Phd Position F/m Development and Validation of Small-scale Models of Metabolite Production in Bacteria

Le descriptif de l’offre ci-dessous est en Anglais_

**Type de contrat**: CDD

**Niveau de diplôme exigé**: Bac + 5 ou équivalent

**Fonction**: Doctorant

**Niveau d'expérience souhaité**: Jeune diplômé

**A propos du centre ou de la direction fonctionnelle**:
The Centre Inria de l’Université de Grenoble groups together almost 600 people in 22 research teams and 7 research support departments.

Staff is present on three campuses in Grenoble, in close collaboration with other research and higher education institutions (Université Grenoble Alpes, CNRS, CEA, INRAE,), but also with key economic players in the area.

The Centre Inria de l’Université Grenoble Alpe is active in the fields of high-performance computing, verification and embedded systems, modeling of the environment at multiple levels, and data science and artificial intelligence. The center is a top-level scientific institute with an extensive network of international collaborations in Europe and the rest of the world.

**Contexte et atouts du poste**:
**Mission confiée**:
**Principales activités**:
The PhD project is an interdisciplinary project involving both the development of mathematical models describing the biological system and experimental work to calibrate and validate the models:

- Reduction of a medium-scale, kinetic model to a small-scale, whole-cell model of the production of 1,3-propanediol (1,3-PDO) by _Escherichia coli_, using previously developed reduction methods and taking inspiration from existing small-scale resource allocation models.
- Performance of experiments with selected _E. coli_ strains on an in-house mini-bioreactor platform to obtain data (growth, gene expression, metabolite concentrations) for the calibration of the model.
- Use a combination of optimization and simulation approaches to identify conditions maximizing 1,3-PDO production.
- Validation of the predicted optimal operating conditions by performing the corresponding mini-bioreactor experiments, including the quantification of 1,3-PDO production.

**Compétences**:
**Avantages**:

- Subsidized meals
- Partial reimbursement of public transport costs
- Leave: 7 weeks of annual leave + 10 extra days off due to RTT (statutory reduction in working hours) + possibility of exceptional leave (sick children, moving home, etc.)
- Possibility of teleworking and flexible organization of working hours
- Professional equipment available (videoconferencing, loan of computer equipment, etc.)
- Social, cultural and sports events and activities
- Access to vocational training
- Social security coverage

**Rémunération**:
2200 gross salary/month

**Informations générales**:

- **Thème/Domaine**: Modélisation et commande pour le vivant
Biologie et santé, Sciences de la vie et de la terre (BAP A)
- **Ville**: Montbonnot
- **Centre Inria**: Centre Inria de l'Université Grenoble Alpes
- **Date de prise de fonction souhaitée**: 2025-10-01
- **Durée de contrat**: 3 ans
- **Date limite pour postuler**: 2025-09-30

**Consignes pour postuler**:
**Sécurité défense**:
Ce poste est susceptible d’être affecté dans une zone à régime restrictif (ZRR), telle que définie dans le décret n°2011-1425 relatif à la protection du potentiel scientifique et technique de la nation (PPST). L’autorisation d’accès à une zone est délivrée par le chef d’établissement, après avis ministériel favorable, tel que défini dans l’arrêté du 03 juillet 2012, relatif à la PPST. Un avis ministériel défavorable pour un poste affecté dans une ZRR aurait pour conséquence l’annulation du recrutement.

**Politique de recrutement**:
Dans le cadre de sa politique diversité, tous les postes Inria sont accessibles aux personnes en situation de handicap.

**Contacts**:

- **Équipe Inria**: MICROCOSME
- **Directeur de thèse**:
**L'essentiel pour réussir**:
**A propos d'Inria**:
Inria est l’institut national de recherche dédié aux sciences et technologies du numérique. Il emploie 2600 personnes. Ses 215 équipes-projets agiles, en général communes avec des partenaires académiques, impliquent plus de 3900 scientifiques pour relever les défis du numérique, souvent à l’interface d’autres disciplines. L’institut fait appel à de nombreux talents dans plus d’une quarantaine de métiers différents. 900 personnels d’appui à la recherche et à l’innovation contribuent à faire émerger et grandir des projets scientifiques ou entrepreneuriaux qui impactent le monde. Inria travaille avec de nombreuses entreprises et a accompagné la création de plus de 200 start-up. L'institut s'efforce ainsi de répondre aux enjeux de la transformation numérique de la science, de la société et de l'économie.