Ingénieur·e d'Étude en Bio-Informatique H/F
il y a 2 semaines
MétierAdministratif - Autres métiersType de contratCDD uniquementRémunérationSelon profilService d'affectationService de Médecine Intensive-Réanimation et Unité de recherche IAME Présentation du service · Service de Médecine Intensive-Réanimation, Hôpital Louis Mourier (AP-HP, Colombes) · Unité de recherche IAME (UMR 1137) - Équipe EvREST, Faculté de Médecine Bichat (Université Paris Cité / INSERM, Paris) Vos missions Missions principales: 1. Développement de pipelines bio-informatiques · Développer, optimiser et maintenir des workflows analytiques pour l'étude génomique de phages et de bactéries. · Annotation, identification des récepteurs et des systèmes de défense, typage et analyse comparative. 2. Analyse de données et modélisation · Réaliser des analyses statistiques inférentielles sur des jeux de données complexes. · Développer des modèles d'apprentissage automatique (random forest, régression, XGBoost). · Assurer la reproductibilité, la documentation et la traçabilité des analyses. 3. Intégration et gestion des données · Structurer, documenter et contrôler la qualité des jeux de données. · Participer aux rapports scientifiques et à la valorisation des résultats. 4. Interaction avec l'équipe expérimentale · Intégration des données issues de plaques assays et courbes de croissance. · Participation à la conception des méthodes expérimentales. Contexte scientifique Ce poste s'inscrit dans un projet de recherche visant à quantifier les déterminants moléculaires qui régissent les interactions phage-bactérie dans un contexte infectieux. Le projet explorera notamment : · les récepteurs bactériens aux bactériophages, · les protéines phagiques de liaison aux récepteurs (RBP), · les systèmes de défense bactériens, · les systèmes d'anti-défense phagiques, · l'influence de la régulation de l'expression génique sur les dynamiques d'interaction. L'objectif final est de développer des modèles prédictifs permettant d'estimer l'efficacité d'un phage lytique donné contre une souche bactérienne, à partir des seules données génomiques. Ce travail contribue directement au développement d'une approche de phagothérapie personnalisée. Profil recherché Profil recherché Formation: - Master 2 ou diplôme d'ingénieur en bioinformatique, génomique, biostatistiques, microbiologie computationnelle ou domaine associé. Compétences techniques: - Excellente maîtrise de Python et/ou R. - Bonne connaissance de Bash / Linux. - Maîtrise des outils bioinformatiques courants (assemblage, annotation, analyse comparative). - Bases solides en statistiques. - Connaissances en machine learning appréciées. Qualités personnelles: - Rigueur, autonomie, organisation. - Curiosité scientifique et esprit critique. - Capacité à travailler en équipe dans un environnement pluridisciplinaire. Schéma horaireJourTemps de travail7h30TélétravailNon Description de l'hôpitalSitué à Paris (10è arrondissement), l'hôpital Saint-Louis est reconnu au plan national et international en hématologie, dermatologie, cancérologie, infectiologie ainsi que dans le domaine des greffes d'organe et de moelle osseuse. Il possède également une expertise de haut niveau en chirurgie digestive, urologique et plastique. Il assure la prise en charge des grands brûlés en qualité de centre de recours régional.Référence de l'offre2
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Stagiaire - Département Bio-informatique (H/F)
il y a 6 jours
Paris 13e, France PathoQuest SAS Temps pleinStagiaire - Département Bio-informatique H/F PathoQuest est une société spécialisée de prestation de service (CRO), spin off de l’Institut Pasteur, qui propose des solutions innovantes pour le Contrôle Qualité des produits pharmaceutiques d’origine biologique. PathoQuest propose aux Biotech innovantes du monde entier un service expert complet de...
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Responsable Magasin Producteurs Bio
il y a 2 semaines
Paris, France Magasin Bio Temps plein**CONCEPT MAGASIN BIO, FRUITS ET LEGUMES ET DIRECT PRODUCTEURS à Paris 5ème et 14ème** **DESCRIPTIF DU POSTE** Missions principales: - Approvisionnement: définir les volumes d'achat et approvisionner le magasin en fonction de l'offre et de la saisonnalité des produits - Contrôler la qualité des produits réceptionnés. - Veiller à la qualité...
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Ingénieur Bio-Informatique H/F
il y a 2 jours
Paris, France Michael Page (France) Temps pleinIngénieur Bio-InformatiqueEntreprise dans la biotechnologie À propos de notre client Notre client est une société est un prestataire de services spécialisés dans le contrôle qualité de produits pharmaceutiques biologiques, issue d'un institut de recherche de renommée internationale. Elle propose aux entreprises biotechnologiques un service complet...
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INGÉNIEUR·E / CHARGÉ·E D'ÉTUDES AIR & DONNÉES ÉNERGÉTIQUES
il y a 2 jours
Paris, France Nam & Kouji Temps pleinIle-de-France – Dès que possibleQui sommes-nous ?Nam & Kouji, née en 2023 à Paris est une société à mission engagée pour un avenir durable. Notre ambition ? Réconcilier business et impact positif, accompagner les entreprises dans leur transformation environnementale et sociale, avec une approche à la fois experte, humaine et innovante.Nous sommes...
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Ingénieur Développement Logiciel Bio-informatique h/f
il y a 1 semaine
Paris, Île-de-France PathoQuest Temps pleinPathoQuest est une société spécialisée de prestation de service (CRO), spin-out de l'Institut Pasteur, qui propose des solutions innovantes pour le Contrôle Qualité des produits pharmaceutiques d'origine biologique. PathoQuest propose aux Biotech innovantes du monde entier un service expert complet de la réception des échantillons à la production...
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INGÉNIEUR·E / CHARGÉ·E D'ÉTUDES AIR & DONNÉES ÉNERGÉTIQUES
il y a 2 semaines
Paris, France Nam & Kouji Temps pleinIle-de-France – Dès que possible Qui sommes-nous ?Nam & Kouji, née en 2023 à Paris est une société à mission engagée pour un avenir durable. Notre ambition ? Réconcilier business et impact positif, accompagner les entreprises dans leur transformation environnementale et sociale, avec une approche à la fois experte, humaine et innovante.Nous sommes...
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Ingénieur Bio-Informatique H/F
il y a 3 semaines
Paris, France MICHAEL PAGE Temps pleinNotre client est une société est un prestataire de services spécialisés dans le contrôle qualité de produits pharmaceutiques biologiques, issue d'un institut de recherche de renommée internationale. Elle propose aux entreprises biotechnologiques un service complet allant de la réception des échantillons jusqu'à la délivrance des certificats...
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Ingénieur Bio-Informatique H/F
il y a 6 heures
Paris, France MICHAEL PAGE Temps pleinNotre client est une société est un prestataire de services spécialisés dans le contrôle qualité de produits pharmaceutiques biologiques, issue d'un institut de recherche de renommée internationale. Elle propose aux entreprises biotechnologiques un service complet allant de la réception des échantillons jusqu'à la délivrance des certificats...
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Responsable du pôle de bio-informatique F/H
il y a 1 semaine
Paris, Île-de-France Sorbonne Université Temps pleinInformations générales Organisme de rattachement Choisir Sorbonne Université, c'est rejoindre une université engagée sur les enjeux de développement durable, de diversité, d'égalité, d'innovation, de diffusion des savoirs, d'ouverture sur le monde et de qualité de vie au travail de ses personnels.Université pluridisciplinaire de recherche...
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Responsable du pôle de bio-informatique F/H
il y a 1 semaine
Paris, France SORBONNE UNIVERSITE Temps pleinChoisir Sorbonne Université, c'est rejoindre une université engagée sur les enjeux de développement durable, de diversité, d'égalité, d'innovation, de diffusion des savoirs, d'ouverture sur le monde et de qualité de vie au travail de ses personnels.Université pluridisciplinaire de recherche intensive de rang mondial, elle s'attache à répondre aux...
