Ingénieur en bioinformatique pour le développement de bases de données et méthodes pangénomiques

il y a 2 semaines


Évry, Île-de-France CNRS Temps plein
Offre d'emploi : Ingénieur en bioinformatique

L'Institut Français de Bioinformatique (IFB) recherche un Ingénieur en bioinformatique pour rejoindre son équipe de développement de bases de données et méthodes pangénomiques. Le candidat idéal possèdera une solide expérience en développement de bases de données et méthodes bioinformatiques, ainsi qu'une bonne connaissance de la programmation en Python.

Responsabilités
  • Mettre en place une base de données de pangénomes de référence pour les espèces bactériennes d'intérêt clinique (ESKAPEE)
  • Participer au développement de méthodes associées pour l'analyse de génomes et métagénomes
  • Participer à l'intégration de la base de données et des méthodes dans la plateforme ABRomics
Compétences requises
  • Maîtrise de la programmation en Python
  • Connaissances en bases de données
  • Développement de workflows sur des clusters de calcul sous l'environnement Linux
  • Conception de bases de données
  • Développement d'API Web
  • Gestion de projets logiciels
Contexte

Le projet ABRomics vise à développer une plateforme numérique pour collecter, analyser, organiser et rendre accessibles les données de (méta)génomique des maladies infectieuses bactériennes et leurs métadonnées pour la recherche et la surveillance de la résistance aux antibiotiques.

La personne recrutée sera en interaction avec des chercheurs INRAE (unités MetaGenopolis et MaIAGE, Jouy-en-Josas) et participera aux groupes de travail de l'IFB et du projet ABRomics pertinents pour sa mission.



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