Responsable du pôle de bio-informatique F/H
il y a 5 jours
Informations générales
Organisme de rattachement
Sorbonne Université– Services Universitaires
Référence
Date de début de diffusion
/01/2026
Date de parution
/01/2026
Localisation
Paris
Versant
Fonction Publique de l'Etat
Catégorie
Catégorie A (cadre)
Nature de l'emploi
Emploi ouvert uniquement aux contractuels
Domaine / Métier
Recherche - Responsable de partenariats, innovation et valorisation de la Recherche
Statut du poste
Vacant
Intitulé du poste
Responsable du pôle de bio-informatique F/H (réf
Descriptif de l'employeur
Choisir Sorbonne Université, c'est rejoindre une université engagée sur les enjeux de développement durable, de diversité, d'égalité, d'innovation, de diffusion des savoirs, d'ouverture sur le monde et de qualité de vie au travail de ses personnels.
Université pluridisciplinaire de recherche intensive de rang mondial, elle s'attache à répondre aux enjeux scientifiques du 21e siècle et à transmettre les connaissances issues de ses laboratoires et de ses équipes de recherche.
Déployant ses formations auprès de étudiantes et étudiants dont 4000 doctorantes et doctorants et 12300 étudiantes et étudiants étrangers, elle regroupe plus de 3300 enseignantes et enseignants, enseignantes-chercheuses et enseignants-chercheurs, chercheuses et chercheurs, près de 4 000 enseignants-chercheurs et enseignants partenaires, environ 3 000 personnels de bibliothèque, administratifs, technique, sociaux et de santé (BIATSS) et 2000 ITA partenaires. Son budget est de plus de 700 M€.
Située au cœur de Paris, elle présente une organisation avec des directions interfacultaires et trois facultés de « Lettres », « Santé » et « Sciences et Ingénierie » et est présente dans plus de 27 sites en Ile-de-France et en régions http://www.sorbonne-
Ce poste est à pourvoir au sein des Directions Interfacultaires
• http://www.sorbonne-
Descriptif du service
L'Unité Mixte de Service Biofonderie de l'Alliance Sorbonne Université a pour mission de mettre en place une offre de services technologiques, de partenariats et de formation de haut niveau en bio-ingénierie à destination des formations universitaires, des laboratoires académiques et des entreprises du secteur, avec l'ambition affichée de structurer la filière de l'ingénierie du vivant depuis son niveau fondamental jusqu'à ses applications technologiques. La BFASU est la première biofonderie académique en France, une plateforme robotisée de biologie de synthèse. Cette infrastructure d'excellence donne accès aux technologies de pointe nécessaires pour accélérer la recherche fondamentale, la recherche appliquée et translationnelle, le développement industriel et l'innovation. Ses activités sont centrées sur le clonage, le séquençage et le criblage phénotypique à haut débit mais également sur l'ingénierie métabolique et le développement de souches de bioproduction (circuits génétiques, enzymes, voie métaboliques artificielles,…) Cette unité multi-tutelles développe des activités partenariales académiques et industrielles sous la forme de prestations de service ou de projets collaboratifs.
Plus d'informations
Localisation : Campus Pierre et Marie Curie, Bâtiment B – 2ème étage, 4 place Jussieu 75005 Paris
Description du poste
Fonctions : Responsable du pôle de bio-informatique
Catégorie : A
Corps : IGR
BAP : A
CDD de 1 an, renouvelable.
A pourvoir à compter de mars 2026.
Mission :
Le/La responsable du pôle de bio-informatique de l'unité assure le développement et l'automatisation des workflows d'analyse de données omiques, la structuration des bases de données et des systèmes d'information, ainsi que l'implémentation et le développement des programmes informatiques associés aux plateformes automatisées de l'unité.
Activités principales :
Concevoir des workflows automatisés pour l'analyse de données ou le pilotage d'instrumentsConcevoir et élaborer la structure de bases de données et de systèmes d'information permettant de collecter, structurer, stocker et mettre en relation les donnéesGuider le déploiement de l'infrastructure informatique des plateformes de la BFASUDéfinir le plan d'étude et de recueil des données le mieux adapté au problème poséAnalyser des données de génomique (séquençage), protéomique et métabolomique (MS)Diffuser et valoriser les résultats sous forme de rapports techniques, de publications ou de présentations orales auprès des communautés professionnelles et scientifiquesGérer l'ensemble des moyens techniques alloués aux dispositifs de collecte et de traitement de donnéesFormer, en interne et en externe, aux principes et à la mise en œuvre des techniques de l'analyse des données biologiquesOrienter et conseiller les utilisateurs pour la mise en œuvre des méthodes d'études et d'interprétation des résultatsConduite de projets : Oui
Encadrement : Non
Descriptif du profil recherché
Connaissances transversales requises :
Connaissance théorique des différents types de protocoles expérimentaux biologiquesConnaissance approfondie des méthodes de recueil, d'analyse et de traitement des donnéesConnaissance solide en informatique : maîtrise des systèmes UNIX/LINUX, clusters de calculs, maîtrise d'un ou plusieurs langages de programmation, dont obligatoirement Python (Bash, C++, R, JavaScript, HTML, PHP, Java, PERL), maîtrise de la gestion des bases de données SQL et interfaces web (Apache, Django). Maîtrise de logiciels de gestion de version (Git, GitLabMaîtrise des problématiques liées aux Big DataConnaissance générale des approche d'IA/ML appliquées à l'ingénierie du vivantLangue anglaise : B2 à C1 (cadre européen commun de référence pour les langues)Savoir-faire :
Maîtrise des techniques principales d'analyse statistique de données scientifiques (paramétrique/non-paramétrique/bayésien)Savoir développer des outils de traitements automatisés de données biologiques pour les appliquer à des technologies de recherche en biologieRédiger des documents scientifiques et assurer une gestion des projets scientifiquesDévelopper une expertise scientifique et technologiqueEncadrer des étudiant-esGérer la confidentialité des projets (NDA, propriété intellectuelle, secret des affaires)Savoir-être :
Aptitude à s'inscrire dans des projets collectifs et goût du travail en équipeCapacité d'innovation et de créativité, d'initiative et autonomie dans le travailRigueur, organisation, méthodeDiplôme réglementaire souhaité :
DoctoratDomaine de formation souhaité : bioinformatiqueTemps plein
Oui
Informations complémentairesInformations complémentaires
CDD de 1 an, renouvelable.
A pourvoir à compter de mars 2026.
Toute candidature (CV et lettre de motivation) doit impérativement être envoyée sur :
https://jobs.sorbonne-
Localisation du poste
Europe, France, Île-de-France, Paris (75)
Géolocalisation du poste
4 place Jussieu, 75005 Paris
Lieu d'affectation (sans géolocalisation)
4 place Jussieu, 75005 Paris
Critères candidatNiveau d'études / Diplôme
Niveau 7 Master/diplômes équivalents
Documents à transmettre
L'envoi du CV et d'une lettre de motivation est obligatoire
Date de vacance de l'emploi
01/03/2026
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Paris 13e, France PathoQuest SAS Temps pleinStagiaire - Département Bio-informatique H/F PathoQuest est une société spécialisée de prestation de service (CRO), spin off de l’Institut Pasteur, qui propose des solutions innovantes pour le Contrôle Qualité des produits pharmaceutiques d’origine biologique. PathoQuest propose aux Biotech innovantes du monde entier un service expert complet de...
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