INGENIEUR BIO-INFORMATIQUE EN RECHERCHE
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Ingénieur en Bio-informatique et en informatique
L’ingénieur(e) participera à l’organisation de la plateforme BIO2M. Il mettra en place les logiciels d’analyse pour le traitement des données de séquençage haut débit, assurera leur mise à jour et les développements informatiques pour automatiser les procédures avec le logiciel de gestion Snakemake et les logiciels de conception d'INDEX de données à grande échelle. Nous recrutons un ingénieur informaticien/bio-informaticien expérimenté pour les taches désignées.
- La personne sera également en charge de la gestion des données et participera aux formations qui seront développées pour les utilisateurs
- La personne sera en contact avec les demandeurs de prestations pour la conception de l'étude et le rendu de résultats
Les activités spécifiques liées au poste sont :
- la création d'index à partir de cohortes (données RNAseq ou Omics) fournies par les demandeurs d’un projet.
- L'utilisation et la conception de gestionnaire de workflow
- Le maintien et l'amélioration du site Web (TranSipedia)
Profil recherché
SAVOIR FAIRE REQUIS: Bioinformatique des traitements des données NGS
Compétences techniques
- Indexation de données et programmation
- Web développement
Compétences relationnelles
- Bonne relation pour communiquer avec demandeurs
- Contribution à l'organisation…
- Gestion des logiciels
- Compétences spécifiques liées au poste
- Bioinformatique : analyse NGS de RNAseq
- Indexation de données de séquençage haut-débit et Bonne compréhension des procédures et des outils d'analyse de données OMICS. Utilisation de l’outil Reindeer
- Bon relationnel pour communiquer avec les demandeurs de projets
- Savoir mettre en forme les résultats, gérer l'archivage, communiquer et partager les informations avec les personnes de l'équipe et les extérieurs CONNAISSANCES ASSOCIEES
- Connaissances biologiques de base (Biologie Moléculaire) (N1)
Master 2 bio-informatique, expérience professionnelle en bio-informatique
Bonnes connaissances en informatique (web, programmation python)
Double compétence en bio-informatique et informatique
Description de l'établissement
180 métiers, 1 sens commun.
Rejoignez une communauté de 12 000 professionnels qui, au quotidien, font battre le cœur du CHU de Montpellier Classé parmi les premiers hôpitaux français, le CHU de Montpellier est un acteur leader du soin, de la recherche, de l’enseignement et de la formation sur son territoire.
Intégrer nos équipes, c’est évoluer dans un environnement de pointe, et trouver du sens dans les valeurs du service public pour offrir à chacun, quelle que soit sa situation, les meilleurs soins.
191 Av. du Doyen Gaston Giraud, 34295 Montpellier, France
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Ingénieur en bio-informatique H/F
Il y a 13 heures
Montpellier, Occitanie, France IRD Temps pleinVos missions en quelques mots Une mission attractiveDans le cadre du PEPR Agroécologie et Numérique, ce projet offre une opportunité de recherche en génomique de l’adaptation et d’étude de l’évolution associé aux climats.Sous la responsabilité du directeur d’unité, votre mission sera de participer à comprendre l’adaptation des...
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INGENIEUR BIO-INFORMATIQUE/INFORMATIQUE
Il y a 17 heures
Montpellier, Occitanie, France CHU DE MONTPELLIER Temps plein 27 000 € - 33 000 € ContratACTIVITES PRINCIPALESL'ingénieur(e) participera à l'organisation de la plateforme BIO2M. Il mettra en place les logiciels d'analyse pour le traitement des données de séquençage haut débit, assurera leur mise à jour et les développements informatiques pour automatiser les procédures avec le logiciel de gestion (Snakemake) et les logiciels de...
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Ingénieur Bio-Informatique – Analyse Omics
Il y a 17 heures
Montpellier, Occitanie, France CHU DE MONTPELLIER Temps plein 27 000 € - 33 000 € ContratCHU DE MONTPELLIER recherche un ingénieur informaticien/bio-informaticien expérimenté pour rejoindre la plateforme BIO2M et piloter les analyses des données de séquençage haut débit. Vous assurerez la mise à jour des logiciels et développements automatisant les procédures avec Snakemake, ainsi que la gestion des données et les formations...
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Ingénieur Bio-Informatique NGS
Il y a 1 semaine
Montpellier, Occitanie, France CHU DE MONTPELLIER Temps pleinCHU de Montpellier recrute un ingénieur en bio-informatique et informatique pour soutenir la plateforme BIO2M. Vous déployez les logiciels d’analyse pour le traitement des données de séquençage haut débit, assurez les mises à jour et développez des procédures automatisées avec Snakemake et les outils OMICS.Vous codifiez, gérez les données et...
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Ingénieur de recherche
Il y a 4 jours
Montpellier, Occitanie, France YellowScan Temps plein 52 000 € - 76 000 € ContratLa société YellowScan conçoit, développe et produit des capteurs de cartographie pour les applications de drones professionnels. Entièrement intégrés, ultralégers et faciles à utiliser, ces capteurs hautement automatisés sont utilisés par les clients du monde entier dans diverses domaines : topographie, recherche environnementale, archéologie,...
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Ingénieur bio-médical
Il y a 7 jours
Montpellier, Occitanie, France RANDSTAD PROFESSIONAL Temps pleinOffre n° 214LMSXIngénieur bio-médical (F/H)Rattaché au Responsable R&D, vous êtes le référent technique et scientifique en hématologie au sein du département Recherche & Développement. Vous garantissez la pertinence biologique, la robustesse analytique et la conformité réglementaire des solutions
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Ingénieur Bio-médical Hématologie — R&D
Il y a 7 jours
Montpellier, Occitanie, France RANDSTAD PROFESSIONAL Temps pleinRandstad professional recherche un Ingénieur bio-médical (F/H) pour piloter l'expertise en hématologie au sein du département R&D à Montpellier. Vous garantissez la pertinence biologique et la conformité règlementaire des solutions développées, et guidez les investigations techniques jusqu’à la validation clinique.Rattaché au Responsable R&D,...
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ingénieur informatique Devops
Il y a 2 jours
Montpellier, Occitanie, France Avanista Temps pleinDepuis 2012, nous mettons notre expertise au service des secteurs de l?IT et l?Ingénierie pour accompagner nos clients dans des projets ambitieux et innovants.Faites défiler la page pour voir toutes les exigences du poste, ainsi que les responsabilités auxquelles les candidats retenus peuvent s'attendre.Notre force ? Un management de proximité qui...
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Technicien informatique mobile et tablette H/F
Il y a 2 jours
Montpellier, Occitanie, France Ingeliance Temps pleinÀ propos de INGELIANCE🚀 Faites décoller votre carrière : Bienvenue au sein du Groupe INGELIANCE !👋 Depuis plus de 25 ans, nous accompagnons nos clients dans l’étude et la réalisation de projets à forte technicité au travers de bureaux d’études (interne et sur site client), d’une offre de conseil et d’une cellule R&D. Avec une équipe...
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Ingénieur d'études SRA
Il y a 13 heures
Montpellier, Occitanie, France Ministère de la Culture Temps pleinVos missions en quelques mots Les ingénieurs d’études concourent à l’élaboration, à la mise au point et au développement des techniques scientifiques nouvelles ainsi qu’à l’amélioration de leurs résultats.Ils ont une mission générale de valorisation des résultats de la recherche et de diffusion de l’information scientifique et...