H/F Ingénieur.e de recherche en génétique moléculaire végétale

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions :
L’ingenieur-e travaillera à caractériser la fonction de voies de perception et de dégradation de signaux hormonaux (auxine, cytokinine) impliquées dans le développement de l’architecture chez la mousse modèle Physcomitrium patens.
Activités :
 L’ingenieur-e développera et utilisera des méthodes de biologie et génétique moléculaire (clonages, transformation génétique de plantes, génotypage) pour étudier les acteurs de voies de perception et de dégradation de signaux hormonaux, et leurs cibles. L’ingénieur·e développera et utilisera des méthodes de phénotypage des plantes (analyse morphologique des méristèmes, quantification des branches, suivi de la croissance sous différentes conditions hormonales). L’ingenieur-e développera et utilisera des méthodes d’imagerie quantitative sur tissus vivants avec suivi temporelle (time course) in planta avec un focus particulier sur les méristèmes de la mousse. L’ingénieur·e mettra en oeuvre des protocoles visant à la quantification des hormones in planta. L’ingénieur·e développera des protocoles et mettra en œuvre des expériences de bulk et single-cell RNA-seq, ainsi que des expériences d’Hybridization Chain Reaction (HCR) pour l’ancrage spatial des données transcriptomiques. Il/elle utilisera des logiciels standards et/ou développés au laboratoire (R, Python, Seurat, Imaris, FIJI) pour l’analyse d’image et des données de bulk/scRNA-seq. Il/elle participera à la conception d’expériences de mutagenèse à grande échelle (CRISPR/Cas9, UV) et les mettra en œuvre de façon autonome. Il/elle contribuera également à la rédaction de publications et rapports scientifiques.
Contexte de travail :
L’ingenieur-e travaillera au sein de l’équipe SIGNAL (« Signalisation et dynamique développementale) du Laboratoire Reproduction et Développement des Plantes (RPD, CNRS UMR 5667, Lyon), voir https://www.ens-lyon.fr/RDP/signalisation-et-dynamique-developpementale/

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Competences :
Excellente maitrise des concepts de biologie du développement des plantes ; solide expérience en biologie et génétique moléculaire ; solide expérience en culture in vitro des plantes ; bonne maitrise de l’imagerie photonique (transmission, confocale) et de l’analyse d’image ; bonne maitrise des outils informatiques permettant l’analyse de données RNA-seq ; autonomie de conception, d’exécution et d’analyse de résultats des expériences ; excellente capacité à s’intégrer et à travailler en équipe ; excellente capacité à présenter des résultats à l’écrit et à l’oral ; maitrise de l’anglais : lu, écrit, parlé.
Contraintes et risques :