ingenieur d'etudes en biologie computationelle
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Vos missions en quelques mots
Missions :
Nous avons développé RAPToR, un logiciel permettant de déduire avec précision la progression de l’âge d’un échantillon à partir de son expression génique (Bulteau et Francesconi, Nature Methods 2022). RAPToR se limite toutefois actuellement à déduire la progression le long d’une seule trajectoire. Nous souhaitons donc désormais étendre RAPToR afin de déduire la progression le long de multiples trajectoires ramifiées, que l’on observe généralement dans les systèmes en cours de différenciation. Cela nous permettra de comprendre l’impact des perturbations génétiques ou non génétiques sur un système en développement au niveau de la cellule unique.
Activités :
Vous serez amené(e) à :
- Intégrer plusieurs ensembles de données transcriptomiques dans des atlas transcriptomiques de référence exhaustifs pour divers organismes modèles.
- Analyser des données « -omiques » en appliquant des techniques avancées de modélisation multivariée et d'apprentissage automatique afin d'extraire des signatures d'expression génique interprétables.
- Implémenter RAPToR multi-trajectoire dans un logiciel
Contexte de travail :
Le laboratoire Melis se consacre à la compréhension des mécanismes moléculaires fondamentaux des systèmes vivants.
SPARK est une équipe pluridisciplinaire menant des axes de recherche variés. Ce poste s'inscrit dans le cadre d'un axe de recherche visant à développer et à utiliser des méthodes computationnelles pour extraire des informations phénotypiques interprétables et à plusieurs échelles à partir de données omiques à grande échelle, afin d'aborder des questions fondamentales sur la manière dont la régulation génique dans l'espace et dans le temps influe sur la variation phénotypique.
Pour plus d'informations, veuillez contacter mirko.francesconi@univ-lyon1.fr
Profil recherché
Competences :
- Compétences en programmation dans l'un des langages suivants : R, Matlab ou Python.
- Compétences en apprentissage automatique et en modélisation statistique avancée.
- Compétences en gestion de bases de données.
- Expérience avec un gestionnaire de pipelines (par exemple, Nextflow)
- Expérience dans l'analyse de données « -omiques »
- Bon niveau d'anglais
Contraintes et risques :
aucun
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
- Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)
Langues
- Français Seuil
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ingenieur d'etudes en biologie computationelle
Il y a 1 jour
Lyon, Auvergne-Rhône-Alpes, France Choisir le Service Public Temps plein 2 521 € CDDInformations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UMR5284-MIRFRA-001 Date de début de diffusion ...
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ingenieur d'etudes en biologie computationelle
Il y a 1 jour
Lyon, Rhône-Alpes, France Temps pleinDescription du Poste Les Missions Nous avons développé RAPToR, un logiciel permettant de déduire avec précision la progression de l’âge d’un échantillon à partir de son expression génique (Bulteau et Francesconi, Nature Methods 2022). RAPToR se limite toutefois actuellement à déduire la progression le long d’une seule trajectoire. Nous...
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Poste d'Assistant Ingénieur en Biologie
Il y a 3 jours
Lyon, Auvergne-Rhône-Alpes, France Choisir le Service Public Temps plein 2 302 € CDDInformations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UMR5261-FLASTR-006 Date de début de diffusion ...
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Lyon, Auvergne-Rhône-Alpes, France Ministères de la Santé, des Solidarités et du Travail Temps pleinVos missions en quelques mots Finalité du poste :Organiser et valider les contrôles biologiques réalisés en routine pour la libération de lots de vaccins et de médicaments dérivés du sang, et dans le cadre des analyses de surveillance de marché des médicaments issus des biotechnologies.Activités principales
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ALTERNANCE Bureau d'études
Il y a 4 heures
Lyon, Auvergne-Rhône-Alpes, France SUEZ Temps plein 8 € CDIType de contratAlternance QUI SOMMES-NOUS SUEZ Recyclage & Valorisation des déchets propose des solutions de gestion et de valorisation matière, énergétique et biologique de tous types de déchets pour produire de nouvelles ressources. Les équipes de cette activité contribuent à la collecte, au tri, au démantèlement,...
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Ingénieure / Ingénieur Ecologue Faune
Il y a 4 heures
Lyon, Auvergne-Rhône-Alpes, France Artelia Temps pleinDescription de l'entrepriseQui sommes-nous ?Nous sommes un groupe d'ingénierie, acteur majeur dans les domaines du bâtiment, de l’eau, de l’énergie, de l’industrie et de la mobilité.Détenu à 100% par nos salariés, nous sommes unis par une même passion, celle d’exercer un métier qui allie l’art de concevoir avec ingéniosité et de...
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Ingénieur / Ingénieure structure Confirmé / confirmée
Il y a 4 heures
Lyon, Auvergne-Rhône-Alpes, France Artelia Temps pleinDescription de l'entrepriseQui sommes-nous ?Nous sommes un groupe d'ingénierie, acteur majeur dans les domaines du bâtiment, de l’eau, de l’énergie, de l’industrie et de la mobilité.Détenu à 100% par nos salariés, nous sommes unis par une même passion, celle d’exercer un métier qui allie l’art de concevoir avec ingéniosité et de...
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H/F Ingénieur.e de recherche en génétique moléculaire végétale
Il y a 4 heures
Lyon, Auvergne-Rhône-Alpes, France CNRS Temps pleinVos missions en quelques mots Missions :L’ingenieur-e travaillera à caractériser la fonction de voies de perception et de dégradation de signaux hormonaux (auxine, cytokinine) impliquées dans le développement de l’architecture chez la mousse modèle Physcomitrium patens.Activités : L’ingenieur-e développera et utilisera des méthodes de...
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Lyon, Auvergne-Rhône-Alpes, France Choisir le Service Public Temps pleinInformations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UMR5667-JULPRA-035 Date de début de diffusion ...
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Directeur de Projets Traitement des Eaux
Il y a 4 heures
Lyon, Auvergne-Rhône-Alpes, France Agence Oriflam Temps plein 55 000 € - 70 000 € ContratPrésentation de la sociétéL'Agence Oriflam, cabinet de recrutement spécialisé dans les métiers de l'eau, recrute pour un bureau d'ingénierie reconnu intervenant sur les plus grands projets de traitement des eaux en France.La structure accompagne collectivités, syndicats et exploitants sur l'ensemble du cycle de vie des infrastructures : études...
