Thèses Génomique évolutive Des Chromosomes

il y a 3 semaines

Montpellier, France CNRS Temps plein

Cette offre est disponible dans les langues suivantes:

- Français
- Anglais

Date Limite Candidature : vendredi 22 mars 2024

**Informations générales**:
**Intitulé de l'offre **:Thèses génomique évolutive des chromosomes sexuels (H/F)**
Référence : UMR5175-THOLEN-004
Nombre de Postes : 2
Lieu de travail : MONTPELLIER
Date de publication : vendredi 1 mars 2024
Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 1 octobre 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : La rémunération est d'un minimum de 2135,00 € mensuel
Section(s) CN : Biodiversité, évolution et adaptations biologiques : des macromolécules aux communautés

**Description du sujet de thèse**:
Analyses génomiques et approches théoriques pour comprendre l'évolution des chromosomes sexuels
Les chromosomes sexuels ont évolué indépendamment chez un grand nombre d'espèces et présentent des caractéristiques communes, notamment la suppression de la recombinaison, la dégénérescence et la compensation de dosage. Malgré une longue histoire d'études théoriques, on ne sait toujours pas comment et pourquoi ces caractéristiques évoluent. Les nouveaux modèles développés par notre équipe suggèrent un rôle important des changements de la régulation de l’expression des gènes au tout début de l’évolution des chromosomes sexuels. Ils suggèrent également de nouvelles façons d'analyser les données génomiques pour tester les différentes théories. Dans ce domaine en pleine évolution, il est crucial de documenter et d'examiner l'évolution précoce des très jeunes chromosomes sexuels.
Dans le cadre de ce projet de recherche, nous recherchons deux doctorants qui effectueront des tests de ces théories. Ces tests utiliseront des approches génomiques et théoriques intégratives pour élucider le mode d'évolution de chromosomes sexuels récents dans trois systèmes modèles : un néo-W chez Daphnia magna, ainsi que des strates de chromosomes sexuels ayant évolué indépendamment chez plusieurs espèces de Silène et d'Artémia. Chaque système présente des caractéristiques spécifiques intéressantes. Le modèle Daphnia porte sur un chromosome sexuel très récent qui a évolué sans dimorphisme sexuel obligatoire. Ce système a probablement moins de 20 000 ans. Le système Artemia permet d'étudier plusieurs strates récentes et indépendantes chez des espèces sexuées et chez des lignées asexuées qui leur sont apparentées. Le système Silene permet d’étudier des strates jeunes répliquées avec d'excellentes ressources génomiques. Il est prévu que les deux doctorants travaillent en collaboration sur plusieurs de ces modèles, mais chacun avec ses propres questions biologiques, dont les détails seront décidés en concertation avec les étudiants. Chaque sujet abordera donc des questions transversales tournant autour du test des théories pour les chromosomes sexuels, plutôt que de se concentrer chacun sur un seul système modèle. En fonction des intérêts de l'étudiant, les doctorats peuvent inclure des aspects théorique (génétique des populations multilocus) pour développer les modèles d'évolution des chromosomes sexuels disponibles actuellement.

(1) Enthousiasme et véritable curiosité pour la génétique évolutive, la génomique et la biologie évolutive.
(2) Diplôme de master dans le domaine de la biologie évolutive. Une expérience de la génomique et/ou de la génétique des populations et/ou de la théorie de l'évolution est souhaitable.
(3) Solides compétences quantitatives. Une expérience de la programmation ou de la bioinformatique est souhaitable.
(3) Solides compétences en communication orale et écrite en anglais (la langue de travail pour les sciences au CEFE est l'anglais).
(4) Capacité à travailler à la fois de manière indépendante et dans un environnement hautement collaboratif.
(5) Être bien organisé et très motivé.

**Contexte de travail**:
Les personnes recevront une formation complète en génomique évolutive de pointe et en génétique théorique des populations. Les personnes passeront la plupart de leur temps dans le groupe d'écologie génétique et évolutive (GEE) du Centre d'écologie fonctionnelle et évolutive (CEFE), un grand institut de recherche axé sur l'écologie et l'évolution situé à Montpellier, dans le sud de la France, avec d'éventuelles visites de partenaires du projet ailleurs en France. Montpellier est une ville étudiante animée avec un beau centre historique, située à environ 10 km de la mer Méditerranée. Ces doctorats font partie d'un projet ERC avancé ('RegEvol', Thomas Lenormand), qui aborde de nouvelles idées et prédictions théoriques sur le rôle de l'évolution des régulateurs de l’expression génétique pour plusieurs sujets fondamentaux importants en biologie évolutive (chromosomes sexuels, maintien du sexe, complexité des réseaux

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    Montpellier, France Université de Montpellier Temps plein

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  • Analyse Génomique Comparative Des Immunoglobulines

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    Montpellier, France Université de Montpellier Temps plein

    **Analyse génomique comparative des immunoglobulines chez les primates // Comparative genomic analysis of immunoglobulins in primates**: - Réf **ABG-122698** **ADUM-54674** - Sujet de Thèse- 11/04/2024- Contrat doctoral- Université de Montpellier- Lieu de travail- Montpellier CEDEX 5 - France- Intitulé du sujet- Analyse génomique comparative des...

  • Ki-67, Organisation de L'hétérochromatine, Et

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    Montpellier, France Université de Montpellier Temps plein

    **Ki-67, organisation de l'hétérochromatine, et développement embryonnaire // Role of the heterochromatin organising protein Ki-67 in female mouse development**: - Réf **ABG-122676** **ADUM-56130** - Sujet de Thèse- 11/04/2024- Contrat doctoral- Université de Montpellier- Lieu de travail- Montpellier cedex 5 - France- Intitulé du sujet- Ki-67,...

  • Thèse en Bioinformatique

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  • Post Doctorat en génomique des populations

    il y a 4 semaines

    Montpellier, France IRD Temps plein

    Génomes complets à faible couverture - Histoire démographique – associations génome/environnement La structure que vous allez rejoindre Vous serez affecté au Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (), à Montpellier. Le CBGP est composé de 86 agents permanents d'INRAE, de l'IRD, du Cirad et de l'Institut Agro Montpellier. Les...

  • H/F Doctorant

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    Montpellier, France CNRS Temps plein

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    Montpellier, France CNRS Temps plein

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    Montpellier, France Université de Montpellier Temps plein

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  • Chercheur.euse en Recombinaison Et Reproduction

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    Le Cirad (Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement) produit et transmet de nouvelles connaissances pour accompagner l'innovation et le développement agricole dans les pays du Sud avec ses partenaires. Il a pour objectif prioritaire de bâtir une agriculture durable des régions tropicales et méditerranéennes,...