confiés (leçons, bilans, examens). Et pour ceux qui le souhaitent, vous pourrez intervenir sur les formations BE, B96, véhicules aménagés, stages code et les animations en sécurité routière (entreprises, seniors ) Une approche différente de l'enseignement de...

  • Stage Vinci Eurovia

    il y a 1 mois


    Lyon, France mozaik RH Temps plein

    **Description de l'entreprise**: **Description de l'offre**: Au sein de la Délégation du Centre-Est, vous aurez pour missions de recenser les modes de transports existants et les volumes de produits échangés. Vous étudierez les modes de transports alternatifs (train et voie fluviale). Vos activités principales seront les suivantes : Recensement des...

  • Educateur de Football

    il y a 1 mois


    Lyon, France LE FIVE OL Temps plein

    LE FIVE OL recrute un(e) ou des éducateurs (éducatrices) avec un statut auto-entrepreneur pour le lancement des stages OL VALLEE afin d’encadrer les enfants sur une semaine de stage multi-activité au sein d'OL VALLEE **Missions principales**: - Suivi d’un groupe d’enfant pendant les vacances - Assurer l'encadrement d'un groupe d'enfant (8 à 12...


  • Lyon, France Aldes Temps plein

    Vénissieux- Auvergne-Rhône-Alpes- Stage**Pourquoi nous rejoindre ?****: **« Insuffler l'énergie d'avancer** - Depuis 1925, chez ALDES groupe, nous sommes convaincus que le sens donné à nos actions doit nourrir notre souffle commun. Nos projets. Nos innovations._ - Nous savons que nos énergies collectives se démultiplient en se mettant en mouvement...


  • Lyon, France Latem Industries Temps plein

    Vous recherchez un stage pour vous éclater dans la communication, alors rejoignez-nous. Qui sommes-nous ? Le groupe HEXALEAN bien entendu. Nous sommes spécialisés dans le mécano soudure, tôlerie, découpe laser, et nous recherchons un stagiaire en communication. Nous sommes présents dans le département de l’Ain, avec 4 sites et 1 site dans le...

  • Stage Qhe

    il y a 4 semaines


    Lyon, France Smurfit Kappa Rhône-Alpes Temps plein

    La cartonnerie SMURFIT KAPPA Rhône-Alpes (130personnes) est un établissement de SMURFIT KAPPA FRANCE, situé au sud de Lyon. Nos produits de packaging innovants et respectueux de l’environnement, sont soutenus par un service de haut niveau et une organisation tournée vers le client. Nous développons des formes et des solutions fonctionnelles,...

  • Stage Qhe

    il y a 4 semaines


    Lyon, France Smurfit Kappa Rhône-Alpes Temps plein

    La cartonnerie SMURFIT KAPPA Rhône-Alpes (130personnes) est un établissement de SMURFIT KAPPA FRANCE, situé au sud de Lyon. Nos produits de packaging innovants et respectueux de l’environnement, sont soutenus par un service de haut niveau et une organisation tournée vers le client. Nous développons des formes et des solutions fonctionnelles,...


  • Lyon 2e, France Club Employés Temps plein

    Leur mission : développer le bien-être des salariés au quotidien ! Aujourd’hui il existe encore de nombreuses inégalités entre les avantages proposés aux salariés des entreprises françaises. Leur mission est d’y remédier ! Club Employés propose des centaines de produits et de services à prix réduits aux salariés des entreprises...


  • Lyon, France VILLE DE VILLEFRANCHE SUR SAONE Temps plein

    Filière: **Administrative** Métier: **Urbanisme** Catégorie: **B** **Rédacteur territorial** CDD ou titulaire **Villefranche-sur-Saône** **(Rhône 69)** *** **Titulaire ou contractuel** Expérience: **Indifférent** Rémunération statutaire + régime indemnitaire Date limite: **26/06/2023** **Descriptif et missions**: INSTRUCTEUR DES...

  • Gestionnaire Parc Auto

    il y a 1 mois


    Lyon, France Ville de Saint-Martin-d'Hères Temps plein

    La commune de Saint-Martin-d’Hères, en pleine croissance démographique (39 000 habitants), est la 2ème ville du département de l’Isère. Elle est au cœur du développement de nombreux projets et accueille le Domaine Universitaire avec près de 50 000 étudiants et employés. Ville dynamique, innovante et solidaire, attachée à un service public de...


  • Lyon, France RTE France Temps plein

    RTE construit, transforme, exploite et maintient le réseau public de transport d'électricité français. Sur le plus grand réseau d'Europe, nous équilibrons la production et la consommation, acheminons l'électricité indispensable au quotidien de chacun et à l'activité des industries, et garantissons la solidarité électrique entre les territoires,...


  • Lyon, France Métropole de Lyon Temps plein

    Type d'offre: - Stage **Famille de métier**: Communication- Référence: - 2024-11846 - Service: - 14/06/2024 Date de publication : 23/05/2024 La Métropole de Lyon est une collectivité territoriale composée de 9 600 agents qui réalisent des missions de service public pour le compte de l'agglomération lyonnaise. Elle intervient dans les domaines...

  • Chargé de Missions RH

    il y a 4 semaines


    Lyon, France TK Elevator France Temps plein

    La mission est basée à notre agence de **Lyon (69)**. Au sein de l'équipe projet, la mission principale consiste à accompagner la mise en place et l’implémentation de la Nouvelle Classification issue de la Nouvelle Convention Collective de la Métallurgie. **Stage rémunéré de 3 à 6 mois à pourvoir dès que possible.**. Au sein de l’équipe...


  • Lyon, France Win Sport School Temps plein

    **Coordinateur événementiel (H/F) en stage**: **Référence**: **Domaine**:Bachelor Management du Sport**: **Type de poste**: Coordinateur événementiel**: **Type de contrat**:Stage**: **Secteur**:Evenementiel**: **Localisation**:Lyon****: 2020-12-16 WIN Lyon recherche, pour l'une de ses entreprises partenaires, un(e) **Coordinateur(trice)** en stage...

  • Chargé de Mission Stages

    il y a 4 semaines


    Lyon 5e, France ECAM LaSalle Temps plein

    Au sein du service Stages de l’école ECAM LaSalle, le chargé de mission stages prend en charge l’ensemble du processus de gestion des stages, de la recherche du premier stage à la diplomation. Outre les aspects administratifs, il contribue ainsi à l’accompagnement de nos élèves-ingénieurs. **Vous avez le profil pour nous rejoindre si** Vous...


  • Lyon, France Service Civique Temps plein

    En quelques mots... Tu as plus de 18 ans ? Tu as envie de t’impliquer auprès des gens de ton âge ? D’animer des interventions en festivals, soirées, collèges, lycées et universités ? Rejoins notre équipe ! Tu réaliseras des actions de prévention et réduction des risques sur la santé auprès d’un public jeune (12-25 ans)Votre mission de...

  • SAP Autorisations

    il y a 1 semaine


    Lyon, France RED Commerce - The Global SAP Solutions Provider Temps plein

    RED Global est à la recherche d'un consultant SAP Autorisation pour venir rejoindre les équipes de l'un de nos clients en Auvergne Rhône Alpes. **Compétences requises**: Expérience de 5 ans minimum sur SAP Expérience significative en termes de gestion des autorisations Expérience migration S/4 HANA idéalement car projet à venir Connaissance gestion...