Ingénieur·e d'Étude en Bio-Informatique H/F

il y a 1 semaine

Paris, France AP-HP Temps plein

MétierAdministratif - Autres métiersType de contratCDD uniquementRémunérationSelon profilService d'affectationService de Médecine Intensive-Réanimation et Unité de recherche IAME Présentation du service · Service de Médecine Intensive-Réanimation, Hôpital Louis Mourier (AP-HP, Colombes) · Unité de recherche IAME (UMR 1137) - Équipe EvREST, Faculté de Médecine Bichat (Université Paris Cité / INSERM, Paris) Vos missions Missions principales: 1. Développement de pipelines bio-informatiques · Développer, optimiser et maintenir des workflows analytiques pour l'étude génomique de phages et de bactéries. · Annotation, identification des récepteurs et des systèmes de défense, typage et analyse comparative. 2. Analyse de données et modélisation · Réaliser des analyses statistiques inférentielles sur des jeux de données complexes. · Développer des modèles d'apprentissage automatique (random forest, régression, XGBoost). · Assurer la reproductibilité, la documentation et la traçabilité des analyses. 3. Intégration et gestion des données · Structurer, documenter et contrôler la qualité des jeux de données. · Participer aux rapports scientifiques et à la valorisation des résultats. 4. Interaction avec l'équipe expérimentale · Intégration des données issues de plaques assays et courbes de croissance. · Participation à la conception des méthodes expérimentales. Contexte scientifique Ce poste s'inscrit dans un projet de recherche visant à quantifier les déterminants moléculaires qui régissent les interactions phage-bactérie dans un contexte infectieux. Le projet explorera notamment : · les récepteurs bactériens aux bactériophages, · les protéines phagiques de liaison aux récepteurs (RBP), · les systèmes de défense bactériens, · les systèmes d'anti-défense phagiques, · l'influence de la régulation de l'expression génique sur les dynamiques d'interaction. L'objectif final est de développer des modèles prédictifs permettant d'estimer l'efficacité d'un phage lytique donné contre une souche bactérienne, à partir des seules données génomiques. Ce travail contribue directement au développement d'une approche de phagothérapie personnalisée. Profil recherché Profil recherché Formation: - Master 2 ou diplôme d'ingénieur en bioinformatique, génomique, biostatistiques, microbiologie computationnelle ou domaine associé. Compétences techniques: - Excellente maîtrise de Python et/ou R. - Bonne connaissance de Bash / Linux. - Maîtrise des outils bioinformatiques courants (assemblage, annotation, analyse comparative). - Bases solides en statistiques. - Connaissances en machine learning appréciées. Qualités personnelles: - Rigueur, autonomie, organisation. - Curiosité scientifique et esprit critique. - Capacité à travailler en équipe dans un environnement pluridisciplinaire. Schéma horaireJourTemps de travail7h30TélétravailNon Description de l'hôpitalSitué à Paris (10è arrondissement), l'hôpital Saint-Louis est reconnu au plan national et international en hématologie, dermatologie, cancérologie, infectiologie ainsi que dans le domaine des greffes d'organe et de moelle osseuse. Il possède également une expertise de haut niveau en chirurgie digestive, urologique et plastique. Il assure la prise en charge des grands brûlés en qualité de centre de recours régional.Référence de l'offre2

  • Ingénieur·e d'Étude en Bio-informatique F/H

    il y a 1 semaine

    Paris 18 Buttes-Montmartre, Île-de-France Ap-Hp Temps plein

    Informations générales Entité de rattachement du publieur Situé à Paris (10è arrondissement), l'hôpital Saint-Louis est reconnu au plan national et international en hématologie, dermatologie, cancérologie, infectiologie ainsi que dans le domaine des greffes d'organe et de moelle osseuse. Il possède également une expertise de haut niveau en...

  • Stagiaire - Département Bio-informatique (H/F)

    il y a 2 semaines

    Paris 13e, France PathoQuest SAS Temps plein

    Stagiaire - Département Bio-informatique H/F PathoQuest est une société spécialisée de prestation de service (CRO), spin off de l’Institut Pasteur, qui propose des solutions innovantes pour le Contrôle Qualité des produits pharmaceutiques d’origine biologique. PathoQuest propose aux Biotech innovantes du monde entier un service expert complet de...

  • Ingénieur Développement Logiciel Bio-informatique h/f

    il y a 1 semaine

    Paris, Île-de-France PathoQuest Temps plein

    PathoQuest est une société spécialisée de prestation de service (CRO), spin-out de l'Institut Pasteur, qui propose des solutions innovantes pour le Contrôle Qualité des produits pharmaceutiques d'origine biologique. PathoQuest propose aux Biotech innovantes du monde entier un service expert complet de la réception des échantillons à la production...

  • Ingénieur·e Fluides

    il y a 1 jour

    Paris, Île-de-France ELEMENTS INGENIERIES Temps plein

    Concerné·e par l'urgence climatique ? Rejoignez une équipe dynamique dans une entreprise à taille humaine Eléments Ingénieries, société d'ingénierie bioclimatique et fluides basée à Paris, est un acteur reconnu du domaine de la construction depuis 20 ans. Avec une équipe d'une quinzaine de personnes, nos métiers d'origine (modélisation physique...

  • Commercial Informatique

    il y a 6 jours

    Paris, France LSR INFORMATIQUE Temps plein

    LSR INFORMATIQUE : prestataire de services avec plusieurs pôles d’activités : Maintenance des équipements, fournisseur de matériel, Télécom [ ] Nous travaillons essentiellement avec les professionnels (B to B) et nos clients sont dans tous les secteurs d’activités. **Afin d’accompagner notre développement, nous renforçons l’équipe...

  • Ingénieur·e Technico-Commercial·e

    il y a 2 semaines

    Paris, France Cos2Biz Temps plein

    Le poste Dans un contexte de forte croissance, notre client recrute un·e Ingénieur·e Technico-Commercial·e H/F/X. Vous intégrez une équipe soudée, passionnée de technique, où la curiosité, la prise d'initiative et la force de proposition sont encouragées au quotidien. Votre rôle est avant tout celui d'un·e conseiller·e technique : - comprendre...

  • Ingénieur·e Technico-Commercial·e

    il y a 2 semaines

    Paris, France Cos2biz Temps plein

    Notre client est une start-up parisienne de pointe, véritable pépite technologique dans le domaine des systèmes batteries haute performance dédiés à la mobilité haut de gamme : aéronautique légère et fusées, nautisme, véhicules de course et applications d'exception. Son ADN ? La passion du produit, L'excellence technique, L'innovation utile, Et...

  • Ingénieur·e DevOps – CDI

    il y a 2 semaines

    Paris, France Blue Soft Temps plein

    Join to apply for the Ingénieur·e DevOps – CDI role at Blue Soft Contexte Nous croyons en la force du courant et en sa capacité à entraîner chacun, tout en respectant les différences. Le courant bleu symbolise notre volonté assumée de construire une entreprise ambitieuse et collective. Nos talents bleus s’unissent pour naviguer ensemble et vivre...

  • Data Scientist Bio-informatique

    il y a 2 semaines

    Paris, France ALTRAN Temps plein

    Vous avez **au moins 3 ans** d’expérience en **Data Science** avec un background en **bio-informatique** ? Nous recrutons des profils comme le vôtre ! Nous recherchons des profils multi-disciplinaires qui ont une expérience prouvée à la fois en bio-informatique et en Data Science, possédant notamment des compétences en **Nettoyage/Preprocessing et...

  • Ingénieur·e Technico-Commercial·e

    il y a 2 semaines

    Paris, France COS2BIZ Temps plein

    Notre client est une start-up parisienne de pointe, véritable pépite technologique dans le domaine des systèmes batteries haute performance dédiés à la mobilité haut de gamme : aéronautique légère et fusées, nautisme, véhicules de course et applications d'exception. Son ADN ? ? La passion du produit, ? L'excellence technique, ? L'innovation...