CDD Post-Doctorant Autophagie Stress et Développement H/F

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions :
Les êtres vivants sont constamment soumis à des variations environnementales, telles que la température, qui peuvent induire un stress et entraîner des dysfonctionnements physiologiques. La mise en œuvre de stratégies préventives et/ou curatives pertinentes nécessite d’améliorer les connaissances sur la régulation des systèmes d’adaptation au stress, ainsi que de développer des stratégies diagnostiques intégrant les niveaux de réponse adaptative et les capacités de résilience des individus.
Les progrès technologiques en matière d’imagerie, de séquençage et d’analyse des données nous permettent d’étudier les réponses au stress et leurs effets sur l’adaptation chez des modèles animaux tels que le nématode C. elegans. Notre équipe a récemment mis au point un modèle de stress thermique aigu et non létal chez C. elegans afin de caractériser la réponse adaptative au niveau individuel (1, 2). Ce stress donne naissance à deux populations de vers présentant des caractéristiques distinctes en termes de croissance, de fertilité et de longévité (3).
Ce projet vise à identifier le réseau de régulation génétique et à caractériser les mécanismes sous-jacents à la variabilité individuelle dans l’adaptation au stress, ainsi que les effets qui en découlent sur la santé. S’appuyant principalement sur des analyses transcriptomiques chez C. elegans, notamment le séquençage d’ARN sur cellules uniques (single nucleus RNA-Seq), le projet combinera des travaux expérimentaux sur C. elegans et leur analyses bioinformatiques. Le chercheur postdoctoral bénéficiera des plateformes de séquençage et de bio-informatique de l’I2BC.

1) Chen, Y., Leboutet, R., Largeau, C., Zentout, S., Lefebvre, C., Delahodde, A., Culetto, E., & Legouis, R. (2021). Autophagy facilitates mitochondrial rebuilding after acute heat stress via a DRP-1-dependent process. The Journal of Cell Biology, 220(4), e201909139.
2) Serot, C., Scarcelli, V., Pouget, A., Largeau, C., Sagot, A., El-Hachami, K., ... & Legouis, R. (2025). Reticulon-dependent ER-phagy mediates adaptation to heat stress in C. elegans. Current Biology, 35(10), 2365-2378.
3) Serot, C., Kong, D., Largeau, C., Gallopin, M., Lescure, A., & Legouis, R. (In preparation). Analysis of the interindividual variability in response to heat stress identifies two subpopulations and a negative regulator of the autophagy flux in C. elegans.

Activités :
Le chercheur sera en charge de réaliser les expériences de stress thermique sur les souches de C. elegans (contrôles, mutantes et exprimant des marqueurs fluorescents). Il/Elle effectuera l’ensemble des analyses transcriptomiques (RT-qPCR, RNA-Seq, snRNA-Seq), de la préparation des échantillons à l’analyse bioinformatique des données. Il rédigera des documents de synthèses de l’avancement de ses travaux à destination du coordinateur du projet et présentera ses données en réunion d’équipe et au sein du consortium. Il est en charge de la veil
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Competences :
Nous recherchons des candidats très motivés possédant une solide expérience dans le domaine des analyses transcriptomiques globales et l’utilisation des outils informatiques spécifiques. Une expérience avec le modèle C. elegans constitue un atout important. Une autonomie importante sera demandée ainsi qu’une capacité à interagir avec des partenaires variés au sein de l’équipe, des plateformes technologiques et avec les collaborateurs externes. La maitrise de l’anglais est obligatoire.
Contraintes et risques :